يعتمد تسلسل mRNA على تقنية تسلسل الجيل التالي (NGS) لالتقاط الحمض النووي الريبي المرسال (mRNA) من حقيقيات النوى في فترة محددة يتم تنشيط بعض الوظائف الخاصة.كان يُطلق على أطول نسخة مقسمة اسم "Unigene" واستخدمت كتسلسل مرجعي للتحليل اللاحق ، وهي وسيلة فعالة لدراسة الآلية الجزيئية والشبكة التنظيمية للأنواع دون الرجوع إليها.
بعد تجميع بيانات النسخ والتعليق التوضيحي الوظيفي unigene
(1) سيتم إجراء تحليل SNP وتحليل SSR وتنبؤ CDS وهيكل الجينات.
(2) سيتم إجراء القياس الكمي لتعبير unigene في كل عينة.
(3) سيتم اكتشاف unigenes المعبر عنها تفاضليًا بين العينات (أو المجموعات) بناءً على تعبير unigene
(4) سيتم إجراء التجميع والشرح الوظيفي وتحليل الإثراء للجينات المعبر عنها تفاضليًا