ጂኖም ኢቮሉሽን
የንጽጽር ጂኖም ትንታኔዎች በጥጥ ውስጥ በትራንስፖሶን መካከለኛ የሆነ ጂኖም መስፋፋትን እና የ3D ጂኖም መታጠፍን ያደምቃል።
የናኖፖር ቅደም ተከተል |ሰላም-ሲ |PacBio ቅደም ተከተል |ኢሉሚና |አር ኤን ኤ-ተከታታይ |3 ዲ ጂኖም አርክቴክቸር |ትራንስፖሰን |የንጽጽር ጂኖሚክስ
በዚህ ጥናት ውስጥ, ባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች በናኖፖሬ ቅደም ተከተል, በ Hi-C እና በተዛማጅ ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔ ላይ ቴክኒካዊ ድጋፍ ሰጥተዋል.
ረቂቅ
ሊተላለፍ የሚችል ኤለመንት (TE) ማጉላት የጂኖም መጠን መስፋፋትን እና ዝግመተ ለውጥን የሚያበረታታ እንደ አንቀሳቃሽ ኃይል ታውቋል፣ ነገር ግን 3D ጂኖሚክ አርክቴክቸርን የመቅረጽ ውጤቶቹ በእጽዋት ውስጥ ብዙም የማይታወቁ ናቸው።እዚህ፣ በጂኖም መጠን ሦስት እጥፍ የሚደርሱ ለሶስት የጥጥ ዝርያዎች የማጣቀሻ ደረጃ የጂኖም ስብሰባዎችን ሪፖርት እናደርጋለን።Gossypium rotundifolium(K2)፣G. አርቦሬየም(A2) እናG. raimondii(D5)፣ ኦክስፎርድ ናኖፖር ቴክኖሎጂዎችን በመጠቀም።የንጽጽር ጂኖም ትንታኔዎች ለትልቅ የጂኖም መጠን ልዩነት (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 ሜባ) የሚያበረክቱትን የዘር-ተኮር ቲኢ ማጉላት ዝርዝሮችን ይመዘግባሉ እና በአንፃራዊነት የተጠበቁ የጂን ይዘቶችን እና በጂኖም መካከል ያለውን ትስስር ያመለክታሉ።በግምት 17% የሚሆኑት የሳይንቲኒክ ጂኖች በአክቲቭ ("A") እና በቦዘኑ ("ቢ") ክፍሎች መካከል የክሮማቲን ሁኔታ ለውጥ እንደሚያሳዩ እና የቲኢ ማጉላት በጂን ክልሎች (~ 7,000 ጂኖች) ውስጥ ካለው የ A ክፍል መጠን መጨመር ጋር የተያያዘ መሆኑን ደርሰንበታል። ) ከ D5 አንጻር በ K2 እና A2.ከሶስቱ ጂኖም መካከል 42% ብቻ ከቶፖሎጂካል ተያያዥነት ያለው ጎራ (TAD) ድንበሮች ተጠብቀዋል።የእኛ መረጃ በዘር-ተኮር የቲኤዲ ድንበሮች መፈጠርን ተከትሎ የቲኢዎች ማጉላትን ያካትታል።ይህ ጥናት በእጽዋት ውስጥ ከፍተኛ-ደረጃ ያለው ክሮማቲን መዋቅር በዝግመተ ለውጥ ውስጥ transposon-mediated ጂኖም መስፋፋት ያለውን ሚና ላይ ብርሃን ይፈጥራል።
የጂኖም ስብሰባ ቁልፍ ስታቲስቲክስ
ምስልየጂኖም ስብሰባ እና የ G. rotundifolium (K2) ባህሪ መግለጫ
ዜና እና ዋና ዋና ዜናዎች አዳዲስ ስኬታማ ጉዳዮችን ከባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች ጋር ለመጋራት፣ አዳዲስ ሳይንሳዊ ግኝቶችን እና በጥናቱ ወቅት የተተገበሩ ታዋቂ ቴክኒኮችን ለመያዝ ያለመ ነው።
የልጥፍ ጊዜ: ጥር-05-2022