-
التسلسل الميتاجينومي (NGS)
يشير Metagenome إلى مجموعة من المواد الوراثية الكلية لمجتمع مختلط من الكائنات الحية ، مثل الميتاجينوم البيئي ، والميتاجينوم البشري ، وما إلى ذلك. ويحتوي على جينومات لكائنات دقيقة قابلة للزراعة وغير قابلة للزراعة.التسلسل الميتاجينومي هو أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية ، والتي توفر معلومات مفصلة في تنوع الأنواع ووفرتها ، وهيكل السكان ، وعلاقة النشوء والتطور ، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط بالعوامل البيئية.
برنامج:إلومينا نوفا
-
التسلسل الميتاجينومي-نانوبور
Metagenomics هي أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية ، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها ، وهيكل السكان ، وعلاقة التطور ، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط بالعوامل البيئية ، وما إلى ذلك. وقد أدخلت منصات تسلسل Nanopore مؤخرًا للدراسات الميتاجينومية.عزز أدائها المتميز في طول القراءة إلى حد كبير التحليل الميتاجينومي للتيار السفلي ، وخاصة تجميع الميتاجينوم.من خلال الاستفادة من قراءة الطول ، فإن الدراسة الميتاجينومية القائمة على المسام النانوية قادرة على تحقيق تجميع أكثر استمرارًا مقارنةً بعلم الجينات الجينية.لقد تم نشر أن علم الجينوميات المستندة إلى Nanopore أنتجت بنجاح جينومات بكتيرية كاملة ومغلقة من الميكروبيومات (Moss ، EL ، وآخرون ،طبيعة التكنولوجيا الحيوية، 2020)
برنامج:Nanopore PromethION P48
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
الوحدة الفرعية الموجودة على الرنا الريباسي 16S و 18S التي تحتوي على مناطق محمية للغاية ومتغيرة للغاية هي بصمة جزيئية مثالية لتحديد الكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة.الاستفادة من التسلسل ، يمكن استهداف هذه الأمبليكونات بناءً على الأجزاء المحفوظة ويمكن وصف المناطق شديدة التباين بشكل كامل لتحديد الميكروبات المساهمة في الدراسات التي تغطي تحليل التنوع الميكروبي ، والتصنيف ، والتطور ، وما إلى ذلك. جزيء واحد في الوقت الحقيقي (SMRT ) يتيح تسلسل منصة PacBio الحصول على قراءات طويلة عالية الدقة ، والتي يمكن أن تغطي أمبليكونات كاملة الطول (حوالي 1.5 كيلو بايت).أدى العرض الواسع للمجال الجيني إلى تحسين الدقة في شرح الأنواع في مجتمع البكتيريا أو الفطريات.
برنامج:PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
يهدف تسلسل أمبليكون 16S / 18S / ITS إلى الكشف عن علم التطور ، والتصنيف ، ووفرة الأنواع في المجتمع الميكروبي من خلال التحقيق في منتجات PCR للعلامات الجينية التدبيرية التي تحتوي على أجزاء متغيرة ومتغيرة للغاية.إن إدخال هذه البصمات الجزيئية المثالية بواسطة Woeses et al (1977) يتيح تنميط الميكروبيوم الخالي من العزل.يسمح تسلسل 16S (البكتيريا) و 18 S (الفطريات) والفاصل المكتوب الداخلي (ITS ، الفطريات) بتحديد كل من الأنواع الوفيرة وكذلك الأنواع النادرة وغير المحددة.أصبحت هذه التقنية أداة رئيسية مطبقة على نطاق واسع في تحديد التركيب الميكروبي التفاضلي في بيئات مختلفة ، مثل فم الإنسان والأمعاء والبراز ، إلخ.
برنامج:إلومينا نوفا
-
إعادة تسلسل الجينوم الكامل البكتيري والفطري
تعد إعادة التسلسل الكامل للجينوم البكتيري والفطري أداة مهمة لإكمال جينومات البكتيريا والفطريات المعروفة ، وكذلك لمقارنة جينومات متعددة أو لرسم خريطة جينومات لكائنات جديدة.من الأهمية بمكان إجراء تسلسل جينومات كاملة للبكتيريا والفطريات لتوليد جينومات مرجعية دقيقة ، ولتحديد الجراثيم ودراسات الجينوم المقارنة الأخرى.
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
-
الجينوم الفطري
توفر Biomarker Technologies مسحًا للجينوم وجينومًا دقيقًا وجينومًا كاملًا للفطريات اعتمادًا على هدف بحث محدد.يمكن تحقيق تسلسل الجينوم والتجميع والشرح الوظيفي من خلال الجمع بين تسلسل الجيل التالي + تسلسل الجيل الثالث لتحقيق تجميع الجينوم عالي المستوى.يمكن أيضًا استخدام تقنية Hi-C لتسهيل تجميع الجينوم على مستوى الكروموسوم.
برنامج:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
إلومينا نوفاسيك 6000
-
الجينوم الكامل للبكتيريا
تقدم Biomarker Technologies خدمة التسلسل في بناء جينوم كامل للبكتيريا بدون فجوة.يتضمن سير العمل الرئيسي لبناء الجينوم الكامل للبكتيريا تسلسل الجيل الثالث ، والتجميع ، والتعليق التوضيحي الوظيفي ، وتحليل المعلومات الحيوية المتقدم الذي يحقق أهدافًا بحثية محددة.إن تحديد أكثر شمولاً لجينوم البكتيريا يمكّن من الكشف عن الآليات الأساسية الكامنة وراء عملياتها البيولوجية ، والتي يمكن أن توفر أيضًا مرجعاً قيماً لأبحاث الجينوم في الأنواع عالية النواة.
برنامج:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
