-
ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል-Nanopore
የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ለአጠቃላይ የትራንስክሪፕት ትንተና በዋጋ ሊተመን የማይችል መሳሪያ ነው።ምንም ጥርጥር የለውም፣ ተለምዷዊ የአጭር-ንባብ ቅደም ተከተል እዚህ ውስጥ ብዙ ጠቃሚ እድገቶችን አግኝቷል።ቢሆንም፣ ብዙ ጊዜ በሙሉ ርዝመት አይሶፎርም መለያዎች፣ መጠናዊ፣ PCR አድልዎ ላይ ገደቦች ያጋጥመዋል።
የናኖፖር ቅደም ተከተል እራሱን ከሌሎች ተከታታይ መድረኮች ይለያል, ምክንያቱም ኑክሊዮታይዶች ያለ ዲ ኤን ኤ ውህደት በቀጥታ ይነበባሉ እና ረጅም ንባብ በአስር ኪሎባዝ ያመነጫሉ.ይህ በቀጥታ የተነበበ የሙሉ ርዝመት ግልባጮችን ማቋረጫ እና በአይሶፎርም-ደረጃ ጥናቶች ውስጥ ያሉ ተግዳሮቶችን ለመቋቋም ኃይል ይሰጣል።
መድረክ:ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን
ቤተ መጻሕፍት፡ሲዲኤንኤ-PCR
-
ደ ኖቮ ሙሉ-ርዝመት ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል -PacBio
ደ ኖቮየሙሉ ርዝመት ግልባጭ ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም በመባል ይታወቃልደ ኖቮኢሶ-ሴክ የሙሉ ርዝመት ሲዲኤንኤ ሞለኪውሎችን ያለ ምንም እረፍት ቅደም ተከተል ለማስያዝ የPacBio ተከታታዮችን ጥቅሞች በንባብ ርዝመት ይወስዳል።ይህ በጽሁፍ ግልባጭ የመሰብሰቢያ ደረጃዎች ውስጥ የሚፈጠሩ ማናቸውም ስህተቶችን ሙሉ በሙሉ ያስወግዳል እና የዩኒጂን ስብስቦችን በአይሶፎርም ደረጃ ይገነባል።ይህ ዩኒጂን ስብስቦች ኃይለኛ የጄኔቲክ መረጃን እንደ “ማጣቀሻ ጂኖም” በግልባጭ-ደረጃ ያቀርባል።በተጨማሪም፣ ከቀጣዩ ትውልድ ተከታታይ መረጃ ጋር በማጣመር፣ ይህ አገልግሎት የኢሶፎርም-ደረጃ አገላለጽ ትክክለኛ መጠንን ያጎናጽፋል።
መድረክ፡- PacBio Sequel IIቤተ-መጽሐፍት: SMRT ደወል ቤተ መጻሕፍት -
Eukaryotic mRNA ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
mRNA ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ ከሴሎች የተገለበጡ ሁሉንም mRNAs ፕሮፋይል ማድረግ ያስችላል።የጂን አገላለጽ መገለጫን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና የአንዳንድ ባዮሎጂካል ሂደቶችን ሞለኪውላዊ ዘዴዎችን ለማሳየት ኃይለኛ ቴክኖሎጂ ነው።እስካሁን ድረስ፣ የኤምአርኤንኤ ቅደም ተከተል በመሠረታዊ ምርምር፣ በክሊኒካዊ ምርመራ፣ በመድኃኒት ልማት፣ ወዘተ በስፋት ተቀጥሯል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
በማጣቀሻ ላይ የተመሰረተ mRNA ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
mRNA sequencing መልእክተኛውን አር ኤን ኤ (ኤምአርኤን) ለማንሳት የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል ቴክኒክን (NGS) ይጠቀማል ይህም በተወሰነ ጊዜ ውስጥ አንዳንድ ልዩ ተግባራት እየሰሩ ነው።በጣም ረጅሙ የጽሑፍ ግልባጭ 'Unigene' ተብሎ ይጠራ ነበር እና ለቀጣይ ትንተና እንደ ማመሳከሪያ ቅደም ተከተል ያገለግል ነበር ፣ ይህ ውጤታማ ዘዴ የዝርያውን ሞለኪውላዊ ዘዴ እና የቁጥጥር መረብን ያለማጣቀሻ ለማጥናት ነው።
ከተገለበጠ መረጃ ከተሰበሰበ እና ዩኒጂን ተግባራዊ ማብራሪያ በኋላ
(1) የSNP ትንተና፣ የኤስኤስአር ትንተና፣ የሲዲኤስ ትንበያ እና የጂን አወቃቀር ይዘጋጃሉ።
(2) በእያንዳንዱ ናሙና ውስጥ የዩኒጂን አገላለጽ መጠን ይከናወናል.
(3) በናሙናዎች (ወይም ቡድኖች) መካከል በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ዩኒጂኖች በዩኒጂን አገላለጽ ላይ ተመስርተው ይገኛሉ።
(4) በልዩነት የተገለጹ ዩኒጂንስ ክላስተር፣ ተግባራዊ ማብራሪያ እና ማበልጸጊያ ትንተና ይከናወናል።
-
ረጅም ኮድ ያልሆነ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ረጅም ኮድ ያልሆኑ አር ኤን ኤዎች (lncRNAs) ከ 200 nt በላይ ርዝመት ያላቸው የአር ኤን ኤ ሞለኪውሎች አይነት ናቸው፣ እነዚህም እጅግ በጣም ዝቅተኛ በሆነ ኮድ የመፃፍ አቅም ተለይተው ይታወቃሉ።LncRNA፣ ኮድ በማይሰጡ አር ኤን ኤዎች ውስጥ እንደ ቁልፍ አባል፣ በዋናነት በኒውክሊየስ እና በፕላዝማ ውስጥ ይገኛል።የቴክኖሎጂ እና የባዮኢንፎርሜሽን ቅደም ተከተል እድገት በርካታ ልብ ወለድ lncRNAዎችን ለመለየት እና እነዚያን ከባዮሎጂካል ተግባራት ጋር ለማያያዝ ያስችላል።የተጠራቀሙ መረጃዎች እንደሚያመለክቱት lncRNA በሰፊው በኤፒጄኔቲክ ደንብ ፣ በግልባጭ ጽሁፍ እና በድህረ-ጽሑፍ ደንብ ውስጥ ይሳተፋል።
-
አነስተኛ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ትንሽ አር ኤን ኤ የሚያመለክተው ኮዲንግ ያልሆኑ አር ኤን ኤ ሞለኪውሎችን ክፍል ሲሆን ይህም አብዛኛውን ጊዜ ከ200nt ያነሰ ርዝመት ያላቸው ማይክሮ አር ኤን ኤ (ሚ አር ኤን ኤ)፣ አነስተኛ ጣልቃ ገብነት አር ኤን ኤ (ሲአርኤን) እና ፒዊ መስተጋብር አር ኤን ኤ (ፒአርኤን)ን ጨምሮ።
ማይክሮ አር ኤን ኤ (ሚ አር ኤን ኤ) በሴሎች ውስጥ የተለያዩ ጠቃሚ የቁጥጥር ሚናዎችን የሚጫወት ከ20-24nt ርዝማኔ ያለው ውስጣዊ የአነስተኛ አር ኤን ኤ ክፍል ነው።miRNA በብዙ የህይወት ሂደቶች ውስጥ የተሳተፈ ሲሆን ይህም ቲሹን - ልዩ እና ደረጃን - የተለየ መግለጫ እና በተለያዩ ዝርያዎች ውስጥ በጣም ተጠብቆ ይገኛል።
-
የሰርአርኤን ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ሙሉ ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል ሁሉንም አይነት አር ኤን ኤ ሞለኪውሎችን ለመገለጽ የተነደፈ ነው፣ ኮድ ማድረግ (ኤምአርኤን) እና ኮድ የማይሰጡ አር ኤን ኤዎች (lncRNA፣ cirRNA እና miRNA ን ጨምሮ) በተወሰነ ጊዜ በተወሰኑ ህዋሶች የተገለበጡ ናቸው።አጠቃላይ የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም “ጠቅላላ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል” በመባልም ይታወቃል፣ ዓላማው ሁሉን አቀፍ የቁጥጥር መረቦችን በግልባጭ ደረጃ ለማሳየት ነው።የኤንጂኤስ ቴክኖሎጂን በመጠቀም የሙሉ ትራንስክሪፕት ምርቶች ቅደም ተከተሎች ለሴአርኤንኤ ትንተና እና ለጋራ አር ኤን ኤ ትንተና ይገኛሉ፣ ይህም ወደ ተግባራዊ ባህሪይ የመጀመሪያውን እርምጃ ይሰጣል።ሰርአርአና-ሚርኤን-ኤምአርኤን ላይ የተመሰረተ ceRNA የቁጥጥር አውታረ መረብን ያሳያል።
-
ሙሉ የጽሑፍ ቅደም ተከተል - ኢሉሚና
ሙሉ ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል ሁሉንም አይነት አር ኤን ኤ ሞለኪውሎችን ለመገለጽ የተነደፈ ነው፣ ኮድ ማድረግ (ኤምአርኤን) እና ኮድ የማይሰጡ አር ኤን ኤዎች (lncRNA፣ cirRNA እና miRNA ን ጨምሮ) በተወሰነ ጊዜ በተወሰኑ ህዋሶች የተገለበጡ ናቸው።አጠቃላይ የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም “ጠቅላላ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል” በመባልም ይታወቃል፣ ዓላማው ሁሉን አቀፍ የቁጥጥር መረቦችን በግልባጭ ደረጃ ለማሳየት ነው።የኤንጂኤስ ቴክኖሎጂን በመጠቀም የሙሉ ትራንስክሪፕት ምርቶች ቅደም ተከተሎች ለሴአርኤንኤ ትንተና እና ለጋራ አር ኤን ኤ ትንተና ይገኛሉ፣ ይህም ወደ ተግባራዊ ባህሪይ የመጀመሪያውን እርምጃ ይሰጣል።ሰርአርአና-ሚርኤን-ኤምአርኤን ላይ የተመሰረተ ceRNA የቁጥጥር አውታረ መረብን ያሳያል።
-
ፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የሚቀጥለውን ትውልድ ቅደም ተከተል (NGS) በመጠቀም የተንቀሳቃሽ ስልክ ትራንስክሪፕት ለውጥን በመተንተን በተወሰነ ቅጽበት የአር ኤንኤን መኖር እና መጠን ያሳያል።የኩባንያችን ፕሮካርዮቲክ አር ኤን ኤ ሲኬንሲንግ በተለይ ፕሮካርዮቴስን ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር ያነጣጠረ፣ እርስዎን የትራንስክሪፕት ፕሮፋይሊንግ፣ የጂን አወቃቀር ትንተና እና የመሳሰሉትን ያቀርብልዎታል። በመሠረታዊ የሳይንስ ምርምር፣ የመድኃኒት ጥናትና ምርምር እና ሌሎችም ላይ በስፋት ተተግብሯል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
Metatranscriptome ቅደም ተከተል
Metatranscriptome ቅደም ተከተል በተፈጥሮ አካባቢ (ማለትም አፈር፣ ውሃ፣ ባህር፣ ሰገራ እና አንጀት) ውስጥ የሚገኙትን ረቂቅ ተህዋሲያን (ሁለቱም eukaryotes እና prokaryotes) የጂን አገላለፅን ይለያል።በተለይ ይህ አገልግሎት ውስብስብ የሆኑ ረቂቅ ተህዋሲያን ማህበረሰቦችን አጠቃላይ የጂን መግለጫ እንድታገኙ ይፈቅድልሃል። የዝርያዎች, በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ጂኖች ተግባራዊ ማበልጸጊያ ትንተና እና ሌሎችም.
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
