أخبار

تم التعرف على تضخيم العناصر القابلة للنقل (TE) كقوة دافعة للتوسط في توسيع حجم الجينوم وتطوره، لكن العواقب المترتبة على تشكيل البنية الجينومية ثلاثية الأبعاد تظل غير معروفة إلى حد كبير في النباتات.هنا، قمنا بالإبلاغ عن تجميعات الجينوم ذات الدرجة المرجعية لثلاثة أنواع من القطن يتراوح حجمها ثلاثة أضعاف حجم الجينوم، وهي:الجوسيبيوم روتونديفوليوم(ك2)،G. المشتل(أ2)، وجي ريموندي(D5)، باستخدام تقنيات أكسفورد نانوبور.توثق تحليلات الجينوم المقارنة تفاصيل تضخيم TE الخاص بالنسب الذي يساهم في الاختلافات الكبيرة في حجم الجينوم (K2، 2.44 جيجا بايت؛ A2، 1.62 جيجا بايت؛ D5، 750.19 ميجا بايت)، وتشير إلى محتوى الجينات المحفوظ نسبيًا والعلاقات المتزامنة بين الجينومات.لقد وجدنا أن ما يقرب من 17٪ من الجينات التخليقية تظهر تغيرًا في حالة الكروماتين بين الأجزاء النشطة ("A") وغير النشطة ("B")، وارتبط تضخيم TE بزيادة نسبة المقصورة A في مناطق الجينات (حوالي 7000 جين ) في K2 وA2 نسبة إلى D5.تم الحفاظ على 42٪ فقط من حدود مجال الارتباط الطوبولوجي (TAD) بين الجينومات الثلاثة.تشير بياناتنا إلى التضخيم الأخير لـ TEs بعد تشكيل حدود TAD الخاصة بالنسب.تلقي هذه الدراسة الضوء على دور توسع الجينوم بوساطة الترانسبوزون في تطور بنية الكروماتين ذات الترتيب العالي في النباتات.