BMKCloud Log in
条形banner-03

أخبار

تطور الجينوم

الجينوم دي نوفو
التجميع|تحديد الجنس تم توفير أعمال التسلسل الكاملة وخدمات المعلومات الحيوية الجزئية بواسطة Biomarker Techonologies.

خلاصة

"يشتمل النمط الظاهري المميز لتنانين البحر على زوائد تشبه الأوراق، وفم أنبوبي بلا أسنان، وحمل الذكور الذي يتضمن حضانة البيض المخصب على "رقعة حضنة" مفتوحة.قمنا بتسلسل الجينومات الذكرية والأنثوية الجديدة لسمك تنين البحر الشائع (Phyllopteryx taeniolatus) والأنواع المرتبطة به ارتباطًا وثيقًا، وهي سمكة التمساح الأنبوبية (Syngnathoides biaculeatus).تُظهر ملفات النسخ من حداثة تطورية، وهي الزوائد الشبيهة بالأوراق، أن مجموعة من الجينات التي تشارك عادةً في تطوير الزعانف قد تم اختيارها بالإضافة إلى إثراء النصوص النصية لإصلاح الأنسجة المحتملة وجينات الدفاع المناعي.تم العثور على طفرات الزرد لـ scpp5، والتي فقدت في جميع Syngnathids، تفتقر إلى أسنان بلعومية أو مشوهة، مما يدعم الفرضية القائلة بأن فقدان scpp5 ساهم في فقدان الأسنان في Syngnathids.تم التعرف على موضع مفترض لتحديد الجنس يرمز لجين amhr2y الخاص بالذكور والذي يتقاسمه سمك تنين البحر الشائع وسمكة التمساح الأنبوبية. "

المواد والأساليب:

مواد

Fتنين البحر المشترك لدينا (P. تينيولاتوس) واثنين من أسماك التمساح الأنبوبية (S. بيكوليتوس) العينات.تم استخدام فردين من تنين البحر الشائع (ذكر وأنثى واحدة) واثنين من أسماك التمساح الأنبوبية (ذكر وأنثى واحدة) لتسلسل الجينوم الكامل، وتم استخدام فردين آخرين من تنين البحر الشائع من الذكور لإعادة تسلسل الجينوم.

استراتيجية تسلسل الجينوم

2تم استخدام مكتبة 70/350 نقطة أساس (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) أو Nanopore 30 Kb (MinION) + Hi-C (NovaSeq 6000). التسلسل، واثنين آخرين من ذكور تنين البحر الشائع لإعادة تسلسل الجينوم.

تسلسل النسخ

Fأو تم جمع تنين البحر الشائع، والدماغ، والعين، والخياشيم، والكبد، والقلب، والكلى، والمساريقا، والأمعاء، والعضلات، والزعانف، والجلد، والزوائد الشبيهة بالأوراق، والخصية، والمبيض.

استراتيجية تجميع الجينوم دي نوفو

Canu (تصحيح) + WTDBG2 (التجميع) + Pilon (بولندي) + Lachesis (Hi-C).

نتائج رئيسية

الشكل-1.-الملامح الرئيسية-للشائع-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-aligator-pipefish-S

الشكل 1. الملامح الرئيسية لسمكة تنين البحر الشائع (P. taeniolatus) وسمكة التمساح الأنبوبية (S. biaculeatus) ومواقعها التطورية.

شكل-2.-مورفولوجيا-و-التركيب-الوراثي-للزوائد الشبيهة بالأوراق-في-المشترك-seadragon-P

الشكل 2. التشكل والتركيب الجيني للزوائد الشبيهة بالأوراق في تنين البحر الشائع (P. taeniolatus).

الشكل-3.-الجين المفترض لتحديد الجنس-في-المشترك-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-aligator-pipefish-S.-biaculeatus

الشكل 3. الجين المفترض لتحديد الجنس في تنين البحر الشائع (P. taeniolatus) وسمكة التمساح الأنبوبية (S. biaculeatus).

الشكل-4

الشكل. 4. الأنماط الظاهرية للأسنان البلعومية في طفرات متجانسة الزرد scpp5.


وقت النشر: 08 يناير 2022

أرسل رسالتك إلينا: