الميكروبيال
أدى التوافق البكتيري والتثبيت مع الفحم الحيوي إلى تحسين تدهور التيبوكونازول وتكوين ميكروبيوم التربة وعمله
كامل طول 16S تسلسل amplicon |باكبيو هاي فاي |تنوع ألفا |تنوع بيتا
في هذه الدراسة، تم توفير تسلسل amplicon 16S كامل الطول بواسطة PacBio وتحليل المعلومات الحيوية بواسطة Biomarker Technologies.
يسلط الضوء
تمت دراسة بكتيريا الفحم الحيوي المحللة للتيبوكونازول Alcaligenes faecalis WZ-2 على كفاءة التحلل الحيوي وتأثيرها على التربة الملوثة بالتيبوكونازول مقارنة بالسلالة الحرة المهينة WZ-2.
1. أظهر WZ-2 المثبت بالفحم الحيوي تدهورًا أكثر كفاءة في التيبوكونازول مقارنةً بـ WZ-2 المجاني عن طريق تقليل نصف عمر التيبوكونازول في التربة من 18.7 يومًا إلى 13.3 يومًا.
2. تمكن WZ-2 المثبت بالفحم الحيوي من استعادة أنشطة إنزيمات التربة الميكروبية الأصلية، بما في ذلك اليورياز، ونازعة الهيدروجين، والإنكرتاز، وما إلى ذلك.
3. إن المظهر الميكروبي في التربة المعالجة بالفحم الحيوي WZ-2 والتي تم تحديدها بواسطة تسلسل 16S كامل الطول يدعم بقوة أن هذا النظام يمكن أن يستعيد صحة التربة عن طريق تحسين بنية المجتمع البكتيري تحت تلوث تيبوكونازول.
التجربة (المتعلقة بالتسلسل)
التجمع: CK: التربة الطبيعية؛T: التربة المملوءة بالتيبوكونازول؛S: يحتوي تيبوكونازول على تربة ذات سلالة حرة WZ-2؛قبل الميلاد: احتوى تيبوكونازول على تربة تحتوي على الفحم الحيوي؛BCS: يحتوي تيبوكونازول على تربة تحتوي على الفحم الحيوي WZ-2.
أخذ العينات: إجمالي استخراج الحمض النووي للتربة تضخيمه الاشعال 16S المتاشب
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ′) و1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA)،يمثل الحمض النووي الريبوزي 16S كامل الطول
منصة التسلسل: PacBio RS II
استراتيجية التسلسل: يقرأ CCS HIFI
تحليل البيانات:BMKCloudتجعل منصة المعلومات الحيوية السمكة الذهبية نظامًا نموذجيًا وراثيًا ممتازًا لفسيولوجيا الأسماك وتطورها.
نتيجة
تم تحديد بنية المجتمع الميكروبي للتربة بواسطة تسلسل 16S rDNA.تم تقييم مؤشر ثراء OTU وتنوع ألفا، بما في ذلك مؤشرات Chao1 وAce وShannon وSimpson للكشف عن تنوع الأنواع في كل نظام.وبعد 60 يومًا من الحضانة، أظهرت جميع المؤشرات اتجاهًا مماثلاً، أي أن تيبوكونازول يمكن أن يؤدي إلى انخفاض في ثراء الأنواع وتنوعها في التربة.ومع ذلك، بإضافة سلالة WZ-2، تم استعادة مجتمع بكتيريا التربة جزئيًا من حيث الثراء والتنوع.وقد لوحظ اختلاف محدود بين BC وBCS وCK، مما يشير إلى أن الفحم الحيوي والفحم الحيوي WZ-2 يمكن أن يستعيدا الصحة البيولوجية للتربة بشكل فعال.
تم تطبيق طريقة المجموعة الزوجية غير الموزونة مع الوسائل الحسابية (UPGMA) في هذه الدراسة لإظهار تنوع بيتا بين المجموعات.كما هو مبين في الشكل التالي، شاركت BC وBSC وCK في نمط أكثر تشابهًا من التركيب الميكروبي مقارنة بالمجموعة T وS، مما يشير أيضًا إلى أن إدخال الفحم الحيوي في المعالجة الحيوية للتربة الملوثة بالتبوكونازول يمكن أن يسهل إلى حد كبير استعادة المجتمع الميكروبي في التربة.
شكل.تجميع UPGMA للمجتمع البكتيري على مستوى اللجوء تحت علاج مختلف
مرجع
صن، تونغ، وآخرون."التوافق البكتيري وعدم الحركة مع الفحم الحيوي أدى إلى تحسين تدهور التيبوكونازول وتكوين ميكروبيوم التربة وعمله."مجلة المواد الخطرة398 (2020): 122941.
الأخبار ويسلط الضوء يهدف إلى مشاركة أحدث الحالات الناجحة مع Biomarker Technologies، والتقاط الإنجازات العلمية الجديدة بالإضافة إلى التقنيات البارزة المطبقة أثناء الدراسة.
وقت النشر: 08 يناير 2022