Асноўныя моманты
Для нас вялікі гонар запрасіць на гэты двухгадзінны вэб-семінар шэсць экспертаў у галіне геномікі сельскагаспадарчых культур.Нашы спікеры дадуць глыбокую інтэрпрэтацыю двух геномных даследаванняў Rye, якія толькі што былі апублікаваны наГенетыка прыроды:
1. Зборка геному ў храмасомным маштабе дазваляе зразумець біялогію, эвалюцыю і агранамічны патэнцыял жыта
2. Высакаякасная зборка геному падкрэслівае геномныя характарыстыкі жыта і важныя ў аграноміі гены
Акрамя таго, мы рады, што старшы навуковы супрацоўнік Biomarker Technologies падзяліўся сваім вопытам зборкі геному de novo.
Парадак дня
09:00 CET
Прывітальныя словы
Чжэн Хун-кун
Заснавальнік і генеральны дырэктар Biomarker Technologies
Дэн Сін-ван
Прэзідэнт Школы перадавых сельскагаспадарчых навук Пекінскага ўніверсітэта
09:15 раніцы
Павышэнне паляпшэння жыта, трыцікале і пшаніцы за кошт выкарыстання высакаякаснай эталоннай паслядоўнасці геному
На гэтым вэбінары прафесар Ван даў нам агульную інфармацыю аб бягучым стане геномных даследаванняў трыцэй і прадэманстраваў поспех і прарыў дзвюх выдатных работ па вывучэнні геному жыта, якія былі нядаўна апублікаваны на Nature Genetics і прадстаўляюць усе даследаванні групы, якія вядуць і ўкладаюць у прац.
09:25 раніцы
Геноміка збожжавых @ IPK Gatersleben
Збожжавыя травы племя Triticeae былі асноўнай крыніцай ежы ва ўмераных рэгіёнах, якія доўгі час лічыліся гарачай кропкай паляпшэння ўраджаю і селекцыі.Сярод усіх культывуемых відаў гэта племя славіцца сваімі надзвычай складанымі геномнымі асаблівасцямі, уключаючы вялікія памеры геному, высокае ўтрыманне TE, паліплаідыю і г. д. На гэтай сесіі прафесар Нільс Штайн даў нам агульнае ўвядзенне ў IPK Gatersleben і сучасны стан збожжавых. геномныя даследаванні@IPK Gatersleben.
09:35 раніцы
Зборка геному ў храмасомным маштабе дазваляе зразумець біялогію, эвалюцыю і агранамічны патэнцыял жыта
Доктар М. Цімаці Рабанус-Уоллес, Інстытут генетыкі раслін і планаў раслінаводства імя Лейбніца (IPK)Жыта (Secale cereale L.) - гэта выключна ўстойлівая да клімату збожжавая культура, якая шырока выкарыстоўваецца для атрымання палепшаных гатункаў пшаніцы шляхам інтрагрэсіўнай гібрыдызацыі і валодае поўным наборам генаў, неабходных для селекцыі гібрыдаў.Жыта з'яўляецца аллагамным і толькі нядаўна прыручылі, што дае культурнаму жыту доступ да разнастайнага і прыгоднага для выкарыстання дзікага генафонду.Для далейшага павышэння агранамічнага патэнцыялу жыта мы стварылі анатаваную зборку геному жыта памерам 7,9 Mbp у храмасомным маштабе і шырока пацвердзілі яго якасць з выкарыстаннем набору малекулярна-генетычных рэсурсаў.Мы дэманструем прымяненне гэтага рэсурсу ў шырокім дыяпазоне даследаванняў.Мы прадстаўляем высновы аб няпоўнай генетычнай ізаляцыі культурнага жыта ад дзікіх суродзічаў, механізмах структурнай эвалюцыі геному, устойлівасці да патагенаў, талерантнасці да нізкіх тэмператур, сістэмах кантролю пладавітасці для гібрыднай селекцыі і перавагах ураджайнасці інтрагрэсіі жыта і пшаніцы.
10:05 раніцы
Высакаякасная зборка геному падкрэслівае геномныя характарыстыкі жыта і важныя з аграномічнага пункту гледжання гены
Жыта з'яўляецца каштоўнай харчовай і кармавой культурай, важным генетычным рэсурсам для паляпшэння пшаніцы і трыцікале, незаменным матэрыялам для эфектыўных параўнальных геномных даследаванняў траў.Тут мы секвенировали геном жыта Weining, элітнага кітайскага гатунку жыта.Сабраныя кантыгі (7,74 Гб) складаюць 98,47% меркаванага памеру геному (7,86 Гб), прычым 93,67% кантыгаў (7,25 Гб) прыпадае на сем храмасом.Паўтаральныя элементы складалі 90,31% сабранага геному.У параўнанні з раней секвенированными геномамі Triticeae, рэтратранспазоны Daniela, Sumaya і Sumana паказалі моцнае пашырэнне ў жыце.Далейшы аналіз зборкі Вейнінга пралівае новае святло на паўсюднагеномныя дуплікацыі генаў і іх уплыў на гены біясінтэзу крухмалу, фізічную арганізацыю складаных праламінавых локусаў, асаблівасці экспрэсіі генаў, якія ляжаць у аснове ранняй прыкметы загалоўка, і меркаваныя храмасомныя вобласці і локусы, звязаныя з прыручэннем.Гэтая паслядоўнасць геному абяцае паскорыць даследаванні геномікі і селекцыі жыта і звязаных з ім збожжавых культур.
10:35 раніцы
Праблемы, рашэнні і будучыня зборкі геному de novo
Геном высокай якасці - аснова геномных даследаванняў.Нягледзячы на тое, што хуткае развіццё секвенирования і алгарытмаў дазволіла значна прасцей і больш эфектыўна складаць геному, патрабаванні да дакладнасці і паўнаце зборкі таксама растуць з паглыбленнем мэт даследаванняў.У гэтым выступе я абмяркую сучасныя папулярныя тэхналогіі зборкі геному з некалькімі паспяховымі кейсамі і зірну на будучае развіццё.
Час публікацыі: 8 студзеня 2022 г