-
Секвенаванне геному раслін / жывёл De novo
НановаСеквенаванне адносіцца да пабудовы цэлага геному віду з выкарыстаннем тэхналогій секвеніравання, напрыклад, PacBio, Nanopore, NGS і г.д., пры адсутнасці эталоннага геному.Выдатнае паляпшэнне даўжыні счытвання тэхналогій секвенавання трэцяга пакалення прынесла новыя магчымасці для зборкі складаных геномаў, такіх як геномы з высокай гетерозиготностью, высокім суадносінамі паўтаральных абласцей, поліплоідаў і г.д. З даўжынёй счытвання на ўзроўні дзясяткаў кілабазаў гэтыя счытванні паслядоўнасці дазваляюць дазвол паўтаральных элементаў, абласцей з анамальным утрыманнем ГХ і іншых вельмі складаных абласцей.
Платформа: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Зборка геному на аснове Hi-C
Hi-C - гэта метад, распрацаваны для фіксацыі канфігурацыі храмасом шляхам камбінавання зандзіравання ўзаемадзеяння на аснове блізкасці і высокапрадукцыйнага секвенавання.Лічыцца, што інтэнсіўнасць гэтых узаемадзеянняў адмоўна карэлюе з фізічнай адлегласцю ў храмасомах.Такім чынам, дадзеныя Hi-C могуць кіраваць кластарызацыяй, упарадкаваннем і арыентацыяй сабраных паслядоўнасцяў у чарнавіку геному і замацавання іх на пэўнай колькасці храмасом.Гэтая тэхналогія дае магчымасць зборкі геному на ўзроўні храмасом пры адсутнасці генетычнай карты, заснаванай на папуляцыі.Кожны асобны геном мае патрэбу ў Hi-C.
Платформа: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Эвалюцыйная генетыка
Эвалюцыйная генетыка - гэта комплексны сэрвіс секвенавання, прызначаны для забеспячэння ўсебаковай інтэрпрэтацыі эвалюцыйнай інфармацыі дадзеных матэрыялаў на аснове генетычных варыяцый, у тым ліку SNP, InDels, SV і CNV.Ён забяспечвае ўвесь фундаментальны аналіз, неабходны для апісання эвалюцыйных змяненняў і генетычных асаблівасцяў папуляцый, такіх як структура папуляцыі, генетычнае разнастайнасць, філагенетычныя адносіны і г.д. Ён таксама змяшчае даследаванні патоку генаў, што дазваляе ацаніць эфектыўны памер папуляцыі, час разыходжання.
-
Параўнальная геноміка
Параўнальная геноміка літаральна азначае параўнанне поўных паслядоўнасцяў і структур геному розных відаў.Гэтая дысцыпліна накіравана на выяўленне эвалюцыі відаў, функцыі генаў, механізму рэгуляцыі гена на ўзроўні геному шляхам ідэнтыфікацыі структур паслядоўнасці і элементаў, якія захоўваюцца або дыферэнцыруюцца ў розных відах.Тыповае параўнальнае даследаванне геномыкі ўключае аналіз сямейства генаў, эвалюцыйнага развіцця, дублявання ўсяго геному, выбарчага ціску і г.д.
-
Аб'яднаны аналіз Segregant
Аб'ёмны сегрэгантны аналіз (BSA) - гэта метад, які выкарыстоўваецца для хуткай ідэнтыфікацыі генетычных маркераў, звязаных з фенатыпам.Асноўны працоўны працэс BSA змяшчае выбар дзвюх груп асоб з вельмі супрацьлеглымі фенатыпамі, аб'яднанне ДНК усіх асоб, каб сфармаваць дзве масы ДНК, ідэнтыфікацыю дыферэнцыяльных паслядоўнасцяў паміж двума пуламі.Гэтая методыка шырока выкарыстоўваецца для ідэнтыфікацыі генетычных маркераў, моцна звязаных мэтанакіраванымі генамі ў геномах раслін і жывёл.
