прадукты

Секвенирование аднаядзернай РНК

Рэкамендаваны малюнак секвенирования аднаядзернай РНК

Прагрэс у захопе адной клеткі і тэхніцы стварэння індывідуальнай бібліятэкі ў спалучэнні з высокапрадукцыйным секвенаваннем дазваляе даследаваць экспрэсію генаў па клетках.Гэта забяспечвае больш глыбокі і поўны сістэмны аналіз складаных клетачных папуляцый, у якім ён у значнай ступені пазбягае маскіроўкі іх гетэрагеннасці шляхам сярэдняга значэння ўсіх клетак.

Аднак некаторыя клеткі непрыдатныя для стварэння аднаклетачнай суспензіі, таму неабходныя іншыя метады падрыхтоўкі ўзораў - экстракцыя ядра з тканіны, гэта значыць ядро непасрэдна экстрагуецца з тканіны або клеткі і рыхтуецца да одноядерной суспензіі для аднаго клеткі. секвенирование клетак.

BMK прадастаўляе паслугу секвенирования аднаклеткавай РНК 10× на базе Genomics ChromiumTM.Гэтая паслуга шырока выкарыстоўваецца ў даследаваннях, звязаных з захворваннямі, такімі як дыферэнцыяцыя імунных клетак, гетэрагеннасць пухлін, развіццё тканін і г.д.

Чып прасторавай транскрыпцыі: 10× Genomics

Платформа: платформа Illumina NovaSeq

Звяжыцеся з намі

Падрабязнасці абслугоўвання

Біяінфарматыка

Дэманстрацыйныя вынікі

Тэхнічны прынцып

Ізаляцыя ядраў дасягаецца з дапамогай 10× Genomics ChromiumTM, якая складаецца з васьміканальнай мікрафлюідычнай сістэмы з падвойнымі скрыжаваннямі.У гэтай сістэме шарыкі геля са штрых-кодамі і праймерам, ферменты і адно ядро інкапсулююцца ў кроплі алею памерам з наналітр, утвараючы гелевыя шарыкі ў эмульсіі (GEM).Пасля таго, як GEM сфарміраваны, лізіс клетак і вызваленне штрых-кодаў выконваюцца ў кожным GEM.мРНК адваротна транскрыбуюцца ў малекулы кДНК са штрых-кодамі 10× і UMI, якія ў далейшым падлягаюць канструкцыі стандартнай бібліятэкі секвенирования.

Тканіна не падыходзіць для падрыхтоўкі завісі асобных клетак

Клетка / Тканіна	Прычына
Несвежая замарожаная тканіна	Немагчыма атрымаць свежыя або даўно захаваныя арганізацыі
Цягліцавая клетка, мегакарыяцыт, тлушч…	Дыяметр ячэйкі занадта вялікі, каб увайсці ў прыбор
Печань…	Занадта далікатныя, каб разбіцца, не могуць адрозніць асобныя клеткі
Нейронавая клетка, мозг…	Больш адчувальны, лёгка стрэс, зменіць вынікі паслядоўнасці
Падстраўнікавая жалеза, шчытападобная жалеза…	Багаты эндагеннымі ферментамі, якія ўплываюць на выпрацоўку завісі асобных клетак

Аднаядзерны супраць аднаклеткавага

Аднаядзерныя	Аднаклетачны
Неабмежаваны дыяметр клеткі	Дыяметр клеткі: 10-40 мкм
Матэрыялам можа быць замарожаная тканіна	Матэрыялам павінна быць свежая тканіна
Нізкі стрэс замарожаных клетак	Апрацоўка ферментамі можа выклікаць стрэсавую рэакцыю клетак
Выдаляць эрытрацыты не трэба	Эрытрацыты неабходна выдаліць
Ядзерная выражае біяінфармацыю	Уся клетка выказвае біяінфармацыю

Спецыфікацыі абслугоўвання

Бібліятэка

Стратэгія паслядоўнасці

Аб'ём дадзеных

Узоры патрабаванняў

тканіна

10 × аднаядзерная бібліятэка Genomics

10x Genomics -Illumina PE150

Прыбл. 100 000 чытанняў/ячэйку.100-200 Гб

Нумар клеткі: >2 × 10⁵

Ячэйка канц.пры 700-1200 клетак/мкл

≥ 200 мг

Для атрымання больш падрабязнай інфармацыі аб інструкцыях па падрыхтоўцы ўзораў і працоўным працэсе абслугоўвання, калі ласка, не саромейцеся гаварыць з aBMKGENE эксперт