تسلسل DNA/RNA – مُسلسل النانو
تفاصيل الخدمة المميزات
| منصة | حجم المكتبة | إنتاجية البيانات النظرية (لكل خلية) | دقة قاعدة واحدة | التطبيقات |
| نانوبور | 8 كيلو بايت، 10 كيلو بايت، 20 كيلو بايت، Ultralong، cDNA-PCR | 70-90 جيجابايت/خلية | 85-92% | استدعاء SV، De novo، التسلسل الكامل، Iso-Seq، الشرح الجيني، الكشف عن مثيلة الحمض النووي |
مزايا الخدمة
● أكثر من 5 سنوات من الخبرة في منصة PacBio للتسلسل مع آلاف المشاريع المغلقة بمختلف الأنواع.
● BMKGENE شريك رسمي لـ Oxford Nanopore، مع شهادة RNA/DNA ثنائية المنصة.
● هناك نماذج سائدة من أجهزة التسلسل المزودة بمعدات كاملة وإنتاجية كافية للتسلسل.
● استنادًا إلى منصة Nanopore، تم نشر أكثر من 10 أبحاث حول الحيوانات والنباتات حول دينوفو في مجلات عالمية مشهورة.
متطلبات العينة
| نوع العينة | كمية | التركيز (Qubit ®) | مقدار | نقاء | آحرون |
| الحمض النووي الجيني | تعتمد على متطلبات البيانات | ≥20ng/ميكروليتر | ≥15 ميكرولتر | أود260/280=1.7-2.2؛ OD260/230≥1.5؛ ذروة واضحة عند 260 نانومتر، بدون تلوث | يجب قياس التركيز بواسطة Qubit وQubit/Nanopore ≥ 2 |
| مجموع الحمض النووي الريبي | ≥1.2 ميكروغرام | ≥100 ميكروغرام / ميكرولتر | ≥15 ميكرولتر | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5؛ لا يوجد تلوث | قيمة RIN ≥7.5 |
سير عمل الخدمة
إعداد عينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
تسليم المشروع
تقييم جودة بيانات عينة الحمض النووي
الجدول 1. إحصاءات عن البيانات النظيفة.
| BMKID | RawSeqNum | com.rawSumBase | CleanSeqNum | com.cleanSumBase | CleanN50Len | نظيفN90Len | CleanMeanLen | com.cleanMaxLen | CleanMeanQual |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
تقييم جودة البيانات لعينة الحمض النووي الريبي (RNA).
الجدول 1. إحصاءات عن البيانات النظيفة.
| اسم الملف | معرف العميل | رقم القراءة | الرقم الأساسي | N50 | متوسط الطول | الحد الاقصى للطول | يعنيQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | س12 |
الشكل 1. قراءة توزيع الطول
الشكل 2. توزيع نقاط الجودة للبيانات النظيفة
الشكل 3. طول وتوزيع نقاط الجودة للبيانات النظيفة
