Genom miqyaslı assosiasiya tədqiqatı (GWAS) spesifik əlamətlərlə (fenotip) əlaqəli olan genetik variantları (genotip) müəyyən etmək məqsədi daşıyır.GWA tədqiqatları genetik markerlərin çoxlu sayda fərdlərin bütün genomunu kəsişməsini araşdırır və populyasiya səviyyəsində statistik təhlillə genotip-fenotip birləşmələrini proqnozlaşdırır.Bütün genomun təkrar sıralanması potensial olaraq bütün genetik variantları aşkar edə bilər.Fenotipik məlumatlarla birləşdirilərək, GWAS müasir heyvan/bitki yetişdirilməsini güclü şəkildə dəstəkləyən fenotiplə əlaqəli SNP-ləri, QTL-ləri və namizəd genləri müəyyən etmək üçün işlənə bilər.SLAF, genom üzrə paylanmış markerləri, SNP-ni aşkar edən, özünü inkişaf etdirən sadələşdirilmiş genom ardıcıllığı strategiyasıdır.Bu SNP-lər, molekulyar genetik markerlər kimi, hədəf əlamətləri ilə assosiasiya tədqiqatları üçün işlənə bilər.Mürəkkəb əlamətlərin əlaqəli genetik varyasyonlarını müəyyən etmək üçün səmərəli strategiyadır.