-
PacBio-поўнафарматнае 16S/18S/ITS ампліконнае секвенаванне
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) распрацавана з улікам шматгадовага вопыту ў аналізе праектаў мікробнай разнастайнасці, якая змяшчае стандартызаваны базавы аналіз і персаналізаваны аналіз: базавы аналіз ахоплівае асноўны змест аналізу бягучых мікробных даследаванняў, змест аналізу багаты і поўны, і вынікі аналізу прадстаўляюцца ў выглядзе справаздач аб праекце;Змест персаналізаванага аналізу разнастайны.Можна адбіраць узоры і гнутка ўсталёўваць параметры ў адпаведнасці са справаздачай аб базавым аналізе і мэтамі даследавання, каб рэалізаваць персанальныя патрабаванні.Аперацыйная сістэма Windows, простая і хуткая.
-
PacBio-поўнаметражны транскрыптом (без спасылкі)
Прымаючы дадзеныя секвенирования ізаформ Pacific Biosciences (PacBio) у якасці ўваходных дадзеных, гэта дадатак можа ідэнтыфікаваць поўнаметражныя паслядоўнасці транскрыптаў (без зборкі).Шляхам супастаўлення поўнаметражных паслядоўнасцей з эталонным геномам транскрыпты можна аптымізаваць з дапамогай вядомых генаў, транскрыптаў, кадавальных абласцей і г. д. У гэтым выпадку можна дасягнуць больш дакладнай ідэнтыфікацыі структур мРНК, напрыклад, альтэрнатыўнага сплайсінгу і г. д.Сумесны аналіз з дадзенымі секвеніравання транскрыптомаў NGS забяспечвае больш поўную анатацыю і больш дакладную колькасную ацэнку экспрэсіі на ўзроўні стэнаграмы, што ў значнай ступені прыносіць карысць дыферэнцыяльнай экспрэсіі і функцыянальнаму аналізу.
-
Наборы інструментаў
BMKCloud з'яўляецца вядучай біяінфарматычнай платформай, якая забяспечвае комплекснае рашэнне для геномных праграм, якой шырока давяраюць даследчыкі ў розных сферах, уключаючы медыцыну, сельскую гаспадарку, прыродаахоўнае і г.д. BMKCloud імкнецца прадастаўляць комплексныя, надзейныя і эфектыўныя паслугі, уключаючы платформы і інструменты біяінфарматычнага аналізу , вылічальныя рэсурсы, агульнадаступная база дадзеных, біяінфарматычныя онлайн-курсы і г.д. BMKCloud мае розныя часта выкарыстоўваюцца біяінфарматычныя інструменты, у тым ліку генныя анатацыі, эвалюцыйныя генетычныя інструменты, ncRNA, кантроль якасці даных, зборку, выраўноўванне, выманне даных, мутацыі, статыстыку, генератар лічбаў, паслядоўнасць аналіз і інш.
-
малая РНК
Малыя РНК - гэта тып кароткіх некадзіруючых РНК з сярэдняй даўжынёй 18-30 нт, у тым ліку мікраРНК, міРНК і піРНК.Шмат паведамлялася, што гэтыя малыя РНК удзельнічаюць у розных біялагічных працэсах, такіх як дэградацыя мРНК, інгібіраванне трансляцыі, утварэнне гетерохроматина і г.д. Аналіз паслядоўнасці малых РНК шырока выкарыстоўваецца ў даследаваннях развіцця жывёл/раслін, хвароб, вірусаў і г.д. Малыя РНК платформа аналізу паслядоўнасці складаецца са стандартнага аналізу і пашыранага аналізу дадзеных.На аснове дадзеных РНК-seq стандартны аналіз можа дасягнуць ідэнтыфікацыі і прагназавання мікраРНК, прагназавання мэтавага гена мікраРНК, аналізу анатацый і экспрэсіі.Пашыраны аналіз дазваляе наладжваць пошук і вылучэнне мікраРНК, стварэнне дыяграм Венна, стварэнне сеткі мікраРНК і мэтавых генаў.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS - гэта платформа аналізу паўторнага секвенирования цэлага геному, якая распрацавана на аснове багатага вопыту ў Biomarker Technologies.Гэтая простая ў выкарыстанні платформа дазваляе хутка прадставіць інтэграваны працоўны працэс аналізу, проста ўсталяваўшы некалькі асноўных параметраў, якія падыходзяць для дадзеных секвенирования ДНК, атрыманых як з платформы Illumina, так і з платформы секвенирования BGI.Гэтая платформа разгорнута на высокапрадукцыйным вылічальным серверы, які забяспечвае высокаэфектыўны аналіз даных за вельмі абмежаваны час.Персаналізаваны аналіз дадзеных даступны на аснове стандартнага аналізу, у тым ліку запыту мутаваных генаў, распрацоўкі праймераў ПЦР і г.д.
-
мРНК (спасылка)
Транскрыптом - гэта сувязь паміж геномнай генетычнай інфармацыяй і пратэомам біялагічнай функцыі.Рэгуляцыя ўзроўню транскрыпцыі - найбольш важны і найбольш шырока вывучаны спосаб рэгуляцыі арганізмаў.Секвеніраванне транскрыптому можа секвенаваць транскрыптом у любы момант часу і пры любых умовах з дакладнасцю да аднаго нуклеатыду. Ён можа дынамічна адлюстроўваць узровень транскрыпцыі гена, адначасова ідэнтыфікаваць і колькасна ацэньваць рэдкія і нармальныя транскрыпты і прадастаўляць структурную інфармацыю ўзоры канкрэтных стэнаграм.
У цяперашні час тэхналогія секвеніравання транскрыптомаў шырока выкарыстоўваецца ў аграноміі, медыцыне і іншых галінах даследаванняў, уключаючы рэгуляванне развіцця жывёл і раслін, адаптацыю да навакольнага асяроддзя, імуннае ўзаемадзеянне, лакалізацыю генаў, генетычную эвалюцыю відаў і выяўленне пухлін і генетычных захворванняў.
-
Метагеноміка (NGS)
Гэтая аналітычная платформа прызначана для аналізу метагеномных даных стрэльбы на аснове шматгадовага вопыту.Ён складаецца з інтэграванага працоўнага працэсу, які змяшчае розныя часта неабходныя аналізы метагеномікі, уключаючы апрацоўку даных, даследаванні на ўзроўні відаў, даследаванні на ўзроўні функцыянавання генаў, злучэнне метагеномаў і г.д. Акрамя таго, індывідуальныя інструменты інтэлектуальнага аналізу даступныя ў стандартным працоўным працэсе аналізу, уключаючы запыт генаў і відаў , налада параметраў, стварэнне персанальнай фігуры і г.д.
-
LncRNA
Доўгія некадуючыя РНК (lncRNA) - гэта тып транскрыптаў даўжынёй больш за 200 нт, якія не здольныя кадаваць вавёркі.Назапашаныя дадзеныя сведчаць аб тым, што большасць lncRNA, верагодна, функцыянальныя.Высокапрадукцыйныя тэхналогіі секвеніравання і інструменты біяінфарматычнага аналізу даюць нам магчымасць больш эфектыўна выяўляць паслядоўнасці lncRNA і інфармацыю аб пазіцыянаванні і вядуць нас да адкрыцця lncRNA з важнымі рэгулятарнымі функцыямі.BMKCloud з гонарам прапануе нашым кліентам платформу аналізу паслядоўнасці lncRNA для дасягнення хуткага, надзейнага і гнуткага аналізу lncRNA.
-
GWAS
Агульнагеномнае даследаванне асацыяцый (GWAS) накіравана на выяўленне генетычных варыянтаў (генатыпу), звязаных з пэўнымі прыкметамі (фенатыпам).Даследаванні GWA даследуюць генетычныя маркеры, якія перасякаюць увесь геном вялікай колькасці асобін, і прагназуюць асацыяцыі генатыпу і фенатыпу шляхам статыстычнага аналізу на ўзроўні папуляцыі.Рэсеквенаванне поўнага геному патэнцыйна можа выявіць усе генетычныя варыянты.У спалучэнні з фенатыпічнымі дадзенымі GWAS можа быць апрацаваны для ідэнтыфікацыі звязаных з фенатыпам SNP, QTL і генаў-кандыдатаў, што моцна падтрымлівае сучасную селекцыю жывёл/раслін.SLAF - гэта самастойна распрацаваная спрошчаная стратэгія секвенирования геному, якая выяўляе размеркаваныя па ўсім геному маркеры, SNP.Гэтыя SNP, як малекулярна-генетычныя маркеры, могуць быць апрацаваны для даследаванняў асацыяцыі з мэтавымі прыкметамі.Гэта эканамічна эфектыўная стратэгія ў выяўленні складаных прыкмет, звязаных з генетычнымі варыяцыямі.
-
Поўнаметражная транскрыптаміка Nanopore
Складаныя і зменлівыя альтэрнатыўныя ізаформы ў арганізмах з'яўляюцца важнымі генетычнымі механізмамі для рэгуляцыі экспрэсіі генаў і разнастайнасці бялку.Дакладная ідэнтыфікацыя структур транскрыптаў з'яўляецца асновай для паглыбленага вывучэння патэрнаў рэгуляцыі геннай экспрэсіі.Платформа секвенирования Nanopore паспяхова перавяла даследаванне транскрыптамы на ўзровень ізаформы.Гэтая аналітычная платформа распрацавана для аналізу даных RNA-Seq, атрыманых на платформе Nanopore на аснове эталоннага геному, што забяспечвае якасны і колькасны аналіз як на ўзроўні генаў, так і на ўзроўні транскрыптаў.
-
цыр-РНК
Кальцавая РНК (circRNA) - гэта тып некадзіруючай РНК, якая, як нядаўна было ўстаноўлена, адыгрывае важную ролю ў рэгулятарных сетках, якія ўдзельнічаюць у развіцці, устойлівасці навакольнага асяроддзя і г.д. У адрозненне ад лінейных малекул РНК, напрыклад мРНК, lncRNA, 3' і 5' канцы circRNA злучаюцца разам, утвараючы круглую структуру, якая пазбаўляе іх ад расшчаплення экзануклеазай і з'яўляецца больш стабільнай, чым большасць лінейных РНК.Было ўстаноўлена, што CircRNA выконвае розныя функцыі ў рэгуляцыі экспрэсіі генаў.CircRNA можа працаваць як ceRNA, якая канкурэнтна звязвае мікраРНК, вядомую як губка мікраРНК.Платформа аналізу паслядоўнасці CircRNA дае магчымасць аналізу структуры і экспрэсіі circRNA, прагназавання мэты і сумеснага аналізу з іншымі тыпамі малекул РНК
-
БСА
Платформа Bulked Segregant Analysis складаецца з аднаэтапнага стандартнага аналізу і пашыранага аналізу з індывідуальнай наладай параметраў.BSA - гэта метад, які выкарыстоўваецца для хуткай ідэнтыфікацыі генетычных маркераў, звязаных з фенатыпам.Асноўны працоўны працэс BSA змяшчае: 1. выбар дзвюх груп асобін з вельмі супрацьлеглымі фенатыпамі;2. аб'яднанне ДНК, РНК або SLAF-seq (распрацавана Biomarker) усіх асобін для фарміравання двух аб'ёмаў ДНК;3. ідэнтыфікацыя дыферэнцыяльных паслядоўнасцей супраць эталоннага геному або паміж імі, 4. прагназаванне звязаных рэгіёнаў-кандыдатаў з дапамогай алгарытму ED і SNP-індэксу;5. Функцыянальны аналіз і ўзбагачэнне генаў у рэгіёнах-кандыдатах і г. д. Таксама даступны больш прасунуты аналіз дадзеных, уключаючы скрынінг генетычных маркераў і дызайн праймераў.
