● Мэтавая вобласць кадавання бялку: шляхам захопу і секвенирования вобласці кадавання бялку hWES выкарыстоўваецца для выяўлення варыянтаў, звязаных са структурай бялку;
● Высокая дакладнасць: з высокай глыбінёй секвенирования hWES палягчае выяўленне распаўсюджаных варыянтаў і рэдкіх варыянтаў з частатой ніжэй за 1%;
● Эканамічна эфектыўны: hWES дае прыблізна 85% мутацый хвароб чалавека з 1% геному чалавека;
● Пяць строгіх працэдур кантролю якасці, якія ахопліваюць увесь працэс з гарантыяй Q30>85%.
Платформа
| Бібліятэка
| Стратэгія захопу экзонаў
| Рэкамендаваць стратэгію паслядоўнасці
|
Платформа Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Гб 10 Гб |
Тып выбаркі
| Сума(Qubit®)
| Аб'ём
| Канцэнтрацыя
| Чысціня (NanoDrop™) |
Геномная ДНК
| ≥ 300 нг | ≥ 15 мкл | ≥ 20 нг/мкл | OD260/280=1,8-2,0 без дэградацыі, без забруджвання
|
Для мендэлевых расстройстваў/рэдкіх захворванняў: эфектыўная глыбіня паслядоўнасці вышэй за 50×
Для ўзораў пухлін: эфектыўная глыбіня секвенирования вышэй за 100×
1. Статыстыка выраўноўвання
Табліца 1 Статыстыка вынікаў карты
Табліца 2 Статыстыка захопу экзома
2. Выяўленне варыяцый
Малюнак 1 Статыстыка SNV і InDel
3.Пашыраны аналіз
Малюнак 2. Графік Circos шкоднага SNV і InDel для ўсяго геному
Табліца 3 Скрынінг хваробатворных генаў