-
التسلسل الميتاجينومي -NGS
يشير الميتاجينوم إلى مجموعة من المواد الوراثية الإجمالية لمجتمع مختلط من الكائنات الحية، مثل الميتاجينوم البيئي، والميتاجينوم البشري، وما إلى ذلك. ويحتوي على جينومات الكائنات الحية الدقيقة القابلة للزراعة وغير القابلة للزراعة.التسلسل الميتاجينومي هو أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط مع العوامل البيئية.
منصة:منصة إلومينا نوفا سيك
-
التسلسل الميتاجينومي-نانوبور
Metagenomics هي أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط مع العوامل البيئية، وما إلى ذلك. وقد تم مؤخرًا تقديم منصات تسلسل Nanopore للدراسات الميتاجينومية.أدى أدائه المتميز في طول القراءة إلى تعزيز التحليل الميتاجينومي للتيار السفلي إلى حد كبير، وخاصة تجميع الميتاجينوم.من خلال الاستفادة من طول القراءة، فإن دراسة الميتاجينوم المستندة إلى Nanopore قادرة على تحقيق تجميع أكثر استمرارًا مقارنةً بعلم الميتاجينوم الخاص بالبندقية.لقد تم نشر أن الميتاجينوميات المعتمدة على النانوبور نجحت في توليد جينومات بكتيرية كاملة ومغلقة من الميكروبات (Moss, EL, et. al,الطبيعة الحيوية، 2020)
منصة:نانوبور بروميثيون P48
-
16S/18S/ITS تسلسل Amplicon-PacBio
الوحدة الفرعية الموجودة في 16S و18S rRNA التي تحتوي على مناطق شديدة الحفظ ومتغيرة للغاية هي بصمة جزيئية مثالية لتحديد الكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة.من خلال الاستفادة من التسلسل، يمكن استهداف هذه الأمبليكونات بناءً على الأجزاء المحفوظة ويمكن وصف المناطق شديدة التغير بشكل كامل لتحديد هوية الميكروبات مما يساهم في الدراسات التي تغطي تحليل التنوع الميكروبي، والتصنيف، والتطور، وما إلى ذلك. ) تسلسل منصة PacBio يتيح الحصول على قراءات طويلة دقيقة للغاية، والتي يمكن أن تغطي amplicons كاملة الطول (حوالي 1.5 كيلو بايت).إن الرؤية الواسعة للمجال الوراثي عززت إلى حد كبير الدقة في شرح الأنواع في مجتمع البكتيريا أو الفطريات.
منصة:باكبيو تتمة الثاني
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
يهدف تسلسل amplicon 16S/18S/ITS إلى الكشف عن السلالة والتصنيف ووفرة الأنواع في مجتمع ميكروبي من خلال فحص منتجات PCR للعلامات الجينية للتدبير المنزلي التي تحتوي على أجزاء شديدة التباين ومتغيرة للغاية.إن إدخال هذه البصمات الجزيئية المثالية بواسطة Woeses et al (1977) يمكّن من تحديد ملامح الميكروبيوم الخالي من العزلة.تسلسل 16S (البكتيريا)، 18S (الفطريات) والفاصل الداخلي المكتوب (ITS، الفطريات) يسمح بتحديد كل من الأنواع الوفيرة وكذلك الأنواع النادرة وغير المحددة.أصبحت هذه التكنولوجيا أداة رئيسية مطبقة على نطاق واسع في تحديد التركيب الميكروبي التفاضلي في بيئات مختلفة، مثل الفم البشري والأمعاء والبراز، وما إلى ذلك.
منصة:منصة إلومينا نوفا سيك
-
إعادة تسلسل الجينوم البكتيري والفطري الكامل
تعد إعادة تسلسل الجينوم البكتيري والفطري بأكمله أداة حاسمة لاستكمال جينومات البكتيريا والفطريات المعروفة، وكذلك لمقارنة الجينومات المتعددة أو رسم خريطة جينومات الكائنات الحية الجديدة.من الأهمية بمكان إجراء تسلسل جينومات كاملة من البكتيريا والفطريات من أجل توليد جينومات مرجعية دقيقة، وللقيام بتحديد الميكروبات ودراسات الجينوم المقارنة الأخرى.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
تسلسل ميتاتترانسكريبتوم
يحدد تسلسل Metatranscriptome التعبير الجيني للميكروبات (سواء حقيقيات النوى أو بدائيات النوى) داخل البيئات الطبيعية (مثل التربة والماء والبحر والبراز والأمعاء). وعلى وجه التحديد، تسمح لك هذه الخدمات بالحصول على ملف تعريف كامل للتعبير الجيني للمجتمعات الميكروبية المعقدة، والتحليل التصنيفي. الأنواع، وتحليل الإثراء الوظيفي للجينات المعبر عنها بشكل مختلف، والمزيد.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
الجينوم الفطري
توفر Biomarker Technologies مسح الجينوم والجينوم الدقيق والجينوم الكامل للفطريات اعتمادًا على هدف بحثي محدد.يمكن تحقيق تسلسل الجينوم والتجميع والشرح الوظيفي من خلال الجمع بين تسلسل الجيل التالي وتسلسل الجيل الثالث لتحقيق تجميع الجينوم عالي المستوى.يمكن أيضًا استخدام تقنية Hi-C لتسهيل تجميع الجينوم على مستوى الكروموسوم.
منصة:باكبيو تتمة الثاني
نانوبور بروميثيون P48
منصة إلومينا نوفا سيك
-
البكتيريا الجينوم الكامل
توفر Biomarker Technologies خدمة التسلسل لبناء الجينوم الكامل للبكتيريا مع عدم وجود فجوة.يتضمن سير العمل الرئيسي لبناء الجينوم الكامل للبكتيريا تسلسل الجيل الثالث، والتجميع، والشرح الوظيفي، وتحليل المعلومات الحيوية المتقدم لتحقيق أهداف بحثية محددة.إن التوصيف الأكثر شمولاً لجينوم البكتيريا يُمكّن من الكشف عن الآليات الأساسية الكامنة وراء عملياتها البيولوجية، والتي يمكن أن توفر أيضًا مرجعًا قيمًا للأبحاث الجينومية في الأنواع حقيقية النواة الأعلى.
منصة:نانوبور بروميثيون بي 48 + منصة إلومينا نوفا سيك
باكبيو تتمة الثاني
