التحليل المنفصل المجمع
مزايا الخدمة
تاكاجي وآخرون، مجلة النبات، 2013
● التوطين الدقيق: خلط الكتل مع 30+30 إلى 200+200 فرد لتقليل الضوضاء في الخلفية؛تنبؤ المنطقة المرشحة غير المترادفة على أساس الطفرات.
● تحليل شامل: شرح متعمق لوظيفة الجينات المرشحة، بما في ذلك NR، وSwissProt، وGO، وKEGG، وCOG، وKOG، وما إلى ذلك.
● وقت تنفيذ أسرع: توطين سريع للجينات خلال 45 يوم عمل.
● خبرة واسعة: ساهمت BMK في توطين الآلاف من السمات، والتي تغطي أنواعًا متنوعة مثل المحاصيل والمنتجات المائية والغابات والزهور والفواكه وما إلى ذلك.
مواصفات الخدمة
سكان:
فصل ذرية الوالدين ذوي الأنماط الظاهرية المتعارضة.
على سبيل المثال ذرية F2، Backcrossing (BC)، خط التكاثر المؤتلف (RIL)
تجمع الخلط
للصفات النوعية: 30 إلى 50 فرداً (الحد الأدنى 20)/الجملة
بالنسبة للتراتيس الكمي: أعلى 5% إلى 10% من الأفراد الذين لديهم أي من الأنماط الظاهرية المتطرفة في جميع السكان (الحد الأدنى 30+30).
عمق التسلسل الموصى به
على الأقل 20X/الأب و1X/الفرد (على سبيل المثال بالنسبة لمجموعة خلط النسل المكونة من 30+30 فردًا، سيكون عمق التسلسل 30X لكل كتلة)
تحليلات المعلوماتية الحيوية
● إعادة تسلسل الجينوم بأكمله
● معالجة البيانات
● الاتصال SNP/Indel
● فحص المنطقة المرشحة
● الشرح وظيفة الجينات المرشحة
متطلبات العينة والتسليم
متطلبات العينة:
النيوكليوتيدات:
| عينة الحمض النووي | عينة الأنسجة |
| التركيز: ≥30 نانوغرام/ميكروليتر | النباتات: 1-2 جم |
| الكمية: ≥2 ميكروغرام (الحجم ≥15 ميكرولتر) | الحيوانات: 0.5-1 جم |
| النقاء: OD260/280 = 1.6-2.5 | الدم الكامل: 1.5 مل |
تدفق عمل الخدمة
تصميم التجربة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
1. قاعدة تحليل الارتباط على المسافة الإقليدية (ED) لتحديد المنطقة المرشحة.في الشكل التالي
المحور السيني: رقم الكروموسوم؛تمثل كل نقطة قيمة ED لـ SNP.يتوافق الخط الأسود مع قيمة ED المجهزة.تشير قيمة ED الأعلى إلى وجود ارتباط أكثر أهمية بين الموقع والنمط الظاهري.يمثل الخط المتقطع الأحمر عتبة الارتباط الهام.
2. تحليل الارتباط لا يعتمد على مؤشر SNP
المحور السيني: رقم الكروموسوم؛تمثل كل نقطة قيمة فهرس SNP.يرمز الخط الأسود إلى قيمة مؤشر SNP المجهزة.كلما كانت القيمة أكبر، كلما كان الارتباط أكثر أهمية.
قضية بي إم كيه
يشفر موضع السمة الكمية ذو التأثير الرئيسي Fnl7.1 بروتينًا وفيرًا في مرحلة التطور الجنيني المتأخر يرتبط بطول عنق الفاكهة في الخيار
نشرت: مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية، 2020
استراتيجية التسلسل:
الآباء (Jin5-508، YN): إعادة تسلسل الجينوم الكامل لـ 34 × و20 ×.
مجموعات الحمض النووي (50 طويلة العنق و50 قصيرة العنق): إعادة التسلسل لـ 61× و52×
النتائج الرئيسية
في هذه الدراسة، تم إنشاء فصل السكان (F2 وF2:3) عن طريق عبور خط الخيار طويل العنق Jin5-508 وخط YN قصير العنق.تم إنشاء مجموعتين من الحمض النووي بواسطة 50 فردًا من ذوي الرقبة الطويلة للغاية و50 فردًا من ذوي الرقبة القصيرة للغاية.تم تحديد التأثير الرئيسي QTL على Chr07 من خلال تحليل BSA ورسم خرائط QTL التقليدية.تم تضييق المنطقة المرشحة بشكل أكبر من خلال رسم الخرائط الدقيقة وتقدير التعبير الجيني والتجارب المعدلة وراثيا، والتي كشفت عن الجين الرئيسي في التحكم في طول الرقبة، CsFnl7.1.بالإضافة إلى ذلك، وجد أن تعدد الأشكال في منطقة المروج CsFnl7.1 يرتبط بالتعبير المقابل.اقترح المزيد من التحليل الوراثي أن موضع Fnl7.1 من المحتمل جدًا أن يكون نشأ من الهند.
 رسم خرائط QTL في تحليل BSA لتحديد المنطقة المرشحة المرتبطة بطول عنق الخيار |  تم تحديد ملفات تعريف LOD لـ QTL بطول رقبة الخيار في Chr07 |
شو، إكس، وآخرون."يشفر موضع السمة الكمية ذو التأثير الرئيسي Fnl7.1 بروتينًا وفيرًا في مرحلة التطور الجنيني المتأخر يرتبط بطول عنق الفاكهة في الخيار."مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية 18.7(2020).
