Грыбковы геном
Перавагі абслугоўвання
● Некалькі стратэгій паслядоўнасці даступныя для розных даследчых мэтаў
● Мае вялікі вопыт зборкі геному грыбоў з больш чым 10 000 сабраных геномаў.
● Прафесійная служба тэхнічнай падтрымкі пасля продажу, якая выконвае больш канкрэтныя патрэбы ў даследаваннях.
Спецыфікацыі абслугоўвання
| Абслугоўванне | Стратэгія паслядоўнасці | Якасць гарантавана | Разліковы час апрацоўкі |
| Грыбная дробная карта | Illumina 50X+Nanopore 100X | Кантынг N50≥2 Mb | 35 працоўных дзён |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Грыбковая пена - поўная карта | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Каэфіцыент замацавання храмасом >90% | 45 працоўных дзён |
Біяінфарматычныя аналізы
● Кантроль якасці неапрацаваных дадзеных
● Зборка геному
● Аналіз кампанентаў геному
● Анатацыя функцыі гена
● Параўнальны геномны аналіз
Узоры патрабаванняў і пастаўка
Узоры патрабаванняў:
ДляЭкстракты ДНК:
| Тып выбаркі | Сума | Канцэнтрацыя | Чысціня |
| Экстракты ДНК | > 1,2 мкг | > 20 нг/мкл | OD260/280 = 1,6-2,5 |
Для ўзораў тканін:
| Тып выбаркі | Рэкамендаваны ўзор лячэння | Узор захоўвання і адгрузкі |
| Аднаклетачны грыб | Назірайце за дрожджамі пад мікраскопам і збірайце іх у экспанентнай фазе Перанясіце культуру (якая змяшчае прыбл. 3-4,5e9 клетак) у эпендорф на 1,5 або 2 мл.(Трымайся на лёдзе) Цэнтрыфугуйце прабірку на працягу 1 хвіліны пры 14000 g, каб сабраць бактэрыі і асцярожна выдаліць супернатант Зачыніце прабірку і замарозьце бактэрыі ў вадкім азоце мінімум на 1-3 гадзіны.Захоўвайце прабірку ў халадзільніку -80 ℃. | Замарозьце ўзоры ў вадкім азоце на працягу 3-4 гадзін і захоўвайце ў вадкім азоце або -80 градусаў для працяглага захоўвання.Патрабуецца дастаўка ўзору з сухім лёдам. |
| Макра грыб | Рэкамендуецца тканіна ў фазе актыўнага росту. Прамыйце тканіна вадой без эндатаксіны, затым 70% этаналем. Захавайце ўзор у криопробирках. |
Працэдура абслугоўвання
Дастаўка ўзору
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
1. Дыяграма Circos на геномных кампанентах грыбоў
2. Параўнальны аналіз геномікі: Філагенетычнае дрэва
