እ.ኤ.አ. በ 2021 BMKGENE 31 De novo genome ምርምር በተሳካ ሁኔታ በከፍተኛ ተፅእኖ ጆርናሎች ከ 320 በላይ ተፅእኖዎች ታትሟል ። ከጽሁፎቹ ውስጥ 15 ቱ በጋራ ተጽፈዋል 4 ቱ በ BMKGENE የመጀመሪያ ደራሲዎች ነበሩ ።
ልክ እ.ኤ.አ. በ2022 መጀመሪያ ላይ፣ በ"Natural Genetics" እና "Molecular Plant" መጽሔት ላይ ሁለት የምርምር መጣጥፎች እንደቅደም ተከተላቸው ታትመዋል።እነሱም፣ “ሁለት የተለያዩ ሃፕሎታይፕስ ከከፍተኛ ሄትሮዚጎስ ሊቺ ጂኖም ነፃ የሆነ የቤት ውስጥ ዝግጅቶችን ለጥንት እና ዘግይተው ለሚያድጉ ዝርያዎች ይጠቁማሉ። ), እና "የአምስቱ የሲቶፕሲስ የአኢጊሎፕስ ዝርያዎች የጂኖም ቅደም ተከተሎች እና የፖሊፕሎይድ ስንዴ B-subgenome አመጣጥ" (አምስት የሲቶፕሲስ ዝርያዎች ጂኖም, በሰሜን ምስራቅ ኖርማል ዩኒቨርሲቲ በፕሮፌሰር ባኦ ሊዩ የምርምር ቡድን የሚመራ.).እንዲሁም እነዚህን ሁለት መጣጥፎች ገምግመን ለአንባቢዎቻችን እናካፍላለን።
አሁን፣ በ2021 የታተሙትን በBMK እና በትብብር ፋሲሊቲዎቻችን የታተሙትን በጣም ጥሩ የምርምር መጣጥፎችን እንመልከት።
የፕላንት ጂኖም - በበርካታ ዝርያዎች ላይ የተደረጉ ግኝቶች.
1.A ከፍተኛ-ጥራት ያለው ጂኖም ስብሰባ አጃ ጂኖሚክ ባህሪያት እና agronomically ጠቃሚ ጂኖች ያደምቃል.
የትብብር ተቋም፡ ሄናን ግብርና ዩኒቨርሲቲ
ጆርናል: የተፈጥሮ ጄኔቲክስ
ተጽዕኖ ምክንያት: 38.31
በዚህ ፕሮጀክት ውስጥ፣ ጂኖም የዌይኒንግ ራይ፣ ታዋቂ የቻይና አጃ ዝርያ በቅደም ተከተል ቀርቧል።የተሰበሰቡት ኮንቲግ (7.74 Gb) ከተገመተው የጂኖም መጠን (7.86 Gb) 98.47% ይሸፍናሉ፣ 93.67% contigs (7.25 Gb) ለሰባት ክሮሞሶም ተመድቧል።ተደጋጋሚ ንጥረ ነገሮች ከተሰበሰበው ጂኖም 90.31% ናቸው።የዌይኒንግ ስብሰባ ተጨማሪ ትንታኔዎች በጂኖም-ሰፊ የጂን ብዜቶች እና በስታርች ባዮሲንተሲስ ጂኖች ላይ የሚያሳድሩት ተጽዕኖ፣ የተወሳሰቡ የፕሮላሚን ሎሲ አካላዊ አደረጃጀት፣ የጂን አገላለጽ ቀደምት አርዕስት ባህሪ እና ከሀገር ውስጥ ጋር ተያያዥነት ባላቸው ክሮሞሶም ክልሎች እና በሬ ውስጥ ያሉ ሎሲዎች ላይ አዲስ ብርሃን ፈንጥቋል።ይህ የጂኖም ቅደም ተከተል በአጃ እና ተዛማጅ የእህል ሰብሎች ላይ የጂኖም እና የመራቢያ ጥናቶችን ለማፋጠን ቃል ገብቷል።
2.Rose ያለ prickle: ጂኖሚክ ግንዛቤዎች እርጥበት መላመድ ጋር የተያያዙ
የትብብር ተቋም፡ የኩሚንግ የእጽዋት ተቋም፣ የቻይና የሳይንስ አካዳሚ
ጆርናል: ብሔራዊ ሳይንስ ግምገማ
ተጽዕኖ ምክንያት: 17.273
በዚህ ፕሮጀክት የ'Basye's Thornless' (BT፣ ከፕሪክል-ነጻ የሮዛ ዊቹራይአና ዝርያ)፣ 'አሮጌ ብሉሽ' (OB፣ በ rose domestication ውስጥ መስራች ጂኖታይፕ)፣ የF1 hybrids እና BCF1 ናሙናዎች ተሰብስበዋል።እና ከፍተኛ ጥራት ያለው የማጣቀሻ ጂኖም ስብስብ ከግንድ ፕሪክል ልማት ጋር የተያያዙ የጄኔቲክ ንጥረ ነገሮችን ለመለየት ተፈጠረ።የጂኖም መጠን 530.6 ሜባ አካባቢ ነው.የተገጣጠመውን ጂኖም ጥራት ለማረጋገጥ እንደ ጄኔቲክ ካርታ ንፅፅር፣ BUSCO፣ NGS እንደገና መሰብሰብ፣ ከOB haplotype ጋር ማነፃፀር፣ ቅደም ተከተል የመሠረት ስህተት መጠን ቁጥጥር እና ጂኖም-ሰፊ LTR Assembly Index እሴት ፍተሻ (LAI=20.03) ተካሂደዋል።ይህ ጥናት የግንድ ፕሪክልስን ውስብስብ የውርስ አሰራር እና የቁጥጥር ዘዴ ያሳያል እና ከጠቃሚ ባህሪያት ጋር ተያያዥነት ያላቸውን የሮዝ ባዮሎጂ እና የእኔ ሞለኪውላር ማርከሮችን ለማጥናት መሰረት እና አዲስ ግብዓቶችን አቅርቧል።
3.ሙሉ-ጂኖም በ Cucumis ውስጥ የተቀናጀ አሎፖሊፕሎይድ ቅደም ተከተል ስለ አሎፖሊፕሎይድላይዜሽን ጂኖም ዝግመተ ለውጥ ግንዛቤን ያሳያል።
የትብብር ተቋም፡ ናንጂንግ የግብርና ዩኒቨርሲቲ
ጆርናል: የላቀ ሳይንስ
ተጽዕኖ ምክንያት: 16.801
ይህ ጥናት በኪያር (C. sativus, 2n = 14) እና በዱር ዘመድ ዝርያ (C. hystrix, 2n = 24) እና ተከታዩ ክሮሞሶም ብዜት መካከል ያለውን ልዩነት በመጠቀም የተገኘውን ሰው ሰራሽ allotetraploid ከፍተኛ ጥራት ያለው ጂኖም ዘግቧል። ሙሉ በሙሉ ቅደም ተከተል ያለው ሰው ሰራሽ አሎፖሊፕሎይድ።የጂኖም ስብስብ የ"PacBio+BioNano+Hi-C+Illumina" ተከታታይ የስራ ሂደትን ተተግብሯል፣የጂኖም መጠን 530.8Mb እና contig N50 = 6.5Mb አስከትሏል።ንባብ ለ19 pseudochromosomes እና subgenoms ተመድቧል።ውጤቶቹ እንደሚያመለክቱት ከጂኖም ማባዛት ይልቅ ማዳቀል በሁለቱም በኑክሌር እና በሲፒ ጂኖም ውስጥ አብዛኛዎቹን የጂኖም ለውጦችን ያስከትላል።ይህ ቋሚ heterozygosity C. × hytivus ተጨማሪ ውጥረት መላመድ ጋር ያቀርባል መሆኑን ጠቁሟል.ውጤቶቹ በእፅዋት ፖሊፕሎይድ ዝግመተ ለውጥ ላይ አዳዲስ ግንዛቤዎችን ይሰጣሉ እና ለወደፊቱ ሰብሎች የመራቢያ ዘዴን ይሰጣሉ።
4.Comparative Genome ይተነትናል ትራንስፖሶን መካከለኛ ጂኖም ማስፋፊያ እና በጥጥ ውስጥ የ3D ጂኖሚክ መታጠፍን የዝግመተ ለውጥ አርክቴክቸር
የትብብር ተቋም፡ ሁአዝሆንግ የግብርና ዩኒቨርሲቲ
ጆርናል: ሞለኪውላር ባዮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ
ተጽዕኖ ምክንያት: 16.242
ይህ ፕሮጀክት ናኖፖሬ ሴኪውሲንግን ተጠቅሞ የሶስት የጥጥ ዝርያዎችን ጂኖም ለመገጣጠም ማለትም Gossypium rotundifolium (K2, ጂኖም መጠን = 2.44Gb, contigN50 = 5.33Mb), G. arboreum (A2, ጂኖም መጠን = 1.62Gb, contigN.50) G. raimondii (D5, ጂኖም መጠን = 0.75Gb, contigN50 = 17.04 Gb).ከ99% በላይ የሚሆኑት ከሦስቱም ጂኖም የተሰበሰቡት በ Hi-C በኩል ነው።የ BUSCO ትንተና ውጤቶች በቅደም ተከተል 92.5%, 93.9% እና 95.4% ናቸው.እነዚህ ሁሉ ቁጥሮች ሦስቱ የመሰብሰቢያ ጂኖም ማጣቀሻ-ደረጃ መሆናቸውን ያመለክታሉ።የንፅፅር ጂኖም ትንታኔዎች የዘር-ተኮር ቲኢ ማጉላት ለትልቅ የጂኖም መጠን ልዩነት አስተዋፅዖ አድርጓል።ይህ ጥናት በእጽዋት ውስጥ ከፍተኛ-ደረጃ ያለው ክሮማቲን መዋቅር በዝግመተ ለውጥ ውስጥ transposon-mediated ጂኖም መስፋፋት ያለውን ሚና ላይ ብርሃን ይፈጥራል።
5. የክሮሞሶም መጠን መሰብሰብ እና የባዮማስ ሰብል ትንተና Miscanthus lutarioriparius ጂኖም
የተቀናጀ ተቋም፡ CAS በሞለኪውላር እፅዋት ሳይንስ የልህቀት ማዕከል
ጆርናል: ተፈጥሮ ግንኙነቶች
ተጽዕኖ ምክንያት: 14.912
ይህ ፕሮጀክት የኦክስፎርድ ናኖፖር ቅደም ተከተል እና የ Hi-C ቴክኖሎጂዎችን በማጣመር የ Miscanthus lutarioriparius ጂኖም የክሮሞሶም መጠን መገጣጠምን ሪፖርት አድርጓል።የ 2.07Gb ስብሰባ 96.64% የጂኖም ይሸፍናል, contig N50 ከ 1.71 Mb.ከጠቅላላው ተከታታይ 94.30% ያህሉ ወደ 19 pseudochromosomes ተጣብቀዋል።ከ BAC ቅደም ተከተል፣ የLAI ግምገማ፣ የ BUSCO ግምገማ፣ ከኤንጂኤስ መረጃ ጋር እንደገና መሰብሰብ፣ የጽሑፍ ግልባጭ መረጃን እንደገና በማሰባሰብ፣ ጂኖም እንደ ከፍተኛ ጥራት እና ቀጣይነት ተገምግሟል።የ M. Lutarioriparius Alloteraploid አመጣጥ ሴንትሮሜሪክ የሳተላይት ድግግሞሾችን በመጠቀም ይረጋገጣል።የ M. Lutarioriparius የታንደም የተባዙ ጂኖች ከውጥረት ምላሽ ጋር በተያያዙ ጉዳዮች ብቻ ሳይሆን የሕዋስ ግድግዳ ባዮሲንተሲስ ተግባራዊ የበለፀጉ ናቸው።የጂን ብዜቶች ምናልባት በC4 ፎቶሲንተሲስ ውስጥ ሚና ይጫወታሉ እና በዝቅተኛ የሙቀት መጠን Miscanthus C4 ፎቶሲንተሲስ አስተዋጽኦ ያደርጋሉ።ጥናቱ ለብዙ አመታት እፅዋትን ለማጥናት ጠቃሚ ማጣቀሻ ሰጥቷል.
6.A ክሮሞሶም-ደረጃ Camptotheca acuminata ጂኖም ስብሰባ የካምፕቶቴሲን ባዮሲንተሲስ የዝግመተ ለውጥ አመጣጥ ግንዛቤዎችን ይሰጣል
የትብብር ተቋም፡ የሲቹዋን ዩኒቨርሲቲ
ጆርናል: ተፈጥሮ ግንኙነቶች
ተጽዕኖ ምክንያት: 14.912
ይህ ፕሮጀክት የጂኖም መጠን 414.95Mb እና contingN50 1.47Mb ያለው ከፍተኛ ጥራት ያለው የክሮሞሶም-ደረጃ C. acuminata ጂኖም ስብሰባ ሪፖርት አድርጓል።C. acuminata ራሱን የቻለ ሙሉ ጂኖም ብዜት እንዳጋጠመው እና ከሱ የተገኙ በርካታ ጂኖች ከካምፕቶቴሲን ባዮሲንተሲስ ጋር የተያያዙ መሆናቸውን ደርሰንበታል።የLAMT ጂን ተግባራዊ ልዩነት እና የሁለት SLAS ጂኖች አወንታዊ ዝግመተ ለውጥ፣ ስለዚህ ሁለቱም በC. acuminata ውስጥ ለካምፕቶቴሲን ባዮሲንተሲስ ትልቅ አስተዋፅዖ አድርገዋል።ውጤቶቹ በሁለተኛ ደረጃ ሜታቦላይት የዝግመተ ለውጥ አመጣጥ ላይ የጄኔቲክ ለውጦችን ለመለየት ከፍተኛ ጥራት ያለው የጂኖም ስብስብ አስፈላጊነት አፅንዖት ሰጥተዋል.
7.Allele-defined ጂኖም በካሳቫ ዝግመተ ለውጥ ወቅት የቢያሌሊክ ልዩነትን ያሳያል
የትብብር ተቋም፡ የቻይና የትሮፒካል እርሻ ሳይንስ አካዳሚ
ጆርናል: ሞለኪውላር ተክል
ተጽዕኖ ምክንያት: 13.162
ይህ ፕሮጀክት የፓሲፊክ ባዮሳይንስ (PacBio) ተከታታይ መድረክን በመጠቀም የካሳቫ ዋቢ ጂኖም ከ contigN50 1.1Mb ጋር ሰብስቧል።በ BUSCO ፣ LAI ኢንዴክስ እና ከፍተኛ-ጥቅጥቅ ያለ የጄኔቲክ ካርታ ከተገመገመ በኋላ ፣የተገጣጠመው ጂኖም እንደ ማጣቀሻ-ደረጃ ይረጋገጣል።ተደጋጋሚ የሆኑት ክልሎች ተለይተዋል እና ኮንቲግዎች በ 18 pseudochromosomes ላይ Hi-C አገናኞችን በመጠቀም ተጣብቀዋል።ይህ ከፍተኛ ጥራት ያለው እና በሌለ-የተለየ የካሳቫ ማመሳከሪያ ጂኖም በግብረ-ሰዶማውያን ክሮሞሶም ላይ የተለያዩ ሁለት-አልለሎችን በመለየት ጠቃሚ ነው፣ ይህም የ bi-allele እና የዝግመተ ለውጥ አንቀሳቃሽ ኃይሎቻቸውን ልዩነት እና አገላለጽ ለመዳሰስ ያስችላል።በካሳቫ እና ሌሎች በጣም ተቃራኒ የሆኑ ሰብሎችን የመራቢያ ዘዴዎችን አመቻችቷል።
የፓውሎኒያ ፈጣን እድገት እና የፓውሎውኒያ የጠንቋዮች መጥረጊያ አፈጣጠር 8.Genomic ግንዛቤዎች
የትብብር ተቋም፡ ሄናን የእርሻ ዩኒቨርሲቲ
ጆርናል: ሞለኪውላር ተክል
ተጽዕኖ ምክንያት: 13.162
ይህ ፕሮጀክት 511.6 ሜባ መጠን ያለው የፓውሎውኒያ ፎርቱኔይ ከፍተኛ ጥራት ያለው የኑክሌር ጂኖም ሰበሰበ።ከፍ ያለ የፎቶሲንተቲክ ቅልጥፍና የሚገኘው C3 ፎቶሲንተሲስ እና የክራሱላሴያን አሲድ ሜታቦሊዝም መንገድን በማዋሃድ ነው፣ይህም ለፓውሎኒያ ዛፎች እጅግ ፈጣን የእድገት ልማድ አስተዋፅዖ አድርጓል።ተጨማሪ የ PaWB phytoplasma ጂኖም ቅደም ተከተል ከተግባራዊ ትንታኔዎች ጋር ተዳምሮ ውጤቱ PaWB-SAP54 ከ Paulownia PfSPLa ጋር በቀጥታ እንደሚገናኝ ያመላክታል፣ ይህ ደግሞ የPfSPLaን በየቦታው መካከለኛ መንገድ በማበላሸት ወደ ጠንቋዮች መጥረጊያ ይመራል።መረጃው ስለ ፓውሎኒያስ ባዮሎጂ እና ስለ PaWB ምስረታ የቁጥጥር ዘዴ ጉልህ ግንዛቤዎችን ሰጥቷል።
የእንስሳት ጂኖም - ስለ ዝርያ ዝግመተ ለውጥ ጥልቅ ግንዛቤዎች
1. የ Nautilus pompilius ጂኖም የዓይን ዝግመተ ለውጥን እና ባዮሚኔራላይዜሽን ያበራል
የተቀናጀ ተቋም፡ የደቡብ ቻይና የባህር ውቅያኖስ ተቋም፣ CAS
ጆርናል: የተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ
ተጽዕኖ ምክንያት: 15.462
ይህ ፕሮጀክት ለ Nautilus pompilius የተሟላ ጂኖም አቅርቧል።ከተከታታይ ሴፋሎፖዶች መካከል አነስተኛው ጂኖም አለው፣ እሱም 730.58Mb ከ contigN50 = 1.1Mb ጋር ነው።የ BUSCO ግምገማ ውጤት 91.31 በመቶ ነው።ከትራንስክሪፕት, ፕሮቲኖም, የጂን ቤተሰብ እና ፋይሎጄኔቲክ ትንታኔ ጋር ተዳምሮ ይህ ጂኖም እንደ ፒንሆል አይን እና ባዮሚንራላይዜሽን ባሉ የሴፋሎፖድ ፈጠራዎች ላይ መሠረታዊ ማጣቀሻ ሰጥቷል።ጥናቱ እንደሚያመለክተው የሆክስ ጂን ክላስተር ሙሉነት ላይ የሚደርሰው ጉዳት የሞለስኮች ሼል ከመጥፋቱ ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።በአስፈላጊ ሁኔታ፣ የጂን መጥፋት፣ ገለልተኛ ኮንትራት እና የተወሰኑ የጂን ቤተሰቦች መስፋፋት እና ተያያዥነት ያላቸው የቁጥጥር ኔትወርኮችን ጨምሮ በርካታ የጂኖሚክ ፈጠራዎች የናቲለስ ፒንሆል አይን ዝግመተ ለውጥን ሊቀርጹ ይችላሉ።የናቲለስ ጂኖም የዝግመተ ለውጥ ሁኔታዎችን እና ነባሩን ሴፋሎፖድስ የሚቀርፁትን ጂኖሚክ ፈጠራዎችን መልሶ ለመገንባት ጠቃሚ ግብአት ነበር።
2.የሴአድራጎን ጂኖም ትንተና ስለ ፍኖታይፕ እና ስለ ጾታ መወሰኛ ቦታ ግንዛቤዎችን ይሰጣል
የተቀናጀ ተቋም፡ የደቡብ ቻይና የባህር ውቅያኖስ ተቋም፣ CAS
ጆርናል: የሳይንስ እድገቶች
ተጽዕኖ ምክንያት: 14.132
ይህ ፕሮጀክት ደ ኖቮ-የተከታታይ ወንድ እና ሴት ጂኖም የጋራ ሴድራጎን (ፊሊሎፕተሪክስ ታኒዮላተስ) እና በቅርብ ተዛማጅ ዝርያዎቹ፣ አሊጋተር ፒፔፊሽ (Syngnathoides biculeatus)።የ Phyllopteryx taeniolatus ጂኖም መጠን ~659 ሜባ(♂) እና ~663 ሜባ(♀)፣ contigN50 10.0Mb እና 12.1mb ነው።የፊሎፕተሪክስ ታኒዮላተስ ጂኖም መጠን 637 ሜባ (♂) እና ~ 648 ሜባ (♀)፣ contigN50 የ18.0Mb እና 21.0Mb ነው።በፋይሎጄኔቲክ ትንታኔ፣የጋራው የባህር ድራጎን እና አልጌተር ፒፔፊሽ የሲንጋታቲና እህት ታክሲ ናቸው፣ እና ከ27.3 MA በፊት ተለያዩ።ከዝግመተ ለውጥ አዲስነት፣ ቅጠሉ መሰል አባሪዎች የተገለበጡ መግለጫዎች እንደሚያሳዩት በተለምዶ በፊን ልማት ውስጥ የሚሳተፉ የጂኖች ስብስብ በአንድ ላይ እንደተመረጡ እና እንዲሁም ለቲሹ ጥገና እና የበሽታ መከላከያ ጂኖች የጽሑፍ ስክሪፕቶችን ማበልጸግ ነው።በተለመደው ሴድራጎን እና አሊጋተር ፒፔፊሽ የሚጋራ ወንድ-ተኮር የሆነ amhr2y ዘረ-መል (ሴራጎን) የሚፈጥር ወሲብ-የሚወስን ቦታ ተለይቷል።ይህ ፕሮጀክት የመላመድ ዝግመተ ለውጥ ጥናቶች ወሳኝ ማስረጃዎችን አቅርቧል።
የልጥፍ ጊዜ፡ ሴፕቴምበር-19-2022