تسلسل الجينوم الكامل للنبات/الحيوان
1.مزايا الخدمة
خبرة واسعة في تسلسل الجينوم لأكثر من 1000 نوع.
أكثر من 800 حالة منشورة مع عامل تأثير تراكمي يزيد عن 4000.
تحليل شامل للمعلوماتية الحيوية بشأن استدعاء الاختلاف وتحليل الوظائف.
2. مواصفات الخدمة
| منصة | مكتبة | عمق التسلسل الموصى به | |
| إلومينا | بي اي 150 | بالنسبة لـ SNP، مكالمات InDel ≥ 10x بالنسبة للاتصالات SV وCNY ≥ 30x
| |
| نانوبور
| 8 كيلو بايت | بالنسبة للاتصالات SV وCNY ≥ 20x | |
| باكبيو | احتجاز ثاني أكسيد الكربون | 15 كيلو بايت | بالنسبة للاتصالات SNP وInDel وSV وCNY ≥ 10x |
3. متطلبات العينة
| منصة | Conc.(نانوغرام /μL)
| المبلغ (نانوغرام)
| نقاء
| هلام الاغاروز
| ||
| أود260/280 | أود260/230 | 1. مسح النطاق الرئيسي بدون أو محدودلوحظ التدهور على هلام. 2. عدم وجود تلوث بالحمض النووي الريبي (RNA) أو البروتين أو وجوده بشكل محدود
| ||||
| إلومينا | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| نانوبور
| ≥30 | يعتمد على العائد البيانات 10 ميكروجرام/خلية | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| باكبيو | احتجاز ثاني أكسيد الكربون | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. تحليل المعلومات الحيوية
5. تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
تسليم البيانات
1) إحصائيات رسم خرائط الجينوم
الجدول بالحجم الكامل
الشكل 1: توزيع حجم الإدراج وتغطية القراءة.
2) كشف التباين
الشكل 2: إحصائيات وشروح SNP/INDEL/SV بين العينات
الشكل 3: توزيع الجينوم على نطاق واسع من vatiations
3) الشرح الوظيفي للاختلافات
| 2019 | اتصالات الطبيعة | تكشف إعادة تسلسل الجينوم الكامل عن أصل Brassica napus والمواقع الوراثية المشاركة في تحسينه |
| 2020 | بناس | الأصل التطوري وتاريخ تدجين الأسماك الذهبية (Carassius auratus) |
| 2021 | مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية | الجينومات المرجعية لنوعي الجوت المزروعتين |
| 2021 | مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية | التواقيع الجينومية للنباتات والبذور الزيتية متعددة الصبغيات Brassicajuncea والمواقع الوراثية التي تتحكم في تراكم الجلوكوزينات |
| 2019 | النبات الجزيئي | تكشف إعادة تسلسل الجينوم الكامل لمجموعة عالمية من مدخلات بذور اللفت عن الأساس الجيني لانحراف النمط البيئي |
| 2022 | بحوث البستنة | يوفر تحليل الارتباط على مستوى الجينوم رؤى جزيئية حول التباين الطبيعي لحجم بذور البطيخ |
| 2021 | مجلة علم النبات التجريبي | تحدد دراسة الارتباط على مستوى الجينوم متغيرات GhSAD1 التي تمنح تحمل البرد في القطن |
| 2021 | مجلة علم النبات التجريبي | تكشف دراسة الارتباط على مستوى الجينوم ومقارنة النسخ عن جينات QTL الجديدة والجينات المرشحة التي تتحكم في حجم البتلة في بذور اللفت |
