circRNA ardıcıllığı-Illumina
Xüsusiyyətləri
● rRNT-nin tükənməsi və ardınca istiqamətli kitabxananın hazırlanması, zəncirlərə xas olan məlumatların ardıcıllığını təmin edir.
● Bioinformatik iş axını circRNA-nın proqnozlaşdırılmasına və ifadənin kəmiyyətinə imkan verir
Xidmət Üstünlükləri
●Daha əhatəli RNT kitabxanaları:biz kitabxanaqabağı hazırlığımızda xətti RNT tükənməsi əvəzinə rRNT tükənməsindən istifadə edirik, ardıcıllıq məlumatlarına təkcə circRNA deyil, həm də mRNA və lncRNA daxil olmasını təmin edərək, bu məlumat dəstləri üzərində birgə analiz etməyə imkan veririk.
●Rəqabətli endogen RNT (ceRNA) şəbəkələrinin isteğe bağlı təhlili: hüceyrə tənzimləmə mexanizmləri haqqında daha dərin anlayışlar təmin edir
●Geniş Ekspertiza: BMK-da müxtəlif nümunə növləri və lncRNA layihələrini əhatə edən 20.000-dən çox nümunənin işlənməsi təcrübəsi ilə komandamız hər bir layihəyə zəngin təcrübə gətirir.
●Ciddi Keyfiyyətə Nəzarət: biz nümunə və kitabxananın hazırlanmasından tutmuş ardıcıllıq və bioinformatikaya qədər bütün mərhələlərdə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk.Bu dəqiq monitorinq ardıcıl yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
● Satışdan Sonra Dəstək: Bizim öhdəliyimiz 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti ilə layihənin tamamlanmasından kənara çıxır.Bu müddət ərzində biz nəticələrlə bağlı istənilən sualları həll etmək üçün layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması üçün yardım və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Platforma | Tövsiyə olunan məlumatlar | Data QC |
| Poly A zənginləşdirilmişdir | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Kons.(ng/μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Dürüstlük |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Zülal və ya DNT ilə çirklənmə məhduddur və ya yoxdur. | Bitkilər üçün: RIN≥6,5; Heyvanlar üçün: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; məhdud və ya əsas yüksəklik yoxdur |
● Bitkilər:
Kök, gövdə və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1,2 q
● Heyvan:
Ürək və ya bağırsaq: 450 mq
Daxili orqanlar və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 600 mq
Sümüklər, saçlar və ya dərilər: 1,5 q
● Buğumayaqlılar:
Həşəratlar: 9 q
xərçəngkimilər: 450 mq
● Tam qan:2 boru
● Hüceyrələr: 106 hüceyrələr
● Serum və Plazma: 6 ml
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner: 2 ml sentrifuqa borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+təkrar məsələn, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Göndərmə:
1. Quru buz: Nümunələr torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
2. RNT-stabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNAstable®) qurudula və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Akışı
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
circRNA proqnozu: xromosom paylanması
Diferensial İfadə edilmiş circRNAs - Vulkan süjeti
Diferensial şəkildə ifadə edilən circRNA-lar – iyerarxik klasterləşmə
circRNA-nın ev sahibi genlərinin funksional zənginləşdirilməsi
Nəşrlərin seçilmiş kolleksiyası vasitəsilə BMKGene'nin circRNA sıralama xidmətləri ilə asanlaşdırılan tədqiqat irəliləyişlərini araşdırın.
Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 hepatosellüler karsinomada circRNA əmələ gəlməsini və mikroRNT vasitəçiliyi ilə gen susdurulmasını tənzimləyir', Oncogene 2021 40:25, 40(25), səh. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. və başqaları.(2023) 'X oo-cavab verən transkriptom düyüdə OsARAB ifadəsini tənzimləməklə xəstəliklərə qarşı müqavimətdə dairəvi RNA133-ün rolunu ortaya qoyur', Fitopatologiya Tədqiqatı, 5(1), səh. 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. və başqaları.(2023) 'CPSF3 hepatoselüler karsinomada dairəvi və xətti transkriptlərin balansını modulyasiya edir'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Qaraciyər transplantasiyasından əvvəl və sonra sirotik kardiomiopatiyada circRNA-ların hərtərəfli qiymətləndirilməsi', Beynəlxalq İmmunofarmakologiya, 114, səh.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
