-
Метагеномнае секвенирование -NGS
Метагеном адносіцца да калекцыі агульнага генетычнага матэрыялу змешанай супольнасці арганізмаў, напрыклад, метагеном навакольнага асяроддзя, метагеном чалавека і г. д. Ён утрымлівае геномы як культываваных, так і некультывавальных мікраарганізмаў.Метагеномнае секвеніраванне - гэта малекулярны інструмент, які выкарыстоўваецца для аналізу змешаных геномных матэрыялаў, выцягнутых з узораў навакольнага асяроддзя, які дае падрабязную інфармацыю пра відавую разнастайнасць і колькасць, структуру папуляцыі, філагенетычныя адносіны, функцыянальныя гены і карэляцыйную сетку з фактарамі навакольнага асяроддзя.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Метагеномнае секвенирование-Нанапор
Метагеноміка - гэта малекулярны інструмент, які выкарыстоўваецца для аналізу змешаных геномных матэрыялаў, выцягнутых з узораў навакольнага асяроддзя, які дае падрабязную інфармацыю пра відавую разнастайнасць і колькасць, структуру папуляцыі, філагенетычныя ўзаемасувязі, функцыянальныя гены і карэляцыйную сетку з фактарамі навакольнага асяроддзя і г. д. Нядаўна былі прадстаўлены платформы секвенирования нанапор. да метагеномных даследаванняў.Яго выбітная прадукцыйнасць у даўжыні чытання значна палепшыла метагеномны аналіз у далейшым, асабліва зборку метагенома.Карыстаючыся перавагамі даўжыні чытання, метагеномнае даследаванне на аснове Nanopore можа дасягнуць больш бесперапыннай зборкі ў параўнанні з метагеномікай стрэльбы.Было апублікавана, што метагеноміка на аснове Nanopore паспяхова стварыла поўныя і закрытыя бактэрыяльныя геномы з мікрабіёмаў (Мос, Э.Л. і інш.,Біятэхналогія прыроды, 2020)
Платформа:Нанапор PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Субадзінка на 16S і 18S рРНК, якая змяшчае як высокакансерватыўныя, так і гіперварыябельныя вобласці, з'яўляецца ідэальным малекулярным адбіткам для ідэнтыфікацыі пракарыётычных і эукарыётычных арганізмаў.Выкарыстоўваючы перавагі секвенирования, гэтыя ампліконы можна нацэліць на аснове кансерватыўных частак, а гіперзменлівыя вобласці можна цалкам ахарактарызаваць для ідэнтыфікацыі мікробаў, што спрыяе даследаванням, якія ахопліваюць аналіз разнастайнасці мікробаў, сістэматыку, філагенію і г.д. Адна малекула ў рэжыме рэальнага часу (SMRT) ) секвенирование платформы PacBio дазваляе атрымліваць вельмі дакладныя доўгія чытанні, якія могуць ахопліваць поўнаметражныя ампліконы (прыблізна 1,5 Кб).Пашырэнне ўяўлення аб генетычным полі значна палепшыла раздзяляльнасць у анатацыях відаў у супольнасці бактэрый і грыбоў.
Платформа:Працяг PacBio II
-
16S/18S/ITS Ампліконнае секвенаванне-NGS
Секвеніраванне ампліконаў 16S/18S/ITS накіравана на выяўленне філагеніі, сістэматыкі і колькасці відаў у мікробнай супольнасці шляхам даследавання ПЦР-прадуктаў генетычных маркераў хатняга ўтрымання, якія ўтрымліваюць як высокаканверсійныя, так і гіперварыябельныя часткі.Прадстаўленне гэтых дасканалых малекулярных адбіткаў пальцаў Woeses і інш. (1977) дае магчымасць прафілявання мікрабіёма без ізаляцыі.Секвеніраванне 16S (бактэрыі), 18S (грыбы) і ўнутраны транскрыбаваны спейсер (ITS, грыбы) дазваляе ідэнтыфікаваць як распаўсюджаныя віды, так і рэдкія і неідэнтыфікаваныя віды.Гэтая тэхналогія стала шырока прымяняемым і асноўным інструментам для вызначэння дыферэнцыяльнага мікробнага складу ў розных асяроддзях, такіх як рот чалавека, кішачнік, фекаліі і г.д.
Платформа:Платформа Illumina NovaSeq
-
Паўторнае секвеніраванне поўнага геному бактэрый і грыбоў
Паўторнае секвеніраванне поўнага генома бактэрый і грыбоў з'яўляецца найважнейшым інструментам для завяршэння геномаў вядомых бактэрый і грыбоў, а таксама для параўнання некалькіх геномаў або нанясення на карту геномаў новых арганізмаў.Вельмі важна секвенировать цэлыя геномы бактэрый і грыбоў, каб стварыць дакладныя эталонныя геномы, правесці ідэнтыфікацыю мікробаў і іншыя параўнальныя даследаванні геному.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Секвеніраванне метатранскрыптому
Секвеніраванне метатранскрыптому ідэнтыфікуе экспрэсію генаў мікробаў (як эўкарыёт, так і пракарыёт) у натуральным асяроддзі (напрыклад, у глебе, вадзе, моры, фекаліях і кішачніку). У прыватнасці, гэтыя паслугі дазваляюць атрымаць профіль геннай экспрэсіі складаных мікробных супольнасцей, таксанамічны аналіз відаў, аналіз функцыянальнага ўзбагачэння генаў з рознай экспрэсіяй і інш.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Грыбковы геном
Biomarker Technologies забяспечвае агляд геному, тонкі геном і поўны геном грыбоў у залежнасці ад канкрэтнай мэты даследавання.Секвенирование геному, зборка і функцыянальная анатацыя могуць быць дасягнуты шляхам камбінавання секвенирования наступнага пакалення + секвенирования трэцяга пакалення для дасягнення зборкі геному высокага ўзроўню.Тэхналогія Hi-C таксама можа быць выкарыстана для палягчэння зборкі геному на ўзроўні храмасом.
Платформа:Працяг PacBio II
Нанапор PromethION P48
Платформа Illumina NovaSeq
-
Поўны геном бактэрый
Кампанія Biomarker Technologies прадастаўляе паслугі секвенирования па канструяванні поўнага геному бактэрый з нулявым разрывам.Асноўны працоўны працэс канструявання поўнага геному бактэрый уключае ў сябе секвеніраванне трэцяга пакалення, зборку, функцыянальную анатацыю і пашыраны біяінфарматычны аналіз для дасягнення канкрэтных мэт даследавання.Больш поўнае прафіляванне геному бактэрый дазваляе выявіць фундаментальныя механізмы, якія ляжаць у аснове іх біялагічных працэсаў, што таксама можа стаць каштоўнай даведкай для геномных даследаванняў вышэйшых эўкарыятычных відаў
Платформа:Nanopore PromethION P48 + платформа Illumina NovaSeq
Працяг PacBio II
