МІКРОБНАЯ
Бактэрыяльная сумяшчальнасць і імабілізацыя з дапамогай біявугля палепшыла дэградацыю тебуконазола, склад і функцыянаванне мікрабіёма глебы
Поўнаметражнае секвеніраванне ампліконаў 16S |PacBio HiFi |Альфа-разнастайнасць |Бэта-разнастайнасць
У гэтым даследаванні поўнаметражнае секвенирование ампликона 16S з дапамогай PacBio і біяінфарматычны аналіз былі прадастаўлены Biomarker Technologies.
Асноўныя моманты
Бактэрыі Alcaligenes faecalis WZ-2, імабілізаваныя Biochar, якія раскладаюць тэбуканазол, вывучалі эфектыўнасць біяраскладання і ўплыў на забруджаную тебуканазолам глебу ў параўнанні са штамам WZ-2, які свабодна раскладаецца.
1. Імабілізаваны біявуглям WZ-2 паказаў больш эфектыўную дэградацыю тебуконазола ў параўнанні са свабодным WZ-2 за кошт скарачэння перыяду паўраспаду тебуконазола ў глебе з 18,7 дзён да 13,3 дзён.
2. WZ-2, імабілізаваны біявуглям, змог аднавіць актыўнасць натуральных глебавых мікробных ферментаў, уключаючы урэазу, дэгідрагеназу і інвертазу і г.д.
3. Мікробны профіль у глебе, апрацаванай WZ-2, апрацаванай біявуглям, вызначаны з дапамогай поўнаметражнага секвеніравання 16S, пераканаўча пацвярджае, што гэтая сістэма можа аднавіць здароўе глебы шляхам паляпшэння структуры бактэрыяльнай супольнасці пры забруджванні тебуканазолам.
Эксперымент (звязаны з паслядоўнасцю)
Групоўка: CK: натуральная глеба;T: Глеба, падабраная тебуканазолам;S: Тэбуканазол змяшчаецца ў глебе са свабодным штамам WZ-2;да н.э.: глеба з тэбуканазолам з біявуглям;BCS: глеба, якая змяшчае тэбуканазол з імабілізаваным біявуглям WZ-2.
Адбор проб: агульная экстракцыя глебавай ДНК, узмоцненая праймерамі 16S рДНК
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) і 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),які прадстаўляе поўнаметражную 16S рДНК
Платформа секвенирования: PacBio RS II
Стратэгія паслядоўнасці: CCS HIFI чытае
Аналіз дадзеных:BMKCloudБіяінфарматычная платформа робіць залатую рыбку выдатнай сістэмай генетычнай мадэлі для фізіялогіі і эвалюцыі рыб.
Вынік
Структура мікробнага супольнасці глебы была вызначана шляхам секвенирования 16S рДНК.Багацце OTU і індэкс альфа-разнастайнасці, уключаючы індэксы Chao1, Ace, Shannon і Simpson, былі ацэнены, каб выявіць відавую разнастайнасць у кожнай сістэме.Пасля 60 дзён інкубацыі ўсе паказчыкі паказалі аднолькавую тэндэнцыю, г.зн. тебуканазол можа выклікаць памяншэнне багацця відаў і разнастайнасці глебы.Аднак, дадаўшы штам WZ-2, супольнасць глебавых бактэрый была часткова адноўлена з пункту гледжання багацця і разнастайнасці.Абмежаваная розніца назіралася паміж BC, BCS і CK, што паказвае на тое, што біявугаль і імабілізаваны біявуглям WZ-2 могуць эфектыўна аднаўляць біялагічнае здароўе глебы.
Неўзважаны парна-групавы метад з сярэднімі арыфметычнымі (UPGMA) быў ужыты ў гэтым даследаванні, каб паказаць бэта-разнастайнасць паміж групамі.Як паказана на наступным малюнку, BC, BSC і CK маюць больш падобны характар мікробнага складу ў параўнанні з групамі T і S, што дадаткова паказвае на тое, што ўвядзенне біявугля ў забруджаную тэбуканазолам глебу можа ў значнай ступені палегчыць аднаўленне мікробнай супольнасці ў глебе.
Малюнак.Кластэрызацыя бактэрыяльнай супольнасці UPGMA на ўзроўні тыпу пры рознай апрацоўцы
Даведка
Сун, Тонг і інш.«Бактэрыяльная сумяшчальнасць і абезрухоўліванне з дапамогай биоугля палепшылі дэградацыю тебуконазола, склад і функцыянаванне мікрабіёма глебы».Часопіс небяспечных матэрыялаў398 (2020): 122941.
Навіны і асноўныя моманты накіравана на абмен апошнімі паспяховымі кейсамі з Biomarker Technologies, фіксаванне новых навуковых дасягненняў, а таксама вядомых метадаў, якія прымяняюцца падчас даследавання.
Час публікацыі: 8 студзеня 2022 г