BMKCloud Log in
条形banner-03

Xəbərlər

GENOM

Təbiət_Rabitə_Loqosu

Xromosom miqyaslı yığılması və biokütləvi məhsul Miscanthus lutarioriparius genomunun təhlili

Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |RNT ardıcıllığı |Filogeniya

Bu tədqiqatda Biomarker Technologies Nanopore sequencing, de novo genom assembly, Hi-C assisted assembly və s. üzrə texniki dəstək verdi.

mücərrəd

Miscanthus, rizomatöz çoxillik bitki, yüksək biokütləsi və stresə davamlılığı üçün bioenerji istehsalı üçün böyük potensiala malikdir.xromosom miqyasında yığılması barədə məlumat veririkMiscanthus lutarioripariusOxford Nanopore sequencing və Hi-C texnologiyalarını birləşdirərək genom.2,07 Gb yığım genomun 96,64%-ni əhatə edir, N50 1,71 Mb təşkil edir.Sentromer və telomer ardıcıllığı müvafiq olaraq bütün 19 xromosom və 10-cu xromosom üçün yığılmışdır.M. lutarioriparius-un allotetraploid mənşəyi sentromerik peyk təkrarlarından istifadə etməklə təsdiqlənir.Sorguma nisbətən tetraploid genom quruluşu və bir neçə xromosom quruluşu aydın şəkildə nümayiş etdirilir.Tandem cüt genləriM. lutarioripariusyalnız stress reaksiyası ilə bağlı deyil, həm də hüceyrə divarının biosintezi baxımından funksional zənginləşdirilmişdir.Xəstəliyə qarşı müqavimət, hüceyrə divarının biosintezi və metal ionlarının daşınması ilə əlaqəli gen ailələri çox genişlənir və inkişaf edir.Bu ailələrin genişlənməsi əlamətdar əlamətlərin təkmilləşdirilməsi üçün mühüm genomik əsas ola bilərM. lutarioriparius.

Genom birləşməsinin əsas statistikası

xəbərlər-1
xəbərlər-2

Şəkil.M. lutarioriparius genom yığıncağına ümumi baxış

Xəbərlər və Mövzular Ən son uğurlu hadisələri Biomarker Technologies ilə bölüşmək, yeni elmi nailiyyətləri, eləcə də tədqiqat zamanı tətbiq olunan görkəmli texnikaları əldə etmək məqsədi daşıyır.


Göndərmə vaxtı: 05 yanvar 2022-ci il

Mesajınızı bizə göndərin: