Genom miqyaslı Assosiasiya Təhlili
1.Xidmət Üstünlükləri
● Bol Layihə İşləri: 2009-cu ildə yarandığı gündən BMKGENE populyasiya GWAS tədqiqatında yüzlərlə növ layihələrini tamamladı, tədqiqatçılara 100-dən çox məqalə dərc etməyə kömək etdi və məcmu təsir faktoru 500-ə çatdı.
● Peşəkar analitiklər.
● Qısa təhlil dövrü.
● Dəqiq data mining.
2. Xidmət Xüsusiyyətləri
| Növ | Əhali miqyası | Ardıcıllıq strategiyası və dərinliyi |
| SLAF-GWAS | Nümunə sayı ≥200 | Genom ölçüsü < 400M, ref-genom ilə WGS tövsiyə olunur |
| Genom ölçüsü ≤ 1G, 100K Teqlər və 10X | ||
| 1G ≤ Genom ölçüsü ≤ 2G, 200K Teqlər və 10X | ||
| Genom ölçüsü > 2G, 300K Teqlər və 10X | ||
| WGS-GWAS | Nümunə sayı ≥200 | Hər nümunə üçün 10X |
3. Material seçimi
Müxtəlif növlər, alt növlər, torpaqlar/genbanklar/qarışıq ailələr/vəhşi resurslar
Müxtəlif növlər, alt növlər, landracelər
Yarım sib ailə/tam sib ailə/vəhşi resurslar
4. Bioinformasiya təhlili
● Genom miqyasında assosiasiya analizi
● Əhəmiyyətli SNP-nin təhlili və skrininqi
● Namizəd geninin funksional annotasiyası
5. Xidmətin İş axını
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satışdan sonrakı xidmətlər
a.Fenotip QC
Tezlik paylanması histoqramı
Fenotip statistikası
b.Assosiasiya təhlili (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ Süjeti
Manhetten süjeti
| il | Jurnal | IF | Başlıq |
| 2022 | NC | 17.69 | Ağac pionu Paeonia ostii giga-xromosomlarının və giga-genomunun genomik əsasları |
| 2015 | NP | 7.43 | Evlilik izləri soyada aqronomik əhəmiyyət kəsb edən genomik bölgələri birləşdirir |
| 2018 | MP | 9.32 | Dünya miqyasında kolza birləşmələrinin kolleksiyasının bütöv genomunun təkrar ardıcıllığı onların ekotip fərqliliyinin genetik əsasını aşkar edir |
| 2022 | HR | 7.29 | Genom miqyaslı assosiasiya analizi qarpız toxumunun ölçüsünün təbii dəyişməsinə dair molekulyar anlayışlar təmin edir. |
