-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል -ኤን.ኤስ
Metagenome የሚያመለክተው እንደ የአካባቢ ሜታጂኖም፣ የሰው ሜታጂኖም፣ ወዘተ ያሉ የተዋሃዱ ህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው።ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ነው ፣ ይህም ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣ የስነ ሕዝብ አወቃቀር ፣ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ያለውን ትስስር ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል-ናኖፖር
Metagenomics ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ሲሆን ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣የሕዝብ አወቃቀር ፣የሥነ-ሥርዓት ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና የአካባቢ ሁኔታዎች ትስስር ወዘተ. ወደ ሜታጂኖሚክ ጥናቶች.በንባብ ርዝማኔ ያለው አስደናቂ አፈጻጸም በአብዛኛው ወደ ታች ዥረት ሜታጂኖሚክ ትንተና በተለይም የሜታጂኖም ስብሰባን አሻሽሏል።የንባብ-ርዝመት ጥቅሞችን በመውሰድ በናኖፖሬ ላይ የተመሰረተ የሜታጂኖሚክ ጥናት ከተኩስ-ጠመንጃ ሜታጂኖሚክስ ጋር በማነፃፀር ቀጣይነት ያለው ስብሰባን ማሳካት ይችላል።በናኖፖሬ ላይ የተመሰረቱ ሜታጂኖሚክስ ሙሉ እና የተዘጉ የባክቴሪያ ጂኖም ከማይክሮባዮሞች (Moss, EL, et. alተፈጥሮ ባዮቴክ, 2020)
መድረክ፡ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
በ 16S እና 18S አር ኤን ኤ ላይ ያለው ንዑስ ክፍል ሁለቱንም በጣም የተጠበቁ እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎችን የያዘ ለፕሮካርዮቲክ እና ኢውካርዮቲክ ፍጥረታት መለያ ፍጹም የሞለኪውላር አሻራ ነው።በቅደም ተከተል በመጠቀም እነዚህ አምፖሎች በተጠበቁ ክፍሎች ላይ ተመስርተው ሊነጣጠሩ ይችላሉ እና ከፍተኛ-ተለዋዋጭ ክልሎች በጥቃቅን ተህዋሲያን ለመለየት ሙሉ ለሙሉ ተለይተው የሚታወቁት ጥቃቅን ብዝሃነት ትንተና፣ ታክሶኖሚ፣ ፋይሎጅኒ ወዘተ. ነጠላ ሞለኪውል የእውነተኛ ጊዜ (SMRT) የPacBio መድረክ ቅደም ተከተል ከፍተኛ ትክክለኛ ረጅም ንባቦችን ለማግኘት ያስችላል፣ ይህም ሙሉ ርዝመት ያላቸውን አምፖሎች (በግምት 1.5 ኪባ) ሊሸፍን ይችላል።የጄኔቲክ መስክ ሰፊ እይታ በባክቴሪያ ወይም በፈንገስ ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ማብራሪያ ላይ ያለውን መፍትሄ በእጅጉ አሻሽሏል።
መድረክ፡PacBio ተከታይ II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል ዓላማው በጣም የተነጋገሩትን እና ተለዋዋጭ ክፍሎችን የያዙ PCR የቤት አያያዝ የጄኔቲክ ማርከሮችን በመመርመር በጥቃቅን ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ፣የታክሶኖሚ እና የዝርያ ብዛትን ለማሳየት ነው።የእነዚህ ፍፁም የሞለኪውላር የጣት አሻራ በ Woeses et al፣(1977) ማስተዋወቅ ከገለልተኝነት ነፃ የሆነ የማይክሮባዮም መገለጫን ያበረታታል።የ16S (ባክቴሪያዎች)፣ 18S (ፈንጋይ) እና Internal transcribed spacer(አይቲኤስ፣ ፈንገስ) ቅደም ተከተላቸው ሁለቱንም በብዛት የሚገኙ ዝርያዎችን እንዲሁም ብርቅዬ እና የማይታወቁ ዝርያዎችን ለመለየት ያስችላል።ይህ ቴክኖሎጂ በተለያዩ አከባቢዎች ማለትም በሰው አፍ፣ አንጀት፣ ሰገራ፣ ወዘተ ያሉ ልዩ ልዩ ተህዋሲያን ስብጥርን በመለየት በስፋት የተተገበረ እና ዋና መሳሪያ እየሆነ መጥቷል።
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል
የባክቴሪያ እና የፈንገስ አጠቃላይ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል የታወቁትን ባክቴሪያዎች እና ፈንገሶች ጂኖም ለማጠናቀቅ እንዲሁም በርካታ ጂኖምዎችን ለማነፃፀር ወይም የአዳዲስ ፍጥረታትን ጂኖም ለመቅረጽ ወሳኝ መሳሪያ ነው።ትክክለኛ የማጣቀሻ ጂኖም ለማመንጨት, ማይክሮባዮሎጂን ለመለየት እና ሌሎች የንጽጽር ጂኖም ጥናቶችን ለማካሄድ ሙሉውን የባክቴሪያ እና የፈንገስ ጂኖም በቅደም ተከተል ማስቀመጥ በጣም አስፈላጊ ነው.
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
Metatranscriptome ቅደም ተከተል
Metatranscriptome ቅደም ተከተል በተፈጥሮ አከባቢዎች (ማለትም አፈር፣ ውሃ፣ ባህር፣ ሰገራ እና አንጀት) ውስጥ የሚገኙትን ረቂቅ ተህዋሲያን (ሁለቱም eukaryotes እና prokaryotes) የጂን አገላለፅን ይለያል።በተለይ ይህ አገልግሎት ውስብስብ የሆኑ ማይክሮቢያል ማህበረሰቦችን አጠቃላይ የጂን መግለጫ እንድታገኙ ይፈቅድልሃል። የዝርያዎች, በተለየ ሁኔታ የተገለጹ ጂኖች ተግባራዊ ማበልጸጊያ ትንተና እና ሌሎችም.
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የፈንገስ ጂኖም
ባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች በልዩ የምርምር ግብ ላይ በመመስረት የጂኖም ዳሰሳ፣ ጥሩ ጂኖም እና የፔን-ሙሉ የፈንገስ ጂኖም ይሰጣሉ።የጂኖም ቅደም ተከተል ፣ ስብሰባ እና የተግባር ማብራሪያ የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል + የሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል በማጣመር ከፍተኛ ደረጃ ያለው የጂኖም ስብሰባ ማግኘት ይቻላል ።ጂኖም በክሮሞሶም ደረጃ ላይ ለመገጣጠም የ Hi-C ቴክኖሎጂን መጠቀምም ይቻላል።
መድረክ፡PacBio ተከታይ II
ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48
ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የባክቴሪያ ሙሉ ጂኖም
ባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የተሟላ የባክቴሪያ ጂኖም ከዜሮ ክፍተት ጋር በመገንባት ላይ ያለውን የቅደም ተከተል አገልግሎት ይሰጣል።የባክቴሪያ ዋና የስራ ሂደት የተሟላ ጂኖም ግንባታ የሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ፣ ስብሰባ ፣ ተግባራዊ ማብራሪያ እና የተወሰኑ የምርምር ግቦችን የሚያሟሉ የላቀ ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔን ያጠቃልላል።የበለጠ አጠቃላይ የባክቴሪያ ጂኖም መገለጫ ባዮሎጂያዊ ሂደቶቻቸውን የሚመለከቱ መሰረታዊ ዘዴዎችን ለማሳየት ኃይል ይሰጣል ፣ ይህም በከፍተኛ የዩኩሪዮቲክ ዝርያዎች ውስጥ ለሚደረጉ የጂኖም ጥናቶች ጠቃሚ ማጣቀሻዎችን ይሰጣል ።
መድረክ፡ናኖፖሬ ፕሮሜሽን ፒ 48 + ኢሉሚና ኖቫ ሴክ መድረክ
PacBio ተከታይ II
