BMKCloud Log in
条形banner-03

أخبار

الجينوم

Nature_Communications_Logo

التجميع على نطاق الكروموسوم وتحليل جينوم محصول الكتلة الحيوية Miscanthus lutarioriparius

تسلسل نانوبور |الومينا |مرحبا سي |تسلسل الحمض النووي الريبي |علم تطور السلالات

في هذه الدراسة، قدمت Biomarker Technologies الدعم الفني بشأن تسلسل Nanopore، وتجميع الجينوم de novo، والتجميع بمساعدة Hi-C، وما إلى ذلك.

خلاصة

ميسكانثوس، نبات معمر جذري، لديه إمكانات كبيرة لإنتاج الطاقة الحيوية لكتلته الحيوية العالية وتحمله للإجهاد.لقد أبلغنا عن تجميع على نطاق الكروموسوم لـميسكانثوس لوتاريوريباريوسالجينوم من خلال الجمع بين تسلسل Oxford Nanopore وتقنيات Hi-C.يغطي التجميع 2.07 جيجا بايت 96.64% من الجينوم، مع contig N50 يبلغ 1.71 ميجا بايت.يتم تجميع تسلسلات السنترومير والتيلومير لجميع الكروموسومات الـ 19 والكروموسوم 10 على التوالي.تم تأكيد أصل Allotetraploid لـ M. lutarioriparius باستخدام تكرارات الأقمار الصناعية المركزية.تم توضيح بنية الجينوم رباعي الصيغة الصبغية والعديد من عمليات إعادة ترتيب الكروموسومات بالنسبة للذرة الرفيعة.جنبا إلى جنب الجينات المكررةM. lutarioripariusيتم إثراءها وظيفيًا ليس فقط فيما يتعلق بالاستجابة للضغط، ولكن أيضًا بالتخليق الحيوي لجدار الخلية.تم توسيع وتطوير عائلات الجينات المرتبطة بمقاومة الأمراض والتخليق الحيوي لجدار الخلية ونقل الأيونات المعدنية بشكل كبير.قد يكون توسع هذه العائلات أساسًا جينيًا مهمًا لتعزيز السمات المميزة للكائنات الحيةM. lutarioriparius.

الإحصائيات الرئيسية لتجميع الجينوم

أخبار-1
أخبار-2

شكل.نظرة عامة على مجموعة الجينوم M. lutarioriparius

الأخبار ويسلط الضوء يهدف إلى مشاركة أحدث الحالات الناجحة مع Biomarker Technologies، والتقاط الإنجازات العلمية الجديدة بالإضافة إلى التقنيات البارزة المطبقة أثناء الدراسة.


وقت النشر: 05 يناير 2022

أرسل رسالتك إلينا: