BMKGENE-nin müştərilərinin əsas nümunəsi kimi vəhşi müxtəlif tədqiqat növlərinin öyrənilməsi potensialını araşdırın.Bu yaxınlarda Plant Biotechnology Journal-ın builki sayında dərc olunmuş “Xromosom səviyyəsində Vəhşi Hevea brasiliensis Genomu: Genomik Yardımlı Yetiştirmənin Gücləndirilməsi və Yüksək Rezin Məhsuldarlığı üçün Vital Lokusların aşkarlanması” başlıqlı məqalə dəyərli istinad kimi dayanır.
Braziliya rezin ağacı (Hevea brasiliensis) əsas təbii kauçuk mənbəyi kimi ucadır.Keçən əsrdə ənənəvi heyvandarlıq metodologiyaları rezin istehsalında altı dəfə nəzərəçarpacaq artıma səbəb oldu.Bununla belə, potensial rezin məhsuldarlığının artmasına cavabdeh olan əsas genetik təməl sirli olaraq qalır.
Bu tədqiqat Nanopore uzun müddət oxunan ardıcıllıq, Illumina NGS ardıcıllığı və Hi-C texnologiyasının sinerjisindən istifadə edərək vəhşi rezin ağacı üçün xromosom səviyyəli genomun qurulmasına başladı.
Paralel olaraq, Illumina platformasından istifadə edərək hərtərəfli genomun təkrar ardıcıllığı (WGS) üçün yüksək məhsuldar variasiyaları, yabanı suşları və əlaqəli növləri əhatə edən 147 germplazma resursundan ibarət bir kolleksiya toplandı.Sonrakı ardıcıllıq məlumatları populyasiya strukturunun, müxtəlifliyin və əlaqə balanssızlığının parçalanmasına imkan verən ciddi populyasiya genetik təhlilindən keçdi.Bu təhlil populyasiyalar arasında əhliləşdirmə dəyişikliklərinə işıq salır.
Əlavə tədqiqatlar Fst, π, Tajima'nın D və LD-ni əhatə edən təhlili əhatə etdi və bu, təkmilləşdirilmiş lateks məhsuldarlığından irəli gələn seçim siqnallarını, xüsusən də Wickham klonlarına diqqət yetirməyi hədəflədi.
Genom Ümumi Assosiasiya Analizi (GWAS) ilə yekunlaşaraq, məhsul xüsusiyyətləri ilə əlaqəli markerlər və daha sonra məhsulla əlaqəli genlər dəqiq təyin olundu.İlkin qiymətləndirmə, iki ERF geni üçün fərqli mutantlar arasında fərqli transkripsiya fəaliyyətini ortaya qoydu və onların funksional əhəmiyyətinə ilkin nəzər saldı.Gələcək tədqiqatlar çərçivəsində əlavə təsdiqləmə planlaşdırılır.
BMKGENE bioinformatika analizində mühüm rolla yanaşı, bu böyük populyasiyanın geniş bütöv genomunun təkrar ardıcıllığına töhfə verməkdən qürur duyur.Bizim böyük təcrübəmiz NGS/TGS ardıcıllığı və 1000-dən çox növdən ibarət multiomik bioinformatika analizini əhatə edir.Qarşıdan gələn layihələrinizdə sizinlə tərəfdaşlıq perspektivini səbirsizliklə gözləyirik.
üçün bura klikləyinbu araşdırma haqqında daha çox məlumat əldə edin
Göndərmə vaxtı: 29 avqust 2023-cü il