●платформы:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten і BGI-DNB-T7
●Рэжымы паслядоўнасці:PE50, PE100, PE150, PE250
●Кантроль якасці бібліятэк перад секвенированием
●Дастаўка паслядоўнасці даных і кантроль якасці:дастаўка справаздачы аб кантролі якасці і неапрацаваных даных у фармаце fastq пасля дэмультыплексавання і фільтрацыі чытанняў Q30.
●Універсальнасць паслуг секвенирования:кліент можа выбраць паслядоўнасць па паласе, праточнай ячэйцы або колькасці даных.
●Універсальнасць платформаў:Бібліятэкі DNB можна перанесці на платформы Illumina
●Шырокі досвед працы з платформай секвенирования Illumina:з тысячамі закрытых праектаў з рознымі відамі.
●Дастаўка справаздачы аб секвенировании КК:з паказчыкамі якасці, дакладнасцю даных і агульнай прадукцыйнасцю праекта секвенирования.
●Спелы працэс секвенирования:з кароткім часам апрацоўкі.
●Строгі кантроль якасці: мы выконваем строгія патрабаванні кантролю якасці, каб гарантаваць нязменна высокую якасць вынікаў.
Аб'ём дадзеных (X) | Канцэнтрацыя (кПЦР/нМ) | Аб'ём |
X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
50 Гб ≤ X < 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 20 мкл |
X ≥ 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 20 мкл |
Платформа | Канцэнтрацыя (кПЦР/нМ) | Аб'ём |
HiSeq X Ten | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq X | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
У дадатак да канцэнтрацыі і агульнай колькасці таксама патрабуецца адпаведная мадэль пікаў.
Справаздача аб якасці бібліятэкі прадастаўляецца перад секвенаваннем, ацэнкай колькасці бібліятэкі і фрагментацыяй.
Табліца 1. Статыстыка па дадзеных секвенирования.
Узор ID | БМКІД | Сырое чытанне | Неапрацаваныя даныя (bp) | Чыстае чытанне (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | БМК_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | БМК_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Малюнак 1. Размеркаванне якасці па чытаннях у кожным узоры
Малюнак 2. Базавае размеркаванне кантэнту
Малюнак 3. Размеркаванне прачытанага змесціва ў дадзеных паслядоўнасці