-
Xromatin İmmunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq histon modifikasiyası, transkripsiya faktorları və digər DNT ilə əlaqəli zülallar üçün DNT hədəflərinin genom geniş profilini təmin edir.O, xüsusi zülal-DNT komplekslərini bərpa etmək üçün xromatin immuno-çökmənin (ChIP) seçiciliyini, bərpa edilmiş DNT-nin yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllığı üçün yeni nəsil ardıcıllığın (NGS) gücü ilə birləşdirir.Bundan əlavə, zülal-DNT kompleksləri canlı hüceyrələrdən bərpa olunduğu üçün bağlanma yerləri müxtəlif hüceyrə tipləri və toxumalarında və ya müxtəlif şəraitdə müqayisə oluna bilər.Tətbiqlər transkripsiya tənzimləməsindən tutmuş inkişaf yollarına, xəstəlik mexanizmlərinə və ondan kənara qədər dəyişir.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Bütün genom bisulfit ardıcıllığı
Sitozində (5-mC) beşinci mövqedə olan DNT metilasiyası gen ifadəsinə və hüceyrə aktivliyinə əsaslı təsir göstərir.Anormal metilasiya nümunələri xərçəng kimi bir sıra vəziyyət və xəstəliklərlə əlaqələndirilmişdir.WGBS, tək əsas rezolyusiyada genom boyu metilasyonu öyrənmək üçün qızıl standart halına gəldi.
Platforma: Illumina NovaSeq6000
-
Yüksək Ötürmə Ardıcıllığı ilə Transposaza Əlçatan Xromatinin Təhlili (ATAC-seq)
ATAC-seq, gen ifadəsinin qlobal epigenetik nəzarəti üçün vacib olan genom-geniş xromatin əlçatanlığının təhlili üçün yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllıq üsuludur.Ardıcıllıq adapterləri hiperaktiv Tn5 transposazası ilə açıq xromatin bölgələrinə daxil edilir.PCR gücləndirilməsindən sonra ardıcıllıq kitabxanası qurulur.Bütün açıq xromatin bölgələri yalnız bir transkripsiya faktorunun və ya müəyyən histon dəyişdirilmiş bölgənin bağlanma yerləri ilə məhdudlaşmır, müəyyən bir məkan-zaman şəraitində əldə edilə bilər.
-
Azaldılmış təmsil bisulfit ardıcıllığı (RRBS)
DNT metilasiyası tədqiqatı həmişə xəstəlik tədqiqatlarında aktual mövzu olmuşdur və gen ifadəsi və feno-tipik əlamətlərlə sıx bağlıdır.RRBS DNT metilasiyası tədqiqatı üçün dəqiq, səmərəli və qənaətcil üsuldur.Bisulfit ardıcıllığı ilə birlikdə promotor və CpG ada bölgələrinin fermentativ parçalanma (Msp I) ilə zənginləşdirilməsi yüksək rezolyusiyaya malik DNT metilasiyasının aşkarlanmasını təmin edir.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
