Прымаючы ў якасці ўваходных дадзеных секвеніраванне ізаформ Pacific Biosciences (PacBio), гэта дадатак можа ідэнтыфікаваць поўнаметражныя паслядоўнасці транскрыптаў (без зборкі).Шляхам супастаўлення поўнаметражных паслядоўнасцей з эталонным геномам транскрыпты можна аптымізаваць з дапамогай вядомых генаў, транскрыптаў, кадзіруючых абласцей і г. д. У гэтым выпадку можа быць дасягнута больш дакладная ідэнтыфікацыя структур мРНК, напрыклад, альтэрнатыўны сплайсінг і г. д.Сумесны аналіз з дадзенымі секвеніравання транскрыптомаў NGS забяспечвае больш поўную анатацыю і больш дакладную колькасную ацэнку экспрэсіі на ўзроўні стэнаграмы, што ў значнай ступені прыносіць карысць дыферэнцыяльнай экспрэсіі і функцыянальнаму аналізу.