Аналіз геномнай асацыяцыі
1. Перавагі абслугоўвання
● Мноства праектаў: з моманту свайго заснавання ў 2009 годзе BMKGENE завяршыла сотні праектаў па вывучэнні відаў у папуляцыйных даследаваннях GWAS, дапамагла даследчыкам апублікаваць больш за 100 артыкулаў, а сукупны імпакт-каэфіцыент дасягнуў 500.
● Прафесійныя аналітыкі.
● Кароткі цыкл аналізу.
● Дакладны аналіз дадзеных.
2. Спецыфікацыі абслугоўвання
| Тып | Маштаб насельніцтва | Стратэгія паслядоўнасці і глыбіня |
| СЛАФ-ГВАС | Нумар выбаркі ≥200 | Памер геному < 400M, з ref-геномам, рэкамендуецца WGS |
| Памер геному ≤ 1G, 100K тэгаў і 10X | ||
| 1G ≤ памер геному ≤ 2G, 200K тэгаў і 10X | ||
| Памер геному > 2G, 300K Тэгі і 10X | ||
| WGS-GWAS | Нумар выбаркі ≥200 | 10X для кожнага ўзору |
3. Выбар матэрыялу
Розныя гатункі, падвіды, мясцовасці/генныя банкі/змешаныя сем'і/дзікія рэсурсы
Розныя гатункі, падвіды, мясцовасці
Сям'я з зводнымі братамі / сям'я з паўбрацінамі / дзікія рэсурсы
4. Біяінфармацыйны аналіз
● Аналіз геномных асацыяцый
● Аналіз і скрынінг значнага SNP
● Функцыянальная анатацыя гена-кандыдата
5. Паток паслуг
Дызайн эксперыменту
Дастаўка ўзору
Вылучэнне РНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
а.Фенатып QC
Гістаграма размеркавання частот
Статыстыка фенатыпу
б.Аналіз асацыяцыі (мадэль: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ сюжэт
Манхэтэнскі ўчастак
| год | часопіс | IF | Назва |
| 2022 год | NC | 17.69 | Геномная аснова гіга-храмасом і гіга-генома півоні дрэвападобнай Paeonia ostii |
| 2015 год | NP | 7.43 | Сляды прыручэння замацоўваюць геномныя рэгіёны, якія маюць агранамічнае значэнне ў соі |
| 2018 год | MP | 9.32 | Рэсеквеніраванне поўнага генома сусветнай калекцыі ўзораў рапсу паказвае генетычную аснову іх дывергенцыі па экатыпах |
| 2022 год | HR | 7.29 | Аналіз геномных асацыяцый дае малекулярнае ўяўленне аб натуральных варыяцыях памеру кавуновага насення |
