-
تسلسل جينوم النبات / الحيوان دي نوفو
من جديديشير التسلسل إلى بناء الجينوم الكامل للأنواع باستخدام تقنيات التسلسل ، مثل PacBio و Nanopore و NGS وما إلى ذلك ، في غياب الجينوم المرجعي.لقد أتاح التحسن الملحوظ في طول القراءة لتقنيات تسلسل الجيل الثالث فرصًا جديدة في تجميع الجينومات المعقدة ، مثل تلك التي تحتوي على نسبة عالية من الزيجوت المتغاير ، ونسبة عالية من المناطق المتكررة ، ومتعدد الصيغ الصبغيات ، وما إلى ذلك. حل العناصر المتكررة والمناطق التي تحتوي على محتويات غير طبيعية من GC ومناطق أخرى شديدة التعقيد.
النظام الأساسي ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
مرحبا- C على أساس الجمعية الجينوم
Hi-C هي طريقة مصممة لالتقاط تكوين الكروموسوم من خلال الجمع بين فحص التفاعلات القائمة على التقارب والتسلسل عالي الإنتاجية.يُعتقد أن شدة هذه التفاعلات مرتبطة سلبًا بالمسافة المادية على الكروموسومات.لذلك ، يمكن لبيانات Hi-C أن توجه تجميع وترتيب وتوجيه التسلسلات المجمعة في مسودة الجينوم وترسيخها على عدد معين من الكروموسومات.تعمل هذه التقنية على تمكين تجميع الجينوم على مستوى الكروموسوم في حالة عدم وجود خريطة جينية قائمة على السكان.كل جينوم واحد يحتاج إلى Hi-C.
النظام الأساسي ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
علم الوراثة التطوري
علم الوراثة التطوري هو خدمة تسلسل معبأة مصممة لتوفير تفسير شامل للمعلومات التطورية لمواد معينة بناءً على الاختلافات الجينية ، بما في ذلك SNPs و InDels و SVs و CNVs.يوفر جميع التحليلات الأساسية المطلوبة لوصف التغيرات التطورية والسمات الجينية للسكان ، مثل التركيب السكاني ، والتنوع الجيني ، وعلاقات التطور ، إلخ. كما يحتوي على دراسات حول تدفق الجينات ، والتي تمكن من تقدير حجم السكان الفعال ، ووقت الاختلاف.
-
علم الجينوم المقارن
علم الجينوم المقارن يعني حرفيا مقارنة تسلسل الجينوم الكامل وهياكل الأنواع المختلفة.يهدف هذا الانضباط إلى الكشف عن تطور الأنواع ، ووظيفة الجينات ، وآلية تنظيم الجينات على مستوى الجينوم من خلال تحديد هياكل التسلسل والعناصر التي حفظت أو تميزت عبر الأنواع المختلفة.تتضمن دراسة الجينوميات المقارنة النموذجية تحليلات في عائلة الجينات ، والتطور التطوري ، وتكرار الجينوم الكامل ، والضغط الانتقائي ، وما إلى ذلك.
-
تحليل منفصل مجمعة
تحليل الفصل المجمع (BSA) هو أسلوب يستخدم لتحديد الواسمات الجينية المرتبطة بالنمط الظاهري بسرعة.يحتوي سير العمل الرئيسي لـ BSA على اختيار مجموعتين من الأفراد مع أنماط ظاهرية متعارضة للغاية ، وتجميع الحمض النووي لجميع الأفراد لتشكيل مجموعتين من الحمض النووي ، وتحديد التسلسلات التفاضلية بين مجموعتين.تم استخدام هذه التقنية على نطاق واسع في تحديد العلامات الجينية المرتبطة بقوة بالجينات المستهدفة في جينومات النبات / الحيوان.
