-
PacBio-Tam uzunluqlu 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S/18S/ITS) platforması mikrob müxtəlifliyi layihəsinin təhlili sahəsində uzun illər təcrübəsi ilə işlənib hazırlanmışdır, burada standartlaşdırılmış əsas analiz və fərdiləşdirilmiş analizlər var: əsas analiz cari mikrob tədqiqatının əsas analiz məzmununu əhatə edir, analiz məzmunu zəngin və əhatəlidir, və təhlil nəticələri layihə hesabatları şəklində təqdim olunur;Fərdi təhlilin məzmunu müxtəlifdir.Fərdi tələbləri həyata keçirmək üçün nümunələr seçilə bilər və parametrlər əsas təhlil hesabatına və tədqiqat məqsədinə uyğun olaraq çevik şəkildə təyin edilə bilər.Windows əməliyyat sistemi, sadə və sürətli.
-
PacBio-Tam uzunluqlu Transkriptom (Qeyri-istinad)
Daxiletmə kimi Pacific Biosciences (PacBio) izoform ardıcıllığı məlumatlarını götürərək, bu proqram tam uzunluqlu transkript ardıcıllığını (montaj olmadan) müəyyən edə bilir.İstinad genomuna qarşı tam uzunluqlu ardıcıllıqların xəritələşdirilməsi ilə transkriptlər məlum genlər, transkriptlər, kodlaşdırma bölgələri və s. ilə optimallaşdırıla bilər. Bu halda mRNT strukturlarının, məsələn, alternativ splicing və s. daha dəqiq identifikasiyasına nail olmaq olar.NGS transkriptom ardıcıllığı məlumatları ilə birgə təhlil transkript səviyyəsində ifadədə daha əhatəli annotasiyaya və daha dəqiq kəmiyyətləşdirməyə imkan verir ki, bu da əsasən aşağı axın diferensial ifadə və funksional analizdən faydalanır.
-
Alət dəstləri
BMKCloud, tibb, kənd təsərrüfatı, ətraf mühit və s. daxil olmaqla, müxtəlif sahələrdə tədqiqatçılar tərəfindən geniş etibar edilən genomik proqramlar üçün bir pəncərə həllini təmin edən aparıcı bioinformatik platformadır. BMKCloud bioinformatik analiz platformaları və alətləri daxil olmaqla inteqrasiya olunmuş, etibarlı və səmərəli xidmətlər təqdim etməyə sadiqdir. , hesablama resursları, ictimai verilənlər bazası, bioinformatika onlayn kursları və s. BMKCloud-da gen annotasiyası, təkamüllü genetik alətlər, ncRNA, məlumatların keyfiyyətinə nəzarət, montaj, uyğunlaşdırma, məlumatların çıxarılması, mutasiyalar, statistika, rəqəm generatoru, ardıcıllıq daxil olmaqla tez-tez istifadə olunan müxtəlif bioinformatik alətlər var. təhlili və s.
-
kiçik RNT
Kiçik RNT-lər miRNA, siRNA və piRNA daxil olmaqla orta uzunluğu 18-30 nt olan qısa kodlaşdırmayan RNT növüdür.Bu kiçik RNT-lərin mRNT deqradasiyası, tərcümənin inhibəsi, heterokromatinin əmələ gəlməsi və s. kimi müxtəlif bioloji proseslərdə iştirak etdiyi bildirilmişdir. SmallRNT ardıcıllığının təhlili heyvan/bitki inkişafı, xəstəlik, virus və s. tədqiqatlarda geniş şəkildə tətbiq edilmişdir. Kiçik RNT ardıcıllıq təhlili platforması standart analiz və qabaqcıl məlumatların çıxarılmasından ibarətdir.RNT seq məlumatları əsasında standart analiz miRNA identifikasiyası və proqnozlaşdırılması, miRNA hədəf geninin proqnozlaşdırılması, annotasiya və ifadə analizinə nail ola bilər.Qabaqcıl analiz fərdiləşdirilmiş miRNA axtarışı və çıxarılmasına, Venn diaqramının yaradılmasına, miRNA və hədəf gen şəbəkəsinin qurulmasına imkan verir.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS Biomarker Technologies-də zəngin təcrübə əsasında hazırlanmış bütöv bir genomun təkrar ardıcıllığının təhlili platformasıdır.İstifadəsi asan olan bu platforma həm Illumina platformasından, həm də BGI sıralama platformasından yaradılan DNT ardıcıllığı məlumatlarına uyğun gələn bir neçə əsas parametr təyin etməklə inteqrasiya olunmuş analiz iş prosesini tez təqdim etməyə imkan verir.Bu platforma yüksək performanslı hesablama serverində yerləşdirilib ki, bu da çox məhdud vaxt ərzində yüksək səmərəli məlumatların təhlilinə imkan verir.Fərdi məlumatların çıxarılması standart analiz əsasında mövcuddur, o cümlədən mutasiya edilmiş gen sorğusu, PCR primer dizaynı və s.
-
mRNT(İstinad)
Transkriptom genomik genetik məlumat ilə bioloji funksiyanın proteomu arasında əlaqədir.Transkripsiya səviyyəsinin tənzimlənməsi orqanizmlərin ən vacib və ən çox öyrənilən tənzimləmə üsuludur.Transkriptomun ardıcıllığı tək bir nukleotid üçün dəqiqliklə, istənilən vaxt və ya istənilən şəraitdə transkriptomu ardıcıllıqla sıralaya bilər. O, gen transkripsiyasının səviyyəsini dinamik şəkildə əks etdirə, eyni zamanda nadir və normal transkriptləri müəyyən edib kəmiyyətini müəyyən edə, həmçinin transkriptomun struktur məlumatını təmin edə bilər. xüsusi transkript nümunələri.
Hal-hazırda, transkriptom ardıcıllığı texnologiyası heyvan və bitki inkişafının tənzimlənməsi, ətraf mühitə uyğunlaşma, immun qarşılıqlı əlaqə, genlərin lokalizasiyası, növlərin genetik təkamülü və şiş və genetik xəstəliklərin aşkarlanması daxil olmaqla, aqronomiya, tibb və digər tədqiqat sahələrində geniş istifadə olunur.
-
Metagenomika (NGS)
Bu analiz platforması illərin təcrübəsi əsasında ov tüfəngi metagenomik məlumatların təhlili üçün nəzərdə tutulmuşdur.O, verilənlərin emalı, növ səviyyəli tədqiqatlar, gen funksiyası səviyyəsində tədqiqatlar, metagenomların yığılması və s. daxil olmaqla, tez-tez ehtiyac duyulan müxtəlif metagenomik təhlilləri ehtiva edən inteqrasiya olunmuş iş axınından ibarətdir. Bundan əlavə, gen və növ sorğusu da daxil olmaqla, standart analiz iş prosesində fərdi məlumatların öyrənilməsi alətləri mövcuddur. , parametrlərin təyin edilməsi, fərdiləşdirilmiş rəqəmlərin yaradılması və s.
-
LncRNA
Uzun kodlaşdırmayan RNT (lncRNA) zülalları kodlaya bilməyən, uzunluğu 200 nt-dən çox olan transkript növüdür.Yığımlı sübutlar göstərir ki, lncRNA-ların əksəriyyəti funksionaldır.Yüksək məhsuldarlıqlı sekvensiya texnologiyaları və bioinformatik analiz alətləri bizə lncRNA ardıcıllıqlarını və yerləşdirmə məlumatlarını daha səmərəli aşkar etməyə imkan verir və mühüm tənzimləyici funksiyaları olan lncRNA-ları kəşf etməyə kömək edir.BMKCloud müştərilərimizə sürətli, etibarlı və çevik lncRNA analizinə nail olmaq üçün lncRNA sıralama analizi platformasını təqdim etməkdən qürur duyur.
-
GWAS
Genom miqyaslı assosiasiya tədqiqatı (GWAS) spesifik əlamətlərlə (fenotip) əlaqəli olan genetik variantları (genotip) müəyyən etmək məqsədi daşıyır.GWA tədqiqatları genetik markerlərin çoxlu sayda fərdlərin bütün genomunu kəsişməsini araşdırır və populyasiya səviyyəsində statistik təhlillə genotip-fenotip birləşmələrini proqnozlaşdırır.Bütün genomun təkrar sıralanması potensial olaraq bütün genetik variantları aşkar edə bilər.Fenotipik məlumatlarla birləşdirilərək, GWAS müasir heyvan/bitki yetişdirilməsini güclü şəkildə dəstəkləyən fenotiplə əlaqəli SNP-ləri, QTL-ləri və namizəd genləri müəyyən etmək üçün işlənə bilər.SLAF, genom üzrə paylanmış markerləri, SNP-ni aşkar edən, özünü inkişaf etdirən sadələşdirilmiş genom ardıcıllığı strategiyasıdır.Bu SNP-lər, molekulyar genetik markerlər kimi, hədəf əlamətləri ilə assosiasiya tədqiqatları üçün işlənə bilər.Mürəkkəb əlamətlərin əlaqəli genetik varyasyonlarını müəyyən etmək üçün səmərəli strategiyadır.
-
Nanopore Tammetrajlı transkriptomikası
Orqanizmlərdə mürəkkəb və dəyişkən alternativ izoformalar gen ifadəsini və zülal müxtəlifliyini tənzimləyən mühüm genetik mexanizmlərdir.Transkript strukturlarının dəqiq müəyyən edilməsi gen ifadəsinin tənzimlənməsi nümunələrinin dərindən öyrənilməsi üçün əsasdır.Nanopore sequencing platforması transkriptomik tədqiqatı uğurla izoform səviyyəsinə çatdırdı.Bu analiz platforması həm gen səviyyəsində, həm də transkript səviyyəsində keyfiyyət və kəmiyyət analizlərinə nail olan istinad genomu əsasında Nanopore platformasında yaradılan RNT-Seq məlumatlarını təhlil etmək üçün nəzərdə tutulmuşdur.
-
circ-RNT
Dairəvi RNT(circRNA) kodlaşdırılmayan RNT növüdür və bu yaxınlarda inkişaf edən, ətraf mühitə qarşı müqavimət və s. ilə məşğul olan tənzimləyici şəbəkələrdə mühüm rol oynadığı aşkar edilmişdir. Xətti RNT molekullarından, məsələn, mRNA, lncRNA, 3′ və 5′ fərqlidir. circRNA-nın ucları bir-birinə birləşdirilərək dairəvi struktur əmələ gətirir ki, bu da onları ekzonükleazın həzmindən xilas edir və xətti RNT-nin əksəriyyətindən daha sabitdir.CircRNA-nın gen ifadəsini tənzimləməkdə müxtəlif funksiyaları olduğu aşkar edilmişdir.CircRNA, miRNA süngər kimi tanınan miRNA-nı rəqabətli şəkildə bağlayan ceRNA kimi çıxış edə bilər.CircRNA ardıcıllığı analiz platforması circRNA strukturu və ifadə analizi, hədəf proqnozlaşdırılması və digər RNT molekulları ilə birgə təhlili gücləndirir.
-
BSA
Toplu Segregant Analiz platforması bir addımlı standart analizdən və fərdiləşdirilmiş parametr qəbulu ilə təkmil təhlildən ibarətdir.BSA, fenotiplə əlaqəli genetik markerləri tez müəyyən etmək üçün istifadə edilən bir texnikadır.BSA-nın əsas iş axınına aşağıdakılar daxildir: 1. son dərəcə zidd fenotipləri olan iki qrup fərdlərin seçilməsi;2. DNT-nin iki böyük hissəsini yaratmaq üçün bütün fərdlərin DNT, RNT və ya SLAF seq (Biomarker tərəfindən hazırlanıb) birləşdirilməsi;3. istinad genomuna qarşı və ya aralarındakı diferensial ardıcıllığın müəyyən edilməsi, 4. ED və SNP indeksi alqoritmi ilə namizədlə əlaqəli bölgələrin proqnozlaşdırılması;5. Namizəd bölgələrdə genlərin funksional təhlili və zənginləşdirilməsi və s. Genetik markerlərin skrininqi və primer dizaynı da daxil olmaqla məlumatlarda daha təkmil mədənçilik də mövcuddur.
