ምርቶች

ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል -ኤን.ኤስ

Metagenome የሚያመለክተው እንደ የአካባቢ ሜታጂኖም፣ የሰው ሜታጂኖም፣ ወዘተ ያሉ የተዋሃዱ ህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው።ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ነው ፣ ይህም ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣ የስነ ሕዝብ አወቃቀር ፣ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ያለውን ትስስር ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።

መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ

አግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

● ለጥቃቅን ተህዋሲያን ማህበረሰባዊ መገለጫ ከመገለል እና ከእርሻ-ነጻ

● በአካባቢ ናሙናዎች ውስጥ ዝቅተኛ የተትረፈረፈ ዝርያዎችን በመለየት ከፍተኛ ጥራት

● የ "ሜታ-" ሀሳብ ሁሉንም ባዮሎጂያዊ ባህሪያት በተግባራዊ ደረጃ, በዘር ደረጃ እና በጂን ደረጃ ያዋህዳል, ይህም ከእውነታው ጋር የሚቀራረብ ተለዋዋጭ እይታን ያሳያል.

● BMK በተለያዩ የናሙና ዓይነቶች ከ10,000 በላይ ናሙናዎች በማዘጋጀት ሰፊ ልምድ ያከማቻል።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

መድረክ	ቅደም ተከተል	የሚመከር ውሂብ	የመመለሻ ጊዜ
ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ	ፒኢ150	6 ግ/10 ግ/20 ግ	45 የስራ ቀናት

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

● የጥሬ መረጃ ጥራት ቁጥጥር

● Metagenome ስብሰባ

● የማይታደስ የጂን ስብስብ እና ማብራሪያ

● የዝርያ ልዩነት ትንተና

● የጄኔቲክ ተግባር ልዩነት ትንተና

● የቡድን ትንተና

● በሙከራ ሁኔታዎች ላይ የማህበሩ ትንተና

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

ለየዲኤንኤ ውህዶች:

የናሙና ዓይነት	መጠን	ትኩረት መስጠት	ንጽህና
የዲኤንኤ ውህዶች	： 30 ንግ	1 ng/μl	OD260/280= 1.6-2.5

ለአካባቢያዊ ናሙናዎች፡-

የናሙና ዓይነት	የሚመከር የናሙና አሰራር
አፈር	የናሙና መጠን፡ በግምት።5 ግ;የተረፈውን የደረቀ ንጥረ ነገር ከምድር ላይ ማስወገድ ያስፈልጋል;ትላልቅ ቁርጥራጮችን መፍጨት እና በ 2 ሚሜ ማጣሪያ ውስጥ ማለፍ;የ Aliquot ናሙናዎች በማይጸዳ EP-tube ወይም cyrotube ውስጥ ለማስያዝ።
ሰገራ	የናሙና መጠን፡ በግምት።5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ናሙናዎችን ይሰብስቡ እና ይልቀቁ።
የአንጀት ይዘት	ናሙናዎች በ aseptic ሁኔታ ውስጥ መደረግ አለባቸው.የተሰበሰበውን ቲሹ በፒቢኤስ ያጠቡ;ፒቢኤስን ሴንትሪፉግ ያድርጉ እና በ EP-tubes ውስጥ ያለውን ተንሳፋፊ ይሰብስቡ።
ዝቃጭ	የናሙና መጠን፡ በግምት።5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ዝቃጭ ናሙና ይሰብስቡ እና ይላኩ።
የውሃ አካል	እንደ የቧንቧ ውሃ፣ የጉድጓድ ውሃ፣ ወዘተ የመሳሰሉ ውስን መጠን ያለው ረቂቅ ተሕዋስያን ላለው ናሙና ቢያንስ 1 ሊትር ውሃ ይሰብስቡ እና በ 0.22 μm ማጣሪያ ውስጥ በማለፍ በገለባው ላይ ረቂቅ ተሕዋስያንን ለማበልጸግ።ሽፋኑን በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያከማቹ።
ቆዳ	የቆዳውን ገጽታ በማይጸዳ ጥጥ ወይም በቀዶ ጥገና ምላጭ በጥንቃቄ ይከርክሙት እና በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያስቀምጡት።

የሚመከር ናሙና ማድረስ

ናሙናዎቹን በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ ለ 3-4 ሰአታት ያቀዘቅዙ እና በፈሳሽ ናይትሮጅን ወይም -80 ዲግሪ ለረጅም ጊዜ በተያዘ ቦታ ውስጥ ያከማቹ።ከደረቅ በረዶ ጋር ናሙና መላክ ያስፈልጋል.

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ናሙና መላኪያ

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ቀዳሚ፡ ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል-ናኖፖር

ቀጣይ፡- Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ቺአይፒ-ሴክ)

1.ሂስቶግራም: ዝርያዎች ስርጭት

2.Functional ጂኖች ለ KEGG ተፈጭቶ መንገዶች የተገለጹ

3.የሙቀት ካርታ: በተመጣጣኝ የጂን ብዛት ላይ የተመሰረተ ልዩነት ተግባራትCARD አንቲባዮቲክ የመቋቋም ጂኖች 4.Circos

BMK መያዣ

በአፈር-ማንግሩቭ ሥር ቀጣይነት ላይ የአንቲባዮቲክ መከላከያ ጂኖች እና የባክቴሪያ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን መስፋፋት

የታተመአደገኛ ቁሶች ጆርናል፣ 2021

የቅደም ተከተል ስልት፡

ቁሳቁስ፡-የዲ ኤን ኤ ከአራት ቁርጥራጮች የማንግሩቭ ሥር ተያያዥ ናሙናዎች፡ ያልተተከለ አፈር፣ ራይዞስፌር፣ ኤፒስፌር እና የ endosphere ክፍሎች።
መድረክ፡ ኢሉሚና ሂሴክ 2500
ዒላማዎች: Metagenome
16S rRNA ጂን V3-V4 ክልል

ቁልፍ ውጤቶች

የሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል እና የሜታባርኮዲንግ ፕሮፋይል በአፈር-ሥር ቀጣይ የማንግሩቭ ችግኞች ላይ የአንቲባዮቲክ ተከላካይ ጂኖችን (ARGs) ከአፈር ወደ ተክሎች መሰራጨቱን ለማጥናት ተዘጋጅቷል.የሜታጂኖሚክ መረጃ እንደሚያሳየው 91.4% አንቲባዮቲክ የመቋቋም ጂኖች በተለምዶ ከላይ በተጠቀሱት በአራቱም የአፈር ክፍሎች ውስጥ ተለይተው ይታወቃሉ ይህም ቀጣይነት ያለው ፋሽን አሳይቷል.16S rRNA amplicon sequencing 29,285 ቅደም ተከተሎችን ፈጥሯል፣ ይህም 346 ዝርያዎችን ይወክላል።በአምፕሊኮን ቅደም ተከተል ከተዘረዘሩት ዝርያዎች ጋር በማጣመር ይህ ስርጭቱ ከስር-ተያያዥ ማይክሮባዮታ ነፃ ሆኖ ተገኝቷል ነገር ግን በጄኔቲክ ንጥረ ነገሮች ሞባይል ሊመቻች ይችላል።ይህ ጥናት የ ARGs እና በሽታ አምጪ ተህዋሲያን ከአፈር ወደ ተክሎች የሚፈሱትን እርስ በርስ ተያያዥነት ባለው የአፈር-ሥሩ ቀጣይነት ነው.

ማጣቀሻ

ዋንግ፣ ሲ.፣ ሁ፣ አር.፣ ጠንካራ፣ ፒጄ፣ ዙዋንግ፣ ደብሊው፣ እና ሹ፣ ኤል.(2020)በአፈር-ማንግሩቭ ሥር ቀጣይነት ላይ የአንቲባዮቲክ መከላከያ ጂኖች እና የባክቴሪያ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን መስፋፋት.አደገኛ እቃዎች ጆርናል, 408፣ 124985 እ.ኤ.አ.