BMKGENE, Bioinformatikada Brifinqlərdə dərc edilmiş "STEEL, məkan-zaman transkriptomik məlumatların yüksək rezolyusiyada təsvirinə imkan verir" tədqiqatı üçün məkan transkriptom ardıcıllığı xidmətləri təqdim etdi.
Bu tədqiqat nəzarətsiz və çoxşaxəli öyrənməyə əsaslanan alqoritm təklif etdi, Spatial Transkriptom hüceyrə tipli qruplaşma (STEEL) bu, həm çox oxşar gen ifadə profillərini, həm də qrafiklər şəklində yaxın məkan məsafəsini nümayiş etdirən muncuqları qruplaşdırmaqla məkan transkriptomundan domenləri müəyyən edir.
10X Visium platformasından STEEL-in məkan transkriptomik məlumat dəstləri üzrə hərtərəfli qiymətləndirilməsi göstərir ki, o, siçan beyninin incə strukturlarını xarakterizə etmək üçün nəinki yüksək rezolyusiyaya nail olur, həm də fərdi olaraq təhlil edilən çoxlu toxuma slaydlarının daha böyük birinə inteqrasiyasına imkan verir.
Məkan transkriptom texnologiyalarının inkişafı ilə metodumuz domenin identifikasiyası və gen ifadəsi atlasının yenidən qurulmasında böyük tətbiqi olacaq.
klikləyinburadabu araşdırma haqqında daha çox öyrənmək üçün.
Göndərmə vaxtı: 20 oktyabr 2023-cü il