-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ቺአይፒ-ሴክ)
ChIP-Seq ለሂስቶን ማሻሻያ፣ ግልባጭ ምክንያቶች እና ሌሎች ከዲኤንኤ ጋር ለተያያዙ ፕሮቲኖች ጂኖም-ሰፊ የዲኤንኤ ኢላማዎችን ያቀርባል።የተወሰኑ የፕሮቲን-ዲ ኤን ኤ ውስብስቦችን መልሶ ለማግኘት የ chromatin immuno-precipitation (ቺአይፒ) ምርጫን ያጣምራል፣ የተገኘውን የዲ ኤን ኤ የከፍተኛ-ሂደት ቅደም ተከተል ከቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል (NGS) ኃይል ጋር።በተጨማሪም፣ የፕሮቲን-ዲ ኤን ኤ ውህዶች ከህያዋን ህዋሶች ስለሚመለሱ፣ ማያያዣ ቦታዎች በተለያዩ የሕዋስ ዓይነቶች እና ቲሹዎች ወይም በተለያዩ ሁኔታዎች ሊነፃፀሩ ይችላሉ።አፕሊኬሽኖች ከጽሑፍ ግልባጭ ደንብ እስከ የእድገት ጎዳናዎች እስከ የበሽታ ዘዴዎች እና ከዚያም በላይ ናቸው።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ሙሉ የጂኖም ቢሰልፋይት ቅደም ተከተል
በሳይቶሲን (5-mC) ውስጥ በአምስተኛው ቦታ ላይ ያለው የዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን በጂን አገላለጽ እና በሴሉላር እንቅስቃሴ ላይ መሠረታዊ ተጽእኖ አለው.ያልተለመዱ የሜቲላይዜሽን ንድፎች ከበርካታ ሁኔታዎች እና እንደ ካንሰር ካሉ በሽታዎች ጋር ተያይዘዋል.WGBS በነጠላ ቤዝ መፍታት ጂኖም-ሰፊ ሜቲሌሽን ለማጥናት የወርቅ ደረጃ ሆኗል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ለትራንስፖሴስ-ሊደረስ የሚችል Chromatin በከፍተኛ የፍተሻ ቅደም ተከተል (ATAC-seq)
ATAC-seq ጂኖም-ሰፊ chromatin ተደራሽነት ትንተና ከፍተኛ-throughput ቅደም ተከተል ዘዴ ነው, ይህም አቀፍ epigenetic የጂን መግለጫ ቁጥጥር አስፈላጊ ነው.የቅደም ተከተል አስማሚዎች ወደ ክፍት ክሮማቲን ክልሎች በሃይፐርአክቲቭ Tn5 transposase ገብተዋል።ከ PCR ማጉላት በኋላ፣ ተከታታይ ቤተ መፃህፍት ተገንብቷል።ሁሉም ክፍት ክሮማቲን ክልሎች በአንድ የተወሰነ የቦታ-ጊዜ ሁኔታ ውስጥ ሊገኙ ይችላሉ, ለጽሑፍ ግልባጭ ምክንያቶች አስገዳጅ ቦታዎች ብቻ ሳይሆን የተወሰነ ሂስቶን የተሻሻለ ክልል.
-
የተቀነሰ ውክልና Bisulfite ቅደም ተከተል (RRBS)
የዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ምርምር ሁልጊዜም በበሽታ ምርምር ውስጥ በጣም ሞቃት ርዕሰ ጉዳይ ነው, እና ከጂን አገላለጽ እና ፍኖተ-ዓይነት ባህሪያት ጋር በቅርበት የተያያዘ ነው.RRBS ለዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ምርምር ትክክለኛ፣ ቀልጣፋ እና ኢኮኖሚያዊ ዘዴ ነው።የፕሮሞተር እና የሲፒጂ ደሴት ክልሎችን በኢንዛይም ክላቭጅ (Msp I) ማበልፀግ ከBisulfite ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ ከፍተኛ ጥራት ያለው የዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ማግኘትን ይሰጣል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
