Nüvələrin təcrid edilməsinə ikiqat keçidli səkkiz kanallı mikrofluidik sistemdən ibarət 10× Genomics ChromiumTM nail olunur.Bu sistemdə barkodlar və primer, fermentlər və tək nüvəli gel muncuqları nanolitr ölçülü yağ damcısına daxil edilir və Gel Bead-in-Emulsion (GEM) əmələ gətirir.GEM əmələ gəldikdən sonra hər bir GEM-də hüceyrə lizisi və barkodların buraxılması həyata keçirilir.mRNA 10 × barkod və UMI ilə cDNA molekullarına əks transkripsiya edilir, daha sonra standart ardıcıllıq kitabxanasının qurulmasına tabedir.
Hüceyrə / Toxuma | Səbəb |
Dondurulmuş toxumanı təmizləyin | Təzə və ya uzun müddət saxlanmış təşkilatları əldə etmək mümkün deyil |
Əzələ hüceyrəsi, Meqakaryosit, Yağ… | Hüceyrə diametri alətə daxil olmaq üçün çox böyükdür |
Qaraciyər… | Qırmaq üçün çox kövrəkdir, tək hüceyrələri ayırd edə bilmir |
Neyron hüceyrəsi, beyin… | Daha həssas, asan stress, sıralama nəticələrini dəyişəcək |
Mədəaltı vəzi, Tiroid… | Tək hüceyrə süspansiyonunun istehsalına təsir edən endogen fermentlərlə zəngindir |
Tək nüvəli | Tək hüceyrəli |
Limitsiz hüceyrə diametri | Hüceyrə diametri: 10-40 μm |
Material dondurulmuş toxuma ola bilər | Material təzə toxuma olmalıdır |
Dondurulmuş hüceyrələrin aşağı stressi | Ferment müalicəsi hüceyrə stres reaksiyasına səbəb ola bilər |
Qırmızı qan hüceyrələrinin çıxarılmasına ehtiyac yoxdur | Qırmızı qan hüceyrələrini çıxarmaq lazımdır |
Nüvə bioinformasiyanı ifadə edir | Bütün hüceyrə bioinformasiyanı ifadə edir |
Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat Həcmi | Nümunə tələbləri | Doku |
10 × Genomics tək nüvəli kitabxana | 10x Genomika - Illumina PE150 | 100.000 oxunuş/hüceyrəyə təqribən.100-200 Gb | Hüceyrə nömrəsi: >2×105 Hüceyrə kons.700-1200 hüceyrə/μL-də | ≥ 200 mq |
Nümunə hazırlama təlimatı və xidmət iş prosesi haqqında ətraflı məlumat üçün lütfən, a ilə danışınBMKGENE mütəxəssisi
1.Spot qruplaşması
2.Marker ifadə bolluğu klasterləşmə istilik xəritəsi
3.Müxtəlif klasterlərdə maker genlərinin paylanması
4.Hüceyrə trayektoriyasının təhlili/psevdotime