-
Metagenomik ardıcıllıq -NGS
Metagenom, ətraf mühitin metagenomu, insan metagenomu və s. kimi qarışıq orqanizmlər cəmiyyətinin ümumi genetik materialının toplusuna aiddir. O, həm becərilə bilən, həm də becərilməyən mikroorqanizmlərin genomlarını ehtiva edir.Metagenomik ardıcıllıq ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materialların təhlili üçün istifadə olunan molekulyar alətdir və növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit faktorları ilə korrelyasiya şəbəkəsi haqqında ətraflı məlumat verir.
Platforma:Illumina NovaSeq Platforması
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomika ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materialların təhlili üçün istifadə olunan molekulyar alətdir, burada növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit faktorları ilə korrelyasiya şəbəkəsi və s. metagenomik tədqiqatlar üçün.Oxuma uzunluğunda onun üstün performansı aşağı axın metagenomik analizini, xüsusən də metagenom birləşməsini əhəmiyyətli dərəcədə artırdı.Oxunma uzunluğunun üstünlüklərindən istifadə edərək, Nanopore əsaslı metagenomik tədqiqat ov tüfəngi metagenomikası ilə müqayisədə daha davamlı montaja nail ola bilir.Nanopore əsaslı metagenomikanın mikrobiomlardan tam və qapalı bakterial genomları uğurla yaratdığı nəşr edilmişdir (Moss, EL, et. al.Təbiət biotexnologiyası, 2020)
Platforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S və 18S rRNT-də həm yüksək dərəcədə qorunan, həm də hiper-dəyişən bölgələri ehtiva edən alt bölmə prokaryotik və eukaryotik orqanizmlərin identifikasiyası üçün mükəmməl molekulyar barmaq izidir.Ardıcıllığın üstünlüklərindən istifadə edərək, bu amplikonlar qorunan hissələrə əsasən hədəflənə bilər və hiper-dəyişən bölgələr mikrob müxtəlifliyinin təhlili, taksonomiya, filogeniya və s. əhatə edən tədqiqatlara töhfə verən mikrob identifikasiyası üçün tam olaraq xarakterizə edilə bilər. Tək molekullu real vaxt(SMRT) ) PacBio platformasının ardıcıllığı tam uzunluqlu amplikonları (təqribən 1,5 Kb) əhatə edə bilən yüksək dəqiqlikli uzun oxunuşların əldə edilməsinə imkan verir.Genetik sahənin geniş görünüşü bakteriya və ya göbələklər cəmiyyətində növ annotasiyasının dəqiqliyini xeyli artırdı.
Platforma:PacBio davamı II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikon ardıcıllığı, həm yüksək dərəcədə qarşılıqlı, həm də hiperdəyişən hissələri ehtiva edən ev təsərrüfatı genetik markerlərinin PCR məhsullarını tədqiq etməklə mikrob icmasında filogeniya, taksonomiya və növ bolluğunu aşkar etmək məqsədi daşıyır.Woeses və digərləri (1977) tərəfindən bu mükəmməl molekulyar barmaq izinin tətbiqi mikrobiomun təcrid olunmayan profilini təmin edir.16S (bakteriyalar), 18S (göbələklər) və Daxili transkripsiya edilmiş spacer (ITS, göbələklər) ardıcıllığı həm bol növlərin, həm də nadir və naməlum növlərin identifikasiyasına imkan verir.Bu texnologiya müxtəlif mühitlərdə, məsələn, insan ağzı, bağırsaqları, nəcisləri və s.-də diferensial mikrob tərkibinin müəyyən edilməsində geniş tətbiq olunan və əsas vasitəyə çevrilmişdir.
Platforma:Illumina NovaSeq Platforması
-
Bakterial və göbələklərin bütün genomunun yenidən sıralanması
Bakterial və göbələklərin bütün genomunun təkrar ardıcıllığı məlum bakteriya və göbələklərin genomlarını tamamlamaq, həmçinin çoxsaylı genomları müqayisə etmək və ya yeni orqanizmlərin genomlarını xəritələşdirmək üçün mühüm vasitədir.Dəqiq istinad genomlarının yaradılması, mikrobların identifikasiyası və digər müqayisəli genom tədqiqatlarının aparılması üçün bakteriya və göbələklərin bütün genomlarının ardıcıllığı böyük əhəmiyyət kəsb edir.
Platforma: Illumina NovaSeq Platforması
-
Metatranskriptomun ardıcıllığı
Metatranskriptom ardıcıllığı təbii mühitlərdə (məsələn, torpaq, su, dəniz, nəcis və bağırsaq) mikrobların (həm eukariotlar, həm də prokaryotlar) gen ifadəsini müəyyənləşdirir. Xüsusilə, bu xidmətlər kompleks mikrob icmalarının bütün gen ifadə profilini əldə etməyə imkan verir, taksonomik analiz. növlərin, müxtəlif ifadə olunan genlərin funksional zənginləşdirilməsi təhlili və s.
Platforma: Illumina NovaSeq Platforması
-
Mantar genomu
Biomarker Technologies xüsusi tədqiqat məqsədindən asılı olaraq genom sorğusu, incə genom və göbələklərin tam genomunu təmin edir.Genom ardıcıllığı, montaj və funksional annotasiya yüksək səviyyəli genom yığımına nail olmaq üçün Yeni nəsil ardıcıllığı + Üçüncü nəsil ardıcıllığı birləşdirməklə əldə edilə bilər.Hi-C texnologiyası həmçinin xromosom səviyyəsində genom yığılmasını asanlaşdırmaq üçün istifadə edilə bilər.
Platforma:PacBio davamı II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platforması
-
Bakteriyaların tam genomu
Biomarker Technologies sıfır boşluqla bakteriyaların tam genomunun qurulması üzrə ardıcıllıq xidməti təqdim edir.Bakteriyaların tam genom qurulmasının əsas iş axınına üçüncü nəsil ardıcıllığı, montaj, funksional annotasiya və xüsusi tədqiqat məqsədlərini yerinə yetirən qabaqcıl bioinformatik analiz daxildir.Bakteriyaların genomunun daha əhatəli profili onların bioloji proseslərinin əsasını təşkil edən əsas mexanizmləri aşkar etməyə imkan verir ki, bu da yüksək eukaryotik növlərdə genomik tədqiqatlar üçün dəyərli istinad təmin edə bilər.
Platforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platforması
PacBio davamı II
