-
ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
የነጠላ ሴል ቀረጻ እና የግለሰብ ቤተመፃህፍት ግንባታ ቴክኒክ ከከፍተኛ ደረጃ ቅደም ተከተል ጋር በማጣመር የጂን አገላለጽ በሴል ላይ ጥናት ለማድረግ ያስችላል።ውስብስብ በሆኑ የሕዋስ ህዝቦች ላይ ጥልቅ እና የተሟላ የሥርዓት ትንተና እንዲኖር ያስችላል፣ በዚህ ውስጥ የሁሉንም ህዋሶች አማካኝ በመውሰድ የልዩነታቸውን መደበቅ በእጅጉ ያስወግዳል።
ይሁን እንጂ አንዳንድ ሴሎች ወደ ነጠላ ሕዋስ እገዳ ለመሥራት ተስማሚ አይደሉም, ስለዚህ ሌሎች የናሙና ዝግጅት ዘዴዎች - ኒውክሊየስ ከቲሹዎች ማውጣት ያስፈልጋሉ, ማለትም, ኒውክሊየስ በቀጥታ ከቲሹዎች ወይም ሴል ተወስዶ ወደ ነጠላ-ኒውክሊየስ እገዳ ለነጠላ- የሕዋስ ቅደም ተከተል.
BMK ባለ 10× ጂኖሚክስ ChromiumTM ነጠላ ሴል አር ኤን ኤ ተከታታይ አገልግሎት ይሰጣል።ይህ አገልግሎት ከበሽታ ጋር በተያያዙ ጥናቶች እንደ የበሽታ ተከላካይ ሕዋሳት ልዩነት ፣የእጢ ልዩነት ፣ የሕብረ ሕዋሳት እድገት ፣ ወዘተ ባሉ ጥናቶች ላይ በሰፊው ጥቅም ላይ ውሏል።
የቦታ ትራንስክሪፕት ቺፕ፡ 10× ጂኖሚክስ
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የእፅዋት/የእንስሳ ሙሉ ጂኖም ቅደም ተከተል
ሙሉ የጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል፣ እንዲሁም WGS በመባል የሚታወቀው፣ ነጠላ ኑክሊዮታይድ ፖሊሞርፊዝም (SNP)፣ የማስገባት ስረዛ (InDel)፣ የመዋቅር ልዩነት (SV) እና የቁጥር ልዩነትን (CNV) ጨምሮ በጠቅላላው ጂኖም ላይ ሁለቱንም የተለመዱ እና ያልተለመዱ ሚውቴሽን ለማሳየት ያስችላል። ).SVs ከ SNPs የበለጠ የልዩነት መሰረቱን ይይዛሉ እና በጂኖም ላይ የበለጠ ተፅእኖ አላቸው ፣ ይህም በህያዋን ፍጥረታት ላይ ከፍተኛ ተጽዕኖ ያሳድራል።ረጅም ንባቦች እንደ ታንደም ተደጋጋሚ፣ ጂሲ/ኤቲ-የበለፀጉ ክልሎች እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎች ባሉ ውስብስብ ክልሎች ላይ ክሮሞሶም መሻገርን በጣም ቀላል ስለሚያደርግ የረጅም ጊዜ ንባቦችን እና የተወሳሰቡ ልዩነቶችን በበለጠ ትክክለኛነት ለመለየት ያስችላል።
መድረክ፡ ኢሉሚና፣ ፓክባዮ፣ ናኖፖሬ
-
BMKMANU S1000 የቦታ ትራንስክሪፕት
የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ በሳይንሳዊ ፈጠራዎች ግንባር ቀደም ነው ፣ ይህም ተመራማሪዎች የቦታ አውድ ጠብቀው በቲሹዎች ውስጥ ወደ ውስብስብ የጂን አገላለጽ ዘይቤዎች እንዲገቡ ኃይል ይሰጣል።በተለያዩ መድረኮች መካከል BMKGene BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chipን በጉራ ሠርቷል።የተሻሻለ መፍትሄየ 5µM፣ ወደ ንዑስ ሴሉላር ክልል መድረስ እና ማንቃትባለብዙ-ደረጃ ጥራት ቅንብሮች.ወደ 2 ሚሊዮን የሚጠጉ ቦታዎችን የያዘው S1000 ቺፕ ማይክሮዌል (ማይክሮዌል) በቦታ ባርኮድ የተቀረጹ የቀረጻ መመርመሪያዎች በተጫኑ ዶቃዎች ተደራርበው ይጠቀማል።በቦታ ባርኮዶች የበለፀገ የሲዲኤንኤ ቤተ-መጽሐፍት ከS1000 ቺፕ ተዘጋጅቶ በመቀጠል በኢሉሚና ኖቫ ሴክ መድረክ ላይ ተከትሏል።የቦታ ባርኮድ ናሙናዎች እና ዩኤምአይዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ልዩነት ያረጋግጣል።የ BMKManu S1000 ቺፕ ልዩ ባህሪው ሁለገብነቱ ላይ ነው፣ይህም በተለያዩ ህብረ ህዋሶች እና የዝርዝሮች ደረጃዎች ላይ በጥሩ ሁኔታ የሚስተካከሉ ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንብሮችን ያቀርባል።ይህ የመላመድ ችሎታ ቺፑን ለተለያዩ የቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ጥናቶች ምርጥ ምርጫ አድርጎ ያስቀምጠዋል፣ ይህም ትክክለኛ የቦታ ስብስቦችን በትንሹ ጫጫታ ያረጋግጣል።
BMKManu S1000 ቺፕ እና ሌሎች የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ቴክኖሎጂዎችን በመጠቀም ተመራማሪዎች ስለ ህዋሶች የቦታ አደረጃጀት እና በቲሹዎች ውስጥ ስለሚፈጠሩ ውስብስብ ሞለኪውላዊ መስተጋብር የተሻለ ግንዛቤን ሊያገኙ ይችላሉ፣ ይህም ጨምሮ በተለያዩ መስኮች ውስጥ ባዮሎጂያዊ ሂደቶችን የሚመለከቱ ስልቶችን በዋጋ ሊተመን የማይችል ግንዛቤን ይሰጣል። ኦንኮሎጂ, ኒውሮሳይንስ, የእድገት ባዮሎጂ, የበሽታ መከላከያ እና የእፅዋት ጥናቶች.
መድረክ፡ BMKManu S1000 ቺፕ እና ኢሉሚና ኖቫሴክ
-
10x ጂኖሚክስ ቪዚየም የቦታ ትራንስክሪፕት
ስፓሻል ትራንስክሪፕቶሚክስ ተመራማሪዎች የቦታ አውድ ጠብቀው በቲሹዎች ውስጥ ያሉትን የጂን አገላለጽ ዘይቤዎች እንዲመረምሩ የሚያስችል ቴክኖሎጂ ነው።በዚህ ጎራ ውስጥ አንድ ኃይለኛ መድረክ 10x Genomics Visium ከኢሉሚና ቅደም ተከተል ጋር ተጣምሮ ነው።የ 10X Visium መርህ የቲሹ ክፍሎች የሚቀመጡበት በተሰየመ የመያዣ ቦታ ባለው ልዩ ቺፕ ላይ ነው።ይህ የተቀረጸበት ቦታ ባርኮድ የተደረገባቸው ቦታዎች አሉት፣ እያንዳንዱም በቲሹ ውስጥ ካለው ልዩ የቦታ ቦታ ጋር ይዛመዳል።ከቲሹ ውስጥ የተያዙት አር ኤን ኤ ሞለኪውሎች በተገላቢጦሽ የመገልበጥ ሂደት ውስጥ በልዩ ሞለኪውላዊ መለያዎች (UMIs) ምልክት ይደረግባቸዋል።እነዚህ ባርኮድ የተደረገባቸው ቦታዎች እና ዩኤምአይዎች በአንድ ሴል ጥራት ትክክለኛ የቦታ ካርታ እና የጂን አገላለጽ መጠንን ያነቃሉ።የቦታ ባርኮድ ናሙናዎች እና ዩኤምአይዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ልዩነት ያረጋግጣል።ተመራማሪዎች ይህንን የስፔሻል ትራንስክሪፕቶሚክስ ቴክኖሎጂን በመጠቀም ስለ ሴሎች የቦታ አደረጃጀት እና በቲሹዎች ውስጥ ስለሚፈጠሩ ውስብስብ ሞለኪውላዊ መስተጋብር ጥልቅ ግንዛቤን ሊያገኙ ይችላሉ፣ ይህም ኦንኮሎጂን፣ ኒውሮሳይንስን፣ የእድገት ባዮሎጂን፣ ኢሚውኖሎጂን ጨምሮ በተለያዩ መስኮች ባዮሎጂካል ሂደቶች ላይ በዋጋ ሊተመን የማይችል ግንዛቤን ይሰጣል። , እና የእጽዋት ጥናቶች.
መድረክ: 10X Genomics Visium እና Illumina NovaSeq
-
ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል-ናኖፖር
በኤንጂኤስ ላይ የተመሰረተ ኤምአርኤን ቅደም ተከተል ለጂን አገላለጽ መለኪያ እንደ ሁለገብ መሳሪያ ሆኖ ሲያገለግል፣ በአጫጭር ንባቦች ላይ መደገፉ በውስብስብ ግልባጭ ትንታኔዎች ውስጥ ያለውን ውጤታማነት ይገድባል።በሌላ በኩል የናኖፖር ቅደም ተከተል ረጅም የተነበበ ቴክኖሎጂን ይጠቀማል ፣ ይህም የሙሉ ርዝመት mRNA ግልባጮችን ቅደም ተከተል ለማስያዝ ያስችላል።ይህ አካሄድ የአማራጭ ስፕሊንግ፣ የጂን ውህዶች፣ ፖሊ-adenylation እና የኤምአርኤን ኢሶፎርሞችን በመለካት አጠቃላይ ፍለጋን ያመቻቻል።
የናኖፖር ቅደም ተከተል የሚወሰነው በናኖፖር ነጠላ ሞለኪውል የእውነተኛ ጊዜ የኤሌክትሪክ ምልክቶች ላይ ነው።በሞተር ፕሮቲኖች እየተመራ፣ ባለ ሁለት መስመር ዲ ኤን ኤ በባዮፊልም ውስጥ ከተከተቱ ናኖፖር ፕሮቲኖች ጋር ይገናኛል፣ በቮልቴጅ ልዩነት ውስጥ በናኖፖር ቻናል ውስጥ ሲያልፍ ይፈታል።በዲ ኤን ኤ ስትራንድ ላይ በተለያዩ መሰረቶች የሚፈጠሩት ልዩ የኤሌክትሪክ ምልክቶች በእውነተኛ ጊዜ ተገኝተው ተከፋፍለው ትክክለኛ እና ቀጣይነት ያለው ኑክሊዮታይድ ቅደም ተከተልን ያመቻቻል።ይህ የፈጠራ አቀራረብ የአጭር ንባብ ውስንነቶችን በማለፍ ለተወሳሰበ የጂኖሚክ ትንተና ተለዋዋጭ መድረክ ያቀርባል፣ ውስብስብ የጽሑፍ ግልባጭ ጥናቶችን ያካትታል።
መድረክ፡ ናኖፖሬ ፕሮሜሽን ፒ 48
-
ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል -PacBio
በኤንጂኤስ ላይ የተመሰረተ ኤምአርኤን ቅደም ተከተል የጂን አገላለፅን ለመለካት ሁለገብ መሳሪያ ቢሆንም፣ በአጭር ንባብ ላይ ያለው ጥገኛነት ውስብስብ የጽሑፍ ግልባጭ ትንታኔዎችን መጠቀምን ይገድባል።PacBio sequencing (Iso-Seq)፣ በሌላ በኩል፣ ረጅም የተነበበ ቴክኖሎጂን ይጠቀማል፣ ይህም የሙሉ ርዝመት mRNA ግልባጮችን ቅደም ተከተል ለማስያዝ ያስችላል።ይህ አካሄድ የጂን አገላለፅን ለመለካት ቀዳሚ ምርጫ ባይሆንም የሚፈለገው ከፍተኛ መጠን ያለው መረጃ ስላለ የአማራጭ ስፕሊንግ፣ የጂን ውህዶች እና ፖሊ-አዴኒሌሽን አጠቃላይ ፍለጋን ያመቻቻል።
የPacBio ተከታታይ ቴክኖሎጂ በነጠላ ሞለኪውል፣ በእውነተኛ ጊዜ (SMRT) ቅደም ተከተል ላይ የተመሰረተ ነው፣ ይህም የሙሉ ርዝመት mRNA ግልባጮችን ለመያዝ የተለየ ጥቅም ይሰጣል።ይህ የፈጠራ አቀራረብ በቅደም ተከተል ወቅት የዲኤንኤ ፖሊሜሬሴሽን እንቅስቃሴን በእውነተኛ ጊዜ ለመከታተል የሚያስችሉ ዜሮ-ሞድ ሞገድ (ZMWs) የማይክሮ ፋብሪካ ጉድጓዶችን መጠቀምን ያካትታል።በእነዚህ ZMWs ውስጥ፣ የPacBio ዲ ኤን ኤ ፖሊሜሬዝ ተጨማሪ የዲ ኤን ኤ ሰንሰለትን ያዘጋጃል፣ ይህም ሙሉውን የኤምአርኤን ቅጂዎች የሚሸፍኑ ረጅም ንባቦችን ይፈጥራል።በCircular Consensus sequencing (CCS) ሁነታ ውስጥ ያለው የፓክባዮ አሠራር ተመሳሳዩን ሞለኪውል ደጋግሞ በመደርደር ትክክለኛነትን ያሻሽላል።የተፈጠሩት የ HiFi ንባቦች ከኤንጂኤስ ጋር የሚወዳደር ትክክለኛነት አላቸው፣ይህም ለተወሳሰቡ የጽሑፍ ግልባጭ ባህሪያት አጠቃላይ እና አስተማማኝ ትንተና አስተዋፅዖ ያደርጋል።መድረክ: PacBio ተከታይ II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Ilumina
mRNA ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ በሴሎች ውስጥ ያሉትን ሁሉንም የኤምአርኤን ቅጂዎች አጠቃላይ መገለጫን ያበረታታል።ይህ የመቁረጫ ቴክኖሎጂ ውስብስብ የሆኑ የጂን አገላለጾችን መገለጫዎችን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና ከተለያዩ ባዮሎጂካዊ ሂደቶች ጋር የተያያዙ ሞለኪውላዊ ስልቶችን በማሳየት እንደ ሃይለኛ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል።በመሠረታዊ ምርምር፣ ክሊኒካዊ ምርመራ እና የመድኃኒት ልማት ውስጥ በሰፊው ተቀባይነት ያለው፣ mRNA ቅደም ተከተል ስለ ሴሉላር ተለዋዋጭነት እና የጄኔቲክ ቁጥጥር ውስብስብነት ግንዛቤዎችን ይሰጣል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ ኤክስ
-
በማጣቀሻ ላይ የተመሰረተ mRNA Sequencing-Illumina
mRNA ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ በሴሎች ውስጥ ያሉትን ሁሉንም የኤምአርኤን ቅጂዎች አጠቃላይ መገለጫን ያበረታታል።ይህ የመቁረጫ ቴክኖሎጂ ውስብስብ የሆኑ የጂን አገላለጾችን መገለጫዎችን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና ከተለያዩ ባዮሎጂካዊ ሂደቶች ጋር የተያያዙ ሞለኪውላዊ ስልቶችን በማሳየት እንደ ሃይለኛ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል።በመሠረታዊ ምርምር፣ ክሊኒካዊ ምርመራ እና የመድኃኒት ልማት ውስጥ በሰፊው ተቀባይነት ያለው፣ mRNA ቅደም ተከተል ስለ ሴሉላር ተለዋዋጭነት እና የጄኔቲክ ቁጥጥር ውስብስብነት ግንዛቤዎችን ይሰጣል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ ኤክስ
-
ረጅም ኮድ ያልሆነ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ረጅም ኮድ የማይሰጡ አር ኤን ኤዎች (lncRNAs) ከ200 ኑክሊዮታይድ የሚረዝሙ አር ኤን ኤዎች ሲሆኑ አነስተኛ ኮድ የመፃፍ አቅም ያላቸው እና ኮድ ባልሆኑ አር ኤን ኤ ውስጥ ወሳኝ አካላት ናቸው።በኒውክሊየስ እና ሳይቶፕላዝም ውስጥ የሚገኙት እነዚህ አር ኤን ኤዎች በኤፒጄኔቲክ፣ በግልባጭ እና በድህረ-ጽሑፍ ደንብ ውስጥ ወሳኝ ሚናዎችን ይጫወታሉ፣ ይህም ሴሉላር እና ሞለኪውላዊ ሂደቶችን በመቅረጽ ላይ ያላቸውን ጠቀሜታ አጉልቶ ያሳያል።የ LncRNA ቅደም ተከተል በሴል ልዩነት፣ ኦንቶጄኔሲስ እና በሰው በሽታዎች ውስጥ ኃይለኛ መሳሪያ ነው።
መድረክ: Illumina NovaSeq
-
አነስተኛ የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ትናንሽ አር ኤን ኤ (ኤስ ኤን ኤ) ሞለኪውሎች፣ በተለይም ከ200 ኑክሊዮታይድ በታች ርዝማኔ፣ ማይክሮ አር ኤን ኤ (ሚ አር ኤን ኤ)፣ አነስተኛ ጣልቃ-ገብ አር ኤን ኤ (siRNAs) እና ፒዊ መስተጋብር አር ኤን ኤ (ፒአርኤንኤ) ያካትታሉ።ከእነዚህም መካከል ከ20-24 ኑክሊዮታይድ የሚረዝሙ ሚአርኤንኤዎች በተለይ በተለያዩ ሴሉላር ሂደቶች ውስጥ ላሳዩት ወሳኝ የቁጥጥር ሚና የሚደነቁ ናቸው።በቲሹ-ተኮር እና ደረጃ-ተኮር አገላለጽ ቅጦች፣ ማይአርኤንኤዎች በተለያዩ ዝርያዎች ላይ ከፍተኛ ጥበቃን ያሳያሉ።
መድረክ: Illumina NovaSeq
-
የሰርአርኤን ቅደም ተከተል-ኢሉሚና
ክብ አር ኤን ኤ ሲኬንሲንግ (ሰርር ኤን ኤ ሴክውሲንግ) የክብ አር ኤን ኤዎችን መገለጫ እና መተንተን ነው፣ አር ኤን ኤ ሞለኪውሎች ክፍል የሆነው ቀኖናዊ ባልሆኑ ስፔሊንግ ክስተቶች ምክንያት የተዘጉ ቀለበቶችን ይመሰርታሉ፣ ይህም አር ኤን ኤ የበለጠ መረጋጋት ይሰጣል።አንዳንድ ሰርአርኤንኤዎች እንደ ማይክሮ አር ኤን ኤ ስፖንጅ ሆነው ሲሰሩ፣ ማይክሮ አር ኤን ኤዎችን በመለየት እና ኢላማቸውን ኤምአርኤን እንዳይቆጣጠሩ ሲደረግ፣ ሌሎች ሰርክ አር ኤን ኤዎች ከፕሮቲኖች ጋር መስተጋብር መፍጠር፣ የጂን አገላለፅን ማስተካከል ወይም በሴሉላር ሂደቶች ውስጥ ሚናዎች ሊኖራቸው ይችላል።የሰር አር ኤን ኤ አገላለጽ ትንተና የእነዚህን ሞለኪውሎች የቁጥጥር ሚናዎች እና በተለያዩ ሴሉላር ሂደቶች፣ በእድገት ደረጃዎች እና በበሽታ ሁኔታዎች ላይ ስላላቸው ጠቀሜታ ግንዛቤን ይሰጣል፣ ይህም የአር ኤን ኤ ደንብ ውስብስብነት በጂን አገላለጽ ላይ ጠለቅ ያለ ግንዛቤ እንዲኖር አስተዋጽኦ ያደርጋል።
-
ሙሉ የጽሑፍ ቅደም ተከተል - ኢሉሚና
አጠቃላይ የጽሑፍ ቅደም ተከተል የተለያዩ የአር ኤን ኤ ሞለኪውሎችን የመገለጫ ዘዴን ያቀርባል፣ ሁለቱንም ኮድ (mRNA) እና ኮድ የማይሰጡ አር ኤን ኤዎችን (lncRNA፣ circRNA እና miRNA) ያካትታል።ይህ ዘዴ በተወሰነ ቅጽበት የተወሰኑ ሴሎችን ሙሉ ግልባጭ ይይዛል፣ ይህም ስለ ሴሉላር ሂደቶች አጠቃላይ ግንዛቤ እንዲኖር ያስችላል።“ጠቅላላ የአር ኤን ኤ ሲኬንሲንግ” በመባልም ይታወቃል፣ እንደ ተፎካካሪ ውስጣዊ አር ኤን ኤ (ceRNA) እና የመገጣጠሚያ አር ኤን ኤ ትንተና ያሉ ጥልቅ ትንታኔዎችን በማስቻል የተወሳሰቡ የቁጥጥር ኔትወርኮችን በግልባጭ ደረጃ ይፋ ለማድረግ ያለመ ነው።ይህ በተለይ በሰርርና-ሚርኤን-ኤምአርኤን ላይ የተመሰረቱ የሴአርኤን ግንኙነቶችን የሚያካትቱ የቁጥጥር ኔትወርኮችን ለመክፈት ወደ ተግባራዊ ባህሪይ የመጀመሪያ ደረጃን ያሳያል።
