● Məqsədli Zülal Kodlaşdırma Bölgəsi: zülal kodlaşdırma bölgəsini tutmaq və ardıcıllıqla, hWES zülal strukturu ilə əlaqəli variantları aşkar etmək üçün istifadə olunur;
● Yüksək Dəqiqlik: yüksək ardıcıllıq dərinliyi ilə hWES ümumi variantların və 1%-dən aşağı tezlikli nadir variantların aşkarlanmasını asanlaşdırır;
● Effektiv xərc: hWES insan genomunun 1%-dən insan xəstəlik mutasiyalarının təxminən 85%-ni verir;
● Q30>85% zəmanət ilə bütün prosesi əhatə edən beş ciddi QC proseduru.
Platforma
| Kitabxana
| Exon Capture Strategiyası
| Ardıcıllıq Strategiyasını tövsiyə edin
|
Illumina NovaSeq Platforması
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Nümunə növü
| Məbləğ(Qubit®)
| Həcmi
| Konsentrasiya
| Saflıq (NanoDrop™) |
Genomik DNT
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1,8-2,0 deqradasiya, çirklənmə yoxdur
|
Mendel pozğunluqları/nadir xəstəliklər üçün: 50×-dən yuxarı effektiv ardıcıllıq dərinliyi
Şiş nümunələri üçün: 100×-dən yuxarı effektiv ardıcıllıq dərinliyi
1.Alignment statistikası
Cədvəl 1 Xəritənin nəticəsinin statistikası
Cədvəl 2 Ekzomun tutulması statistikası
2.Variasiyanın aşkarlanması
Şəkil 1 SNV və InDel statistikası
3. Qabaqcıl Təhlil
Şəkil 2 Genom üzrə zərərli SNV və InDel-in Circos planı
Cədvəl 3 Xəstəliyə səbəb olan genlərin skrininqi