تسلسل الأجزاء المضخم للموقع المحدد (SLAF-Seq)
تفاصيل الخدمة
المخطط الفني
تدفق العمل
مزايا الخدمة
كفاءة عالية في اكتشاف العلامات- تساعد تقنية التسلسل عالي الإنتاجية SLAF-Seq في اكتشاف مئات الآلاف من العلامات داخل الجينوم بأكمله.
انخفاض الاعتماد على الجينوم- يمكن تطبيقه على الأنواع إما مع أو بدون الجينوم المرجعي.
تصميم مخطط مرن- هضم إنزيم واحد، وثنائي إنزيم، ومتعدد الإنزيمات وأنواع مختلفة من الإنزيمات، يمكن اختيارها جميعًا لتلبية أهداف أو أنواع بحثية مختلفة.يتم استخدام التقييم المسبق في السيليكو لضمان تصميم الإنزيم الأمثل.
كفاءة الهضم الأنزيمي- تم إجراء التجربة المسبقة لتحسين الظروف، مما يجعل التجربة الرسمية مستقرة وموثوقة.يمكن أن تصل كفاءة جمع الأجزاء إلى أكثر من 95%.
علامات SLAF موزعة بالتساوي- يتم توزيع علامات SLAF بالتساوي في جميع الكروموسومات إلى أقصى حد، حيث يصل متوسطها إلى 1 SLAF لكل 4 كيلو بايت.
التجنب الفعال للتكرار- يتم تقليل التسلسل التكراري في بيانات SLAF-Seq إلى أقل من 5%، خاصة في الأنواع ذات المستوى العالي من التكرارات، مثل القمح والذرة وغيرها.
خبرة واسعة- أكثر من 2000 مشروع مغلق لـ SLAF-Seq على مئات الأنواع التي تغطي النباتات والثدييات والطيور والحشرات والكائنات المائية وغيرها.
سير عمل المعلوماتية الحيوية المطور ذاتيًا- تم تطوير سير عمل المعلومات الحيوية المتكامل لـ SLAF-Seq بواسطة BMKGENE لضمان موثوقية ودقة المخرجات النهائية.
مواصفات الخدمة
| منصة | Conc. (نانوغرام / جل) | المجموع (ug) | أود260/280 |
| إلومينا نوفا سيك | >35 | >1.6(المجلد> 15μl) | 1.6-2.5 |
استراتيجية التسلسل الموصى بها
عمق التسلسل: 10X/علامة
| حجم الجينوم | علامات SLAF الموصى بها |
| <500 ميجابايت | 100 ألف أو WGS |
| 500 ميجا بايت - 1 جيجا بايت | 100 ك |
| 1 جيجا -2 جيجا | 200 ك |
| الجينومات العملاقة أو المعقدة | 300 - 400 ألف |
| التطبيقات
| مُستَحسَن مقياس السكان
| استراتيجية التسلسل والعمق
| |
| عمق
| رقم العلامة
| ||
| جواس
| رقم العينة ≥ 200
| 10X
|
وفق حجم الجينوم
|
| التطور الجيني
| الأفراد من كل المجموعة الفرعية ≥ 10؛ مجموع العينات ≥ 30
| 10X
| |
أوصى تسليم العينة
الحاوية: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل
بالنسبة لمعظم العينات، نوصي بعدم حفظها في الإيثانول.
وضع العلامات على العينات: يجب أن يتم تصنيف العينات بوضوح وأن تكون مطابقة لنموذج معلومات العينة المقدم.
الشحنة: الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس أولاً ودفنها في الثلج الجاف.
سير عمل الخدمة
عينة لمراقبة الجودة
تجربة تجريبية
تجربة SLAF
إعداد المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
1. إحصائيات نتيجة الخريطة
2. تطوير علامة SLAF
3. شرح الاختلاف
| سنة | مجلة | IF | عنوان | التطبيقات |
| 2022 | اتصالات الطبيعة | 17.694 | الأساس الجينومي لكروموسومات جيجا وجينوم جيجا لشجرة الفاوانيا بايونيا أوستي | سلاف-جواس |
| 2015 | عالم النبات الجديد | 7.433 | آثار أقدام التدجين ترسخ المناطق الجينومية ذات الأهمية الزراعية فيها فول الصويا | سلاف-جواس |
| 2022 | مجلة البحوث المتقدمة | 12.822 | الإدخالات الاصطناعية على نطاق الجينوم لـ Gossypium barbadense في G. hirsutum الكشف عن مواضع متفوقة للتحسين المتزامن لجودة ألياف القطن وإنتاجيتها سمات | SLAF-علم الوراثة التطوري |
| 2019 | النبات الجزيئي | 10.81 | يكشف تحليل الجينوم السكاني وجمعية دي نوفو عن أصل الأعشاب الضارة الأرز كلعبة تطورية | SLAF-علم الوراثة التطوري |
| 2019 | علم الوراثة الطبيعة | 31.616 | التسلسل الجينومي والتنوع الجيني لسمك الكارب الشائع Cyprinus carpio | خريطة الارتباط SLAF |
| 2014 | علم الوراثة الطبيعة | 25.455 | يوفر جينوم الفول السوداني المزروع نظرة ثاقبة للأنماط النووية للبقوليات، متعددة الصيغة الصبغية التطور وتدجين المحاصيل. | خريطة الارتباط SLAF |
| 2022 | مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية | 9.803 | يكشف تحديد ST1 عن اختيار يتضمن التنقل في مورفولوجيا البذور ومحتوى الزيت أثناء تدجين فول الصويا | تطوير SLAF-ماركر |
| 2022 | المجلة الدولية للعلوم الجزيئية | 6.208 | تحديد وتطوير علامة الحمض النووي لـ Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D) استبدال الكروموسوم الثنائي | تطوير SLAF-ماركر |
