Кампанія BMKGENE прадаставіла паслугі прасторавага секвенирования транскрыптамаў для даследавання «STEEL enables high-resolution delineation of spatio-temporal transcryptomic data», якое было апублікавана ў Briefings in Bioinformatics.
У гэтым даследаванні быў прапанаваны некантралюемы і разнастайны алгарытм, заснаваны на навучанні, Spatial Transcriptome Cell typE clustering (STEEL), які ідэнтыфікуе дамены з прасторавага транскрыптому шляхам кластарызацыі шарыкаў, якія дэманструюць вельмі падобныя профілі экспрэсіі генаў і блізкую прасторавую адлегласць у выглядзе графікаў.
Комплексная ацэнка STEEL на наборах прасторавых транскрыптамічных даных з платформы 10X Visium дэманструе, што ён не толькі дасягае высокай раздзяляльнасці для характарыстыкі тонкіх структур мозгу мышы, але таксама дазваляе інтэграваць некалькі слайдаў тканіны, асобна прааналізаваных, у большы.
З развіццём тэхналогій прасторавай транскрыпцыі наш метад будзе мець вялікую прымянімасць у ідэнтыфікацыі даменаў і рэканструкцыі атласа экспрэсіі генаў.
Націсніцетуткаб даведацца больш аб гэтым даследаванні.
Час публікацыі: 20 кастрычніка 2023 г