● Вялікі вопыт: больш за 200 000 узораў былі апрацаваны ў BMK, якія ахопліваюць розныя тыпы ўзораў, уключаючы культуру клетак, тканіны, вадкасць арганізма і г.д., і больш за 7 000 праектаў мРНК-Seq закрыта, якія ахопліваюць розныя вобласці даследаванняў.
● Сістэма строгага кантролю якасці: асноўныя пункты кантролю якасці на ўсіх этапах, уключаючы падрыхтоўку ўзораў, падрыхтоўку бібліятэкі, секвенаванне і біяінфарматыку, знаходзяцца пад пільным кантролем для атрымання высакаякасных вынікаў.
● Некалькі баз даных даступныя для функцыянальных анатацый і вывучэння ўзбагачэння для выканання разнастайных даследчых мэтаў.
● Пасляпродажнае абслугоўванне: пасляпродажнае абслугоўванне дзейнічае на працягу 3 месяцаў пасля завяршэння праекта, уключаючы кантроль за праектам, пошук і ліквідацыю непаладак, пытанні і адказы па выніках і г.д.
Бібліятэка | Стратэгія паслядоўнасці | Рэкамендаваны даныя | Кантроль якасці |
Полі А ўзбагачаны | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеатыды:
Канц. (нг/мкл) | Колькасць (мкг) | Чысціня | Сумленнасць |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Забруджванне бялком або ДНК на гелі абмежавана або адсутнічае. | Для раслін: RIN≥6,5; Для жывёл: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; абмежаванае павышэнне зыходнага ўзроўню або яго адсутнасць |
Тканіна: Вага (сухі):≥1 г
*Для тканіны, меншай за 5 мг, мы рэкамендуем адправіць хутка замарожаны (у вадкім азоце) узор тканіны.
Клеткавая завісь:Колькасць клетак = 3×106- 1×107
*Мы рэкамендуем адпраўляць замарожаны лізат клетак.У выпадку, калі гэтая ячэйка меншая за 5×105.
Узоры крыві:Аб'ём≥1 мл
мікраарганізмы:Маса ≥ 1 г
Кантэйнер: цэнтрыфужная прабірка аб'ёмам 2 мл (фальга не рэкамендуецца)
Прыклад маркіроўкі: група+рэплікацыя, напрыклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Адгрузка:
Біяінфарматыка
Эўкарыятычны Рабочы працэс аналізу секвенирования мРНК
Біяінфарматыка
ØКантроль якасці неапрацаваных дадзеных
ØВыраўноўванне эталоннага геному
ØАналіз структуры стэнаграмы
ØКолькаснае выражэнне
ØДыферэнцыяльны аналіз выразаў
ØФункцыя анатацыі і ўзбагачэння
1.Крывая насычэння дадзеных мРНК
2.Дыферэнцыяльны аналіз выразаў - графік вулкана
3.Анатацыя KEGG на DEG
4.Класіфікацыя GO па ДЭГ