የሙቀት ካርታ
የማትሪክስ ዳታ ፋይል ለሙቀት ካርታ ስዕል ጥቅም ላይ ይውላል፣ ይህም የማትሪክስ ውሂብን ማጣራት፣ መደበኛ ማድረግ እና መሰብሰብ ይችላል።በአብዛኛው ጥቅም ላይ የሚውለው በተለያዩ ናሙናዎች መካከል ያለውን የጂን አገላለጽ ደረጃ ለክላስተር ትንተና ነው።
የጂን ማብራሪያ
የጂን ተግባር ማብራሪያ የሚከናወነው በ FASTA ፋይል ውስጥ በተለያዩ የውሂብ ጎታ ላይ ባሉ ቅደም ተከተሎች በካርታ ነው።
የጂን ማብራሪያ
መሰረታዊ የአካባቢ አሰላለፍ ፍለጋ መሳሪያ
CDS_UTR_ትንበያ
ይህ መሳሪያ የሚታወቀውን የፕሮቲን ዳታቤዝ እና የ ORF ትንበያ ላይ በማፈንዳት በተሰጡት የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተሎች ውስጥ ኮድ መስጫ ክልሎችን (ሲዲኤስ) እና ኮድ የማይሰጡ ክልሎችን (UTR) ለመተንበይ የተነደፈ ነው።
ማንሃተን ሴራ
የማንሃታን ሴራ ብዙ ቁጥር ያላቸው የውሂብ ነጥቦችን ለማሳየት ያስችላል።እሱ በተለምዶ በጂኖም-ሰፊ ማህበር ጥናቶች (GWAS) ውስጥ ጥቅም ላይ ይውላል።
ሰርኮስ
የCIRCOS ዲያግራም የ SNP፣ InDeL፣ SV፣ CNV ስርጭት በጂኖም ላይ በቀጥታ ለማቅረብ ያስችላል።
GO_ማበልጸግ
TopGO ለተግባራዊ ማበልጸጊያ የተነደፈ መሳሪያ ነው።የTopGO-Bioconductor ጥቅል የልዩነት አገላለጽ ትንተናን፣ የGO ማበልፀጊያ ትንተና እና የውጤቶችን እይታን ያካትታል።ከፍተኛGO_BP፣ topGO_CC እና topGO_MF ውጤቶችን የያዘ "ግራፍ" የሚባል ውፅዓት ያለው አቃፊ ያመነጫል።
WGCNA
WGCNA የጂን አብሮ አገላለጽ ሞጁሎችን ለማግኘት በስፋት ጥቅም ላይ የዋለ የመረጃ ማውጣት ዘዴ ነው።የማይክሮአረይ መረጃን እና የጂን አገላለጽ ውሂብን ጨምሮ በተለያዩ የገለጻ ዳታ ስብስቦች ላይ ተፈጻሚ ይሆናል።
ኢንተርፕሮስካን
የ InterPro ፕሮቲን ቅደም ተከተል ትንተና እና ምደባ
GO_KEGG_ማበልጸግ
ይህ መሳሪያ የ GO ማበልፀጊያ ሂስቶግራምን፣ የKEGG ማበልፀጊያ ሂስቶግራምን እና የ KEGG ማበልፀጊያ መንገድን በቀረበው የጂን ስብስብ እና ተጓዳኝ ማብራሪያ ላይ የተመሰረተ ነው።