አነስተኛ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
የአገልግሎት ጥቅሞች
● በ 5 'መጨረሻ ላይ ያለው የመጀመሪያው መሠረት ዩ የተወሰኑ አር ኤን ኤዎችን እንዲያገኝ ከፍተኛ ምርጫ አለው።
● ሚአርኤን ኢላማ የተደረገ የጂን ትንበያ
● መረጃው ከ mRNA ጋር የጋራ ትንተና ለማድረግ ይጠቅማል
● ሚአርአና ልዩነት መግለጫ
● ሚአርኤን ኢላማ የተደረገ የጂን ትንበያ
● በ BMKCloud ላይ የተመሰረተ የውጤት አቅርቦት፡ ብጁ የውሂብ ማዕድን በመድረክ ላይ ይገኛል።
● ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች ፕሮጀክቱ ሲጠናቀቅ ለ 3 ወራት ያገለግላል
ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ
| ቤተ መፃህፍት | መድረክ | የሚመከር ውሂብ | ውሂብ QC |
| sRNA | ኢሉሚና SE50 | 10M/20M ይነበባል | Q30≥85% |
የናሙና መስፈርቶች፡
ኑክሊዮታይዶች;
| ኮንክ.(ng/μl) | መጠን (μg) | ንጽህና | ታማኝነት |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት በጄል ላይ አይታይም። | ለእጽዋት፡ RIN≥7.5; ለእንስሳት፡ RIN≥8.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; የተገደበ ወይም የመነሻ ከፍታ የለውም |
*ከ 5 ሚ.ግ በታች ለሆኑ ቲሹዎች ፍላሽ የቀዘቀዘ (ፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ) ቲሹ ናሙና ለመላክ እንመክራለን።
የሕዋስ መታገድ፡ የሕዋስ ብዛት = 3×107
* የቀዘቀዙ የሴል ሊዛትን ለመላክ እንመክራለን።ያ ሕዋስ ከ5×10 ያነሰ ቢቆጠር5በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ የቀዘቀዘ ብልጭታ ይመከራል።
የደም ናሙናዎች;
PA × geneBloodRNATube;
6mlTRIzol እና 2ml ደም (TRIzol:ደም=3:1)
የሚመከር ናሙና ማድረስ
መያዣ፡
2 ሚሊር ሴንትሪፉጅ ቱቦ (ቲን ፎይል አይመከርም)
የናሙና መሰየሚያ፡ ቡድን+ ማባዛት ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3;B1፣ B2፣ B3......
መላኪያ፡
1.Dry-ice: ናሙናዎች በከረጢቶች ውስጥ ተጭነው በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው.
2.RNAstable tubes፡ የአር ኤን ኤ ናሙናዎች በአር ኤን ኤ ማረጋጊያ ቱቦ (ለምሳሌ RNAstable®) ውስጥ ይደርቃሉ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ይላካሉ።
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
ናሙና መላኪያ
አር ኤን ኤ ማውጣት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
ባዮኢንፎርማቲክስ
1.miRNA መለያ
በmiRDeep2 የተተነበየው እያንዳንዱ የልቦለድ ሚአርኤን ቀዳሚ እጩ አወቃቀሩን እና የጥልቀቱን ቅደም ተከተል የሚያሳይ ፒዲኤፍ ምስል አለው።
የ miRNA ቅድመ መዋቅር እና የቅደም ተከተል ጥልቀት
2.KEGG የDE-miRNA የታለሙ ጂኖች ማበልጸግ
በዚህ ክፍለ ጊዜ፣ ባዮማርከር መንገዶቹ በDE-miRNA ላይ ያነጣጠሩ ጂኖች ከመጠን በላይ የቀረቡ መሆናቸውን በመጀመሪያ መረመረ።የማበልጸጊያ ሁኔታዎች እና የአሳ አጥማጆች ሙከራ የማበልጸጊያ ዲግሪ እና የመንገዱን አስፈላጊነት ለመወሰን ተተግብረዋል።የማበልጸጊያ ስሌት ስሌት ከዚህ በታች ይታያል.
በDE-miRNA ላይ ያነጣጠሩ ጂኖች ላይ የKEGG መንገድ ማበልጸጊያ
3.GO ማበልጸጊያ ትንተና በDE-miRNA ላይ ያነጣጠሩ ጂኖች
ክላስተር ፕሮፋይለር በDE-miRNA ላይ ያነጣጠሩ ጂኖች ላይ በGO ማበልጸጊያ ትንተና ተቀጥሮ ነበር።የቃላቶቹን ተዋረዳዊ መዋቅር ለማሳየት የበለጸጉ ቃላት ቀጥተኛ አሲክሊክ ግራፍ ተፈጠረ።በሥዕሉ ላይ፣ የቀስቶች አቅጣጫ በቃላት መካከል ያለውን የመደመር ግንኙነቶችን ይወክላል፣ ማለትም አንጓዎቹ ከላይኛው አንጓዎቻቸው የበለጠ የተለዩ ናቸው።የDE-miRNA ኢላማ የተደረገ ጂኖች ዳይሬክት አሲሊሊክ ግራፍ ከዚህ በታች ባለው ስእል ታይቷል።
TopGO DE-miRNA ላይ ያነጣጠሩ ጂኖች አሲክሊክ ግራፍ መርቷል።
BMK መያዣ
ከስጋ ጥራት ጋር የተቆራኙ የሚአርኤን እና ጂኖች የተቀናጀ ትንተና Gga-MiR-140-5p በዶሮዎች ውስጥ በጡንቻ ውስጥ የስብ ክምችት ላይ ተጽዕኖ እንደሚያሳድር ያሳያል።
የታተመሴሉላር ፊዚዮሎጂ እና ባዮኬሚስትሪ፣2018
ቁልፍ ውጤቶች
ዘግይቶ የመኝታ ጊዜ ዶሮዎች ከወጣት ዶሮዎች ያነሰ የአለም አቀፋዊ መግለጫ ማይአርኤን አሳይተዋል።
የስጋ ጥራት ላይ ተጽእኖ ሊያሳድር የሚችል የ ሚርኤንኤ-ኤምርና ተቆጣጣሪ መረብ ተሰራ
gga-miR-140-5p RXRGን በመቆጣጠር የ adipocyte ልዩነትን ያበረታታል።
 gga-miR-140-5p የ RXRG 3'UTR ላይ በማነጣጠር የዶሮ ጡንቻ ጡንቻ ቅድመ-አድፖሳይት ልዩነትን ያበረታታል። |
ማጣቀሻ
ዣንግ ኤም ፣ ሊ ዲኤች ፣ ሊ ኤፍ ፣ እና ሌሎችም።ከስጋ ጥራት ጋር የተቆራኙ የሚአርአና እና ጂኖች የተቀናጀ ትንተና Gga-MiR-140-5p በዶሮዎች ውስጥ የጡንቻ ውስጥ ስብ ክምችት ላይ ተጽዕኖ እንደሚያሳድር ያሳያል[J]።ሴሉላር ፊዚዮሎጂ እና ባዮኬሚስትሪ, 2018: 2421-2433.ዶአይ፡ 10.1159/000489649
