GENOM
Xromosom miqyaslı yığılması və biokütləvi məhsul Miscanthus lutarioriparius genomunun təhlili
Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |RNT ardıcıllığı |Filogeniya
Bu tədqiqatda Biomarker Technologies Nanopore sequencing, de novo genom assembly, Hi-C assisted assembly və s. üzrə texniki dəstək verdi.
mücərrəd
Miscanthus, rizomatöz çoxillik bitki, yüksək biokütləsi və stresə davamlılığı üçün bioenerji istehsalı üçün böyük potensiala malikdir.xromosom miqyasında yığılması barədə məlumat veririkMiscanthus lutarioripariusOxford Nanopore sequencing və Hi-C texnologiyalarını birləşdirərək genom.2,07 Gb yığım genomun 96,64%-ni əhatə edir, N50 1,71 Mb təşkil edir.Sentromer və telomer ardıcıllığı müvafiq olaraq bütün 19 xromosom və 10-cu xromosom üçün yığılmışdır.M. lutarioriparius-un allotetraploid mənşəyi sentromerik peyk təkrarlarından istifadə etməklə təsdiqlənir.Sorguma nisbətən tetraploid genom quruluşu və bir neçə xromosom quruluşu aydın şəkildə nümayiş etdirilir.Tandem cüt genləriM. lutarioripariusyalnız stress reaksiyası ilə bağlı deyil, həm də hüceyrə divarının biosintezi baxımından funksional zənginləşdirilmişdir.Xəstəliyə qarşı müqavimət, hüceyrə divarının biosintezi və metal ionlarının daşınması ilə əlaqəli gen ailələri çox genişlənir və inkişaf edir.Bu ailələrin genişlənməsi əlamətdar əlamətlərin təkmilləşdirilməsi üçün mühüm genomik əsas ola bilərM. lutarioriparius.
Genom birləşməsinin əsas statistikası
Şəkil.M. lutarioriparius genom yığıncağına ümumi baxış
Xəbərlər və Mövzular Ən son uğurlu hadisələri Biomarker Technologies ilə bölüşmək, yeni elmi nailiyyətləri, eləcə də tədqiqat zamanı tətbiq olunan görkəmli texnikaları əldə etmək məqsədi daşıyır.
Göndərmə vaxtı: 05 yanvar 2022-ci il