منشورات مميزة

التعمق في إمكانية دراسة مجموعة متنوعة من أنواع الأبحاث البرية، والتي تتمثل في حالة محورية من عملاء BMKGENE.نُشر مؤخرًا في عدد هذا العام من مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية، المقال الذي يحمل عنوان "جينوم الهيفيا البرازيلية البرية على مستوى الكروموسوم: تمكين التكاثر بمساعدة الجينوم واكتشاف المواقع الحيوية لزيادة إنتاجية المطاط" يعتبر مرجعًا قيمًا.

تقف شجرة المطاط البرازيلية (Hevea brasiliensis) شامخة كمصدر محوري للمطاط الطبيعي.طوال القرن الماضي، أدت منهجيات التربية التقليدية إلى زيادة ملحوظة في إنتاج المطاط بمقدار ستة أضعاف.ومع ذلك، فإن الأساس الجيني الكامن وراء التحسين المحتمل لإنتاج المطاط لا يزال غامضا.

شرعت هذه الدراسة في بناء جينوم على مستوى الكروموسوم لشجرة المطاط البرية، وذلك باستخدام تآزر تسلسل Nanopore طويل القراءة، وتسلسل Illumina NGS، وتقنية Hi-C.

بالتوازي، تم تجميع مجموعة من 147 من موارد الأصول الوراثية، التي تشمل الاختلافات عالية الإنتاجية والسلالات البرية والأنواع ذات الصلة، من أجل إعادة التسلسل الشامل للجينوم (WGS) باستخدام منصة Illumina.خضعت بيانات التسلسل التي تلت ذلك لتحليل دقيق لعلم الوراثة السكانية، مما مكن من تشريح التركيبة السكانية والتنوع واختلال التوازن في الارتباط.يسلط هذا التحليل الضوء على اختلافات التدجين بين المجموعات السكانية.

وشملت التحقيقات الإضافية التحليل الذي يشمل Fst وπ وTajima's D وLD، بهدف الكشف عن إشارات الاختيار الناشئة عن تحسين إنتاجية اللاتكس، مع التركيز بشكل خاص على استنساخ ويكهام.

وبلغت ذروتها في تحليل الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS)، وتم تحديد العلامات المرتبطة بصفات المحصول وبالتالي الجينات المرتبطة بالمحصول.كشف التحقق الأولي عن أنشطة نسخية مميزة عبر طفرات مختلفة لاثنين من جينات ERF، مما يوفر لمحة أولية عن أهميتها الوظيفية.ومن المقرر إجراء مزيد من التأييد في البحوث المقبلة.

تفخر BMKGENE بمساهمتها في إعادة تسلسل الجينوم الشامل لهذه المجموعة الكبيرة من السكان، إلى جانب دور كبير في تحليل المعلوماتية الحيوية.تشمل خبرتنا الواسعة تسلسل NGS/TGS وتحليل المعلومات الحيوية المتعددة الأبعاد عبر مجموعة من أكثر من 1000 نوع.ونحن نتطلع إلى احتمال الشراكة معك في مشاريعك القادمة.

انقر هنا لتعلم المزيد عن هذه الدراسة