Кампанія BMKGENE прадаставіла паслугі поўнаметражнага секвенирования транскрыптому з выкарыстаннем тэхналогій PacBio і ONT для даследавання пад назвай «Параўнальны аналіз метадаў секвенирования PacBio і ONT РНК для ідэнтыфікацыі яду Nemopilema Nomurai», якое было апублікавана ў часопісе Genomics.Даследаванне мела на мэце параўнаць эфектыўнасць метадаў секвенирования РНК PacBio і ONT пры ідэнтыфікацыі яду віду медуз Nemopilema nomurai.
Вынікі даследавання сведчаць аб тым, што ONT звычайна ствараў больш высокую якасць неапрацаваных даных пры аналізе транскрыптамаў, у той час як PacBio ствараў большую даўжыню чытання.Было выяўлена, што PacBio лепшы ў ідэнтыфікацыі кадуючых паслядоўнасцей і доўгаланцуговых некадуючых РНК, у той час як ONT быў больш эканамічна эфектыўным для прагназавання альтэрнатыўных падзей сплайсінгу, простых паўтораў паслядоўнасці і фактараў транскрыпцыі.
Гэта даследаванне мае значныя наступствы для будучых тэхналогій секвенирования ў марскіх медуз і падкрэслівае моц поўнаметражнага аналізу транскрыптаў у выяўленні патэнцыйных тэрапеўтычных мішэняў для лячэння дэрматыту медуз.
Націсніцетуткаб даведацца больш аб гэтым артыкуле.
Час публікацыі: 20 снежня 2023 г