-
PacBio-Full-ርዝመት 16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል
አምፕሊኮን (16S/18S/ITS) ፕላትፎርም በጥቃቅን ብዝሃነት ፕሮጀክት ትንተና የዓመታት ልምድ ያለው ሲሆን ይህም ደረጃውን የጠበቀ መሰረታዊ ትንተና እና ግላዊ ትንታኔን ይዟል፡ መሰረታዊ ትንተና የወቅቱ ጥቃቅን ምርምር ዋና ዋና የትንታኔ ይዘቶችን ይሸፍናል፣ የትንታኔ ይዘቱ የበለፀገ እና ሁሉን አቀፍ ነው። እና የትንታኔ ውጤቶች በፕሮጀክት ሪፖርቶች መልክ ቀርበዋል;ለግል የተበጁ ትንታኔዎች ይዘት የተለያዩ ናቸው.ለግል የተበጁ መስፈርቶችን ለመገንዘብ በመሠረታዊ የትንታኔ ዘገባ እና የምርምር ዓላማ መሠረት ናሙናዎች ሊመረጡ እና መለኪያዎች በተለዋዋጭ ሊዘጋጁ ይችላሉ።የዊንዶውስ ኦፐሬቲንግ ሲስተም, ቀላል እና ፈጣን.
-
PacBio-Full-long Transcriptome (ማጣቀሻ ያልሆነ)
የፓሲፊክ ባዮሳይንስ (PacBio) Isoform ተከታታይ ውሂብን እንደ ግብአት በመውሰድ ይህ መተግበሪያ የሙሉ ርዝመት ግልባጭ ቅደም ተከተሎችን (ያለ ስብሰባ) መለየት ይችላል።የሙሉ-ርዝመት ቅደም ተከተሎችን ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር በማነፃፀር ግልባጮች በሚታወቁ ጂኖች ፣ ግልባጮች ፣ በኮድ ክልሎች ፣ ወዘተ. በዚህ ሁኔታ የበለጠ ትክክለኛ የኤምአርኤን አወቃቀሮችን እንደ አማራጭ መገጣጠም ፣ ወዘተ የመሳሰሉትን መለየት ይቻላል ።የጋራ ትንተና ከኤንጂኤስ የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል ዳታ የበለጠ አጠቃላይ ማብራሪያ እና የበለጠ ትክክለኛ አገላለጽ በጽሑፍ ግልባጭ ደረጃ እንዲታይ ያስችለዋል፣ ይህም በአብዛኛው የታችኛውን ተፋሰስ ልዩነት አገላለጽ እና ተግባራዊ ትንታኔን ይጠቀማል።
-
የመሳሪያ ዕቃዎች
BMKCloud ለጂኖሚክ ፕሮግራሞች የአንድ ጊዜ መፍትሄ የሚሰጥ መሪ ባዮኢንፎርማቲክ መድረክ ነው ፣ይህም በተለያዩ መድረኮች በህክምና ፣ግብርና ፣አካባቢ ፣ወዘተ ተመራማሪዎች የታመነ ነው። ፣ የኮምፒዩተር መርጃዎች ፣ የህዝብ ዳታቤዝ ፣ ባዮኢንፎርማቲክ የመስመር ላይ ኮርሶች ፣ ወዘተ. BMKCloud የጂን ማብራሪያ ፣ የዝግመተ ለውጥ ጀነቲካዊ መሳሪያዎች ፣ ncRNA ፣ የውሂብ ጥራት ቁጥጥር ፣ ስብሰባ ፣ አሰላለፍ ፣ የውሂብ ማውጣት ፣ ሚውቴሽን ፣ ስታቲስቲክስ ፣ አኃዝ ጄኔሬተር ፣ ቅደም ተከተልን ጨምሮ የተለያዩ ባዮኢንፎርማቲክ መሳሪያዎች አሉት። ትንተና ወዘተ.
-
ትንሽ አር ኤን ኤ
ትንንሽ አር ኤን ኤዎች ሚአርአን፣ ሲርኤን እና ፒአርኤንን ጨምሮ ከ18-30 nt አማካኝ ርዝመት ያላቸው አጭር ኮድ አልባ አር ኤን ኤ ናቸው።እነዚህ ትናንሽ አር ኤን ኤዎች በተለያዩ ባዮሎጂያዊ ሂደቶች ውስጥ እንደ ኤምአርኤን መጥፋት፣ የትርጉም መከልከል፣ የሄትሮሮማቲን አፈጣጠር፣ ወዘተ የመሳሰሉት በስፋት ተዘግበዋል። ተከታታይ ትንተና መድረክ መደበኛ ትንተና እና የላቀ የውሂብ ማዕድን ያካትታል.በአር ኤን ኤ ሴክ መረጃ መሰረት፣ መደበኛ ትንተና ሚአርኤን መለየት እና ትንበያ፣ ሚአርኤን ኢላማ ዘረ-መል ትንበያ፣ ማብራሪያ እና የቃላት ትንተና ማሳካት ይችላል።የላቀ ትንተና ብጁ ሚአርኤን ፍለጋ እና ማውጣትን፣ የቬን ዲያግራም ማመንጨትን፣ ሚአርኤን እና ኢላማ የጂን አውታር ግንባታን ያስችላል።
-
NGS-WGS (ኢሉሚና/ቢጂአይ)
NGS-WGS በባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የበለፀገ ልምድ ላይ የተመሰረተ ሙሉ የጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል ትንተና መድረክ ነው።ይህ ለአጠቃቀም ቀላል የሆነ መድረክ ጥቂት መሰረታዊ መለኪያዎችን በማዘጋጀት የተቀናጀ የትንታኔ የስራ ፍሰት በፍጥነት እንዲያቀርብ ያስችላል፣ ይህም ከኢሉሚና መድረክ እና ከ BGI ተከታታይ መድረክ ለሚመነጨው የዲኤንኤ ቅደም ተከተል መረጃ የሚመጥን።ይህ ፕላትፎርም በከፍተኛ አፈጻጸም ኮምፒውቲንግ አገልጋይ ላይ ተዘርግቷል፣ይህም በጣም ቀልጣፋ የመረጃ ትንተና በጣም ውስን በሆነ ጊዜ ውስጥ ኃይል ይሰጣል።ግላዊነት የተላበሰ የመረጃ ማዕድን ማውጣት በመደበኛ ትንተና፣ በተለዋዋጭ የጂን ጥያቄ፣ PCR ፕሪመር ዲዛይን፣ ወዘተ ጨምሮ ይገኛል።
-
ኤምአርኤን (ማጣቀሻ)
ትራንስክሪፕት በጂኖሚክ ጄኔቲክ መረጃ እና በባዮሎጂካል ተግባር ፕሮቲዮም መካከል ያለው ግንኙነት ነው።የጽሑፍ ግልባጭ ደረጃ ደንብ በጣም አስፈላጊ እና በስፋት የተጠና የሥርዓተ ህዋሳት የቁጥጥር ዘዴ ነው።የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል በማንኛውም ጊዜ ወይም በማንኛውም ሁኔታ የጽሑፍ ግልባጩን በቅደም ተከተል ያስቀምጣል ፣ ትክክለኛ ጥራት ለአንድ ኑክሊዮታይድ። የጂን ግልባጭ ደረጃን በተለዋዋጭ መንገድ ያንፀባርቃል ፣ በተመሳሳይ ጊዜ ያልተለመዱ እና የተለመዱ ግልባጮችን በመለየት እና በመለካት ፣ እና ስለ መዋቅራዊ መረጃ ያቀርባል ናሙና የተወሰኑ ግልባጮች።
በአሁኑ ጊዜ በግብርና፣ በሕክምና እና በሌሎች የምርምር መስኮች፣ የእንስሳትና የዕፅዋት ልማት ደንብ፣ የአካባቢ መላመድ፣ የበሽታ መከላከል መስተጋብር፣ የጂን አካባቢ፣ የዝርያ ጄኔቲክ ዝግመተ ለውጥ እና ዕጢ እና የዘረመል በሽታን ለይቶ ማወቅን ጨምሮ በአግሮኖሚ፣ በሕክምና እና በሌሎች የምርምር ዘርፎች የትራንስክሪፕቶም ተከታታይ ቴክኖሎጂ በስፋት ጥቅም ላይ ውሏል።
-
ሜታጂኖሚክስ (ኤን.ኤስ.ኤስ.)
ይህ የትንታኔ መድረክ የዓመታት ልምድን መሰረት በማድረግ ለተተኮሰ ሜታጂኖሚክ መረጃ ትንተና የተነደፈ ነው።የውሂብ ሂደትን፣ የዝርያ ደረጃ ጥናቶችን፣ የጂን ተግባር ደረጃ ጥናቶችን፣ የሜታጂኖም ቢኒንግ፣ ወዘተ ጨምሮ የተለያዩ የተለመዱ የሜታጂኖሚክስ ትንታኔዎችን የያዘ የተቀናጀ የስራ ፍሰትን ያካትታል። በተጨማሪም ብጁ የመረጃ ማምረቻ መሳሪያዎች የጂን እና የዝርያ ጥያቄን ጨምሮ በመደበኛ ትንተና የስራ ፍሰት ላይ ይገኛሉ። ፣ የመለኪያ አቀማመጥ ፣ ግላዊ ምስል ማመንጨት ፣ ወዘተ
-
LncRNA
ረጅም ኮድ ያልሆኑ አር ኤን ኤዎች (lncRNA) ከ 200 nt በላይ ርዝማኔ ያላቸው የትራንስክሪፕት አይነት ናቸው ፕሮቲኖችን ኮድ ማድረግ አይችሉም።የተጠራቀሙ መረጃዎች እንደሚያመለክቱት አብዛኞቹ lncRNAs በጣም ተግባራዊ ሊሆኑ ይችላሉ።ከፍተኛ የሂደት ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎች እና የባዮኢንፎርማቲክ ትንተና መሳሪያዎች የ lncRNA ቅደም ተከተሎችን እንድንገልፅ እና መረጃን በብቃት እንድናስቀምጥ እና ወሳኝ የቁጥጥር ተግባራት ያላቸውን lncRNA እንድናገኝ ይመራናል።BMKCloud ደንበኞቻችን ፈጣን፣ አስተማማኝ እና ተለዋዋጭ የ lncRNA ትንታኔን ለማግኘት የ lncRNA ተከታታይ ትንተና መድረክ በማቅረብ ኩራት ይሰማናል።
-
GWAS
የጂኖም-ሰፊ ማህበር ጥናት (GWAS) ዓላማው ከተወሰኑ ባህሪያት (phenotype) ጋር የተያያዙ የዘረመል ልዩነቶችን (ጂኖታይፕ) ለመለየት ነው።የGWA ጥናቶች የዘረመል ምልክቶችን ይመረምራሉ ብዙ ቁጥር ያላቸውን ግለሰቦች ሙሉ ጂኖም ያቋርጣሉ እና በሕዝብ ደረጃ በስታቲስቲካዊ ትንታኔ የጂኖታይፕ-ፍኖታይፕ ማህበራትን ይተነብያል።ሙሉ-ጂኖም ተከታይ ማድረግ ሁሉንም የዘረመል ልዩነቶችን ሊያገኝ ይችላል።ከፋኖታይፒክ መረጃ ጋር በማጣመር፣ GWAS ዘመናዊ የእንስሳት/የእፅዋት መራባትን በብርቱ የሚደግፈውን የፍኖታይፕ ተዛማጅ SNPsን፣ QTLs እና እጩ ጂኖችን ለመለየት ሊሰራ ይችላል።SLAF በራሱ የዳበረ ቀለል ያለ የጂኖም ቅደም ተከተል ስልት ነው፣ እሱም ጂኖም ሰፊ የተከፋፈሉ ማርከሮች፣ SNP።እነዚህ SNPs፣ እንደ ሞለኪውላር ጀነቲካዊ ጠቋሚዎች፣ የታለሙ ባህሪያት ላሏቸው ተያያዥ ጥናቶች ሊከናወኑ ይችላሉ።ውስብስብ ባህሪያትን ተያያዥነት ያላቸው የጄኔቲክ ልዩነቶችን ለመለየት ወጪ ቆጣቢ ስልት ነው.
-
ናኖፖሬ ባለ ሙሉ ርዝመት ትራንስክሪፕቶሚክስ
በኦርጋኒክ ውስጥ ውስብስብ እና ተለዋዋጭ አማራጭ ኢሶፎርሞች የጂን አገላለጽ እና የፕሮቲን ልዩነትን ለመቆጣጠር አስፈላጊ የጄኔቲክ ዘዴዎች ናቸው።የትራንስክሪፕት አወቃቀሮችን በትክክል መለየት የጂን አገላለጽ ደንብ ንድፎችን በጥልቀት ለማጥናት መሰረት ነው.የናኖፖር ቅደም ተከተል መድረክ በተሳካ ሁኔታ የጽሑፍ ጥናትን ወደ አይዞፎርም ደረጃ አምጥቷል።ይህ የትንታኔ መድረክ የተዘጋጀው በናኖፖሬ መድረክ ላይ የተፈጠረውን አር ኤን ኤ-ሴቅ መረጃን በማጣቀሻ ጂኖም መሠረት ለመተንተን ነው፣ ይህም በሁለቱም የጂን ደረጃ እና የጽሑፍ ግልባጭ ደረጃ የጥራት እና የቁጥር ትንታኔዎችን ያገኛል።
-
ሰር-አር ኤን ኤ
ክብ አር ኤን ኤ (ሰርከር ኤን ኤ) ኮድ የማይሰጥ አር ኤን ኤ ዓይነት ነው፣ እሱም በቅርብ ጊዜ በማደግ ላይ ባሉ የቁጥጥር ኔትወርኮች ውስጥ ወሳኝ ሚና ሲጫወት የተገኘ፣ አካባቢን የመቋቋም ወዘተ። የሰርአርኤንኤ ጫፎች አንድ ላይ ተጣምረው ክብ ቅርጽ ያለው መዋቅር ይፈጥራሉ፣ ይህም ከ exonuclease መፈጨት ያድናቸዋል እና ከአብዛኞቹ የመስመር አር ኤን ኤ የበለጠ የተረጋጋ ናቸው።CircRNA የጂን አገላለፅን በመቆጣጠር ረገድ የተለያዩ ተግባራት እንዳሉት ታውቋል።CircRNA እንደ ceRNA መስራት ይችላል፣ እሱም ሚአርኤን በፉክክር የሚያስተሳስረው፣ ሚአርኤን ስፖንጅ በመባል ይታወቃል።የ CircRNA ቅደም ተከተል ትንተና መድረክ የሰርአርኤንኤ አወቃቀር እና አገላለጽ ትንተና ፣ ዒላማ ትንበያ እና ከሌሎች የአር ኤን ኤ ሞለኪውሎች ጋር የጋራ ትንተናን ያበረታታል።
-
BSA
የጅምላ ሴግሬጋንት ትንተና መድረክ አንድ-ደረጃ መደበኛ ትንተና እና የላቀ ትንታኔን ከተበጀ መለኪያ ቅንብር ጋር ያካትታል።BSA የፍኖታይፕ ተያያዥ የጄኔቲክ ማርከሮችን በፍጥነት ለመለየት የሚሰራ ዘዴ ነው።የቢኤስኤ ዋና የስራ ሂደት የሚከተሉትን ይይዛል፡ 1. እጅግ በጣም ተቃራኒ የሆኑ ፍኖተ ዓይነቶች ያላቸውን ሁለት የግለሰቦች ቡድን መምረጥ።2. የሁሉንም ግለሰቦች ዲኤንኤ፣ አር ኤን ኤ ወይም SLAF-seq (በባዮማርከር የዳበረ) ሁለት ግዙፍ ዲኤንኤ እንዲመሰርቱ ማድረግ።3. በማጣቀሻ ጂኖም ላይ ወይም በመካከላቸው ልዩነት ቅደም ተከተሎችን መለየት, 4. እጩ የተገናኙ ክልሎችን በ ED እና SNP-index algorithm;5. በእጩ ክልሎች ውስጥ በጂኖች ላይ ተግባራዊ ትንተና እና ማበልጸግ ወዘተ. በመረጃ ላይ የበለጠ የላቀ የማዕድን ቁፋሮ የጄኔቲክ ማርከር ማጣሪያ እና የፕሪመር ዲዛይን እንዲሁ ይገኛሉ።
