Прасторавая транскрыпцыя BMKMANU S1000
Тэхнічная схема прасторавага транскрыптому BMKMANU S1000
Перавагі БМКМАНУ С1000
1) Субклеткавае раздзяленне: кожная вобласць захопу ўтрымлівала >2 мільёнаў прасторавых плям са штрых-кодам дыяметрам 2,5 мкм і адлегласцю 5 мкм паміж цэнтрамі плям, што дазваляла прасторавы аналіз транскрыптому з субклетачным раздзяленнем (5 мкм).
2) Шматузроўневы аналіз дазволу: Гнуткі шматузроўневы аналіз у дыяпазоне ад 100 мкм да 5 мкм для вызначэння разнастайных функцый тканіны з аптымальным дазволам.
3) Комплекснае прафіляванне транскрыптаў: транскрыпты, атрыманыя з цэлага прадметнага шкла тканіны, можна аналізаваць без абмежаванняў па колькасці мэтавых генаў і мэтавай вобласці.
Спецыфікацыі абслугоўвання
| Бібліятэка | Стратэгія паслядоўнасці | Рэкамендуецца вывад дадзеных |
| Бібліятэка кДНК S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Гб/узор |
Узоры патрабаванняў
| Узор | Нумар | Памер | Якасць РНК |
| Убудаваны тканкавы блок OCT | 2-3 блока/ узор | Прыбл.6,8x6,8x6,8 мм3 | RIN≥7 |
Для атрымання больш падрабязнай інфармацыі аб інструкцыях па падрыхтоўцы ўзораў і працоўным працэсе абслугоўвання, калі ласка, не саромейцеся гаварыць з aBMKGENE эксперт
Працэдура абслугоўвання
Дызайн эксперыменту
Дастаўка ўзору
Папярэдні эксперымент
Прасторавае штрыхавое кадзіраванне
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
Дадзеныя, атрыманыя BMKMANU S1000, аналізуюцца з дапамогай праграмнага забеспячэння «BSTMatrix», якое незалежна распрацавана BMKGENE, у тым ліку:
1) Генерацыя матрыцы экспрэсіі гена
2) ЁН апрацоўка выявы
3) Сумяшчальнасць з далейшым праграмным забеспячэннем іншых вытворцаў для аналізу
4) Онлайн “BSTViewer” дапамагае атрымаць вынікі візуалізацыі ў розных дазволах.
1. Кропкавая кластэрызацыя
2.Прасторавае размеркаванне
Nнататка: Рэзалюцыяузровень=13 (100 мкм, злева); 7 (50 мкм, правільна)
3. Цеплавая карта кластарызацыі багацця выразаў маркера
4.Міжвыбаркавы аналіз дадзеных
