BMKCloud Log in
ሰንደቅ-03

ምርቶች

የዲ ኤን ኤ / አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል -PacBio Sequencer

የዲኤንኤ/አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል -PacBio Sequencer ተለይቶ የቀረበ ምስል
  • የዲ ኤን ኤ / አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል -PacBio Sequencer
  • የዲ ኤን ኤ / አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል -PacBio Sequencer
  • የዲ ኤን ኤ / አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል -PacBio Sequencer

PacBio sequencing መድረክ ረጅም የተነበበ ተከታታይ መድረክ ነው፣ እሱም የሶስተኛ-ትውልድ ቅደም ተከተል (TGS) ቴክኖሎጂዎች በመባልም ይታወቃል።ዋናው ቴክኖሎጂ፣ ነጠላ-ሞለኪውል ሪል-ታይም(SMRT)፣ የንባብ ማመንጨትን በአስር ኪሎ-ቤዝ ርዝመት ያበረታታል።በ«ቅደም ተከተል-በ-ሲንተሲስ» መሠረት፣ ነጠላ ኑክሊዮታይድ መፍታት የሚገኘው በዜሮ ሞድ ሞድ ጋይድ (ZMW) ሲሆን ይህም ከታች (የሞለኪውል ውህደት ቦታ) የተወሰነ መጠን ብቻ ነው።በተጨማሪም፣ የSMRT ቅደም ተከተል በNGS ስርዓት ውስጥ በቅደም ተከተል-ተኮር አድልኦን ያስወግዳል፣በዚህም አብዛኛው PCR የማጉላት እርምጃዎች በቤተመፃህፍት ግንባታ ሂደት ውስጥ አያስፈልጉም።

 

መድረክ፡ ተከታይ II፣ ሪቪዮ


የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

ዋና መለያ ጸባያት

በPacBio ተከታታዮች ላይ ሁለት ተከታታይ ሁነታዎች፡ ቀጣይነት ያለው ረጅም ንባብ (CLR) እና ክብ ስምምነት ማንበብ (CCS)

ቅደም ተከተል ሁነታ የቤተ መፃህፍት መጠን የንድፈ ሐሳብ ውሂብምርት (በሴል) ነጠላ-ቤዝትክክለኛነት መተግበሪያዎች
CLR 20 ኪባ፣ 30 ኪባ፣ ወዘተ. ከ 80 ጊባ እስከ 130 ጊባ በግምት.85% ደ ኖቮ፣ የኤስ.ቪ ጥሪ ፣ ወዘተ.
ሲ.ሲ.ኤስ 15-20 ኪ.ቢ

ከ14 እስከ 40 ጊባ/ሴል (ተከታታይ II)

ከ70 እስከ 110 ጊባ/ሴል (ሪቪዮ)

እንደ ናሙናዎች ይወሰናል

 በግምት.99% ደ ኖቮ፣ SNP/Indel/SV ጥሪ፣ ኢሶ-ሴቅ፣

የ Revio እና Sequel II አፈጻጸም እና ባህሪያት ማወዳደር

ውሎች

ተከታታይ II ስርዓት

Revio ስርዓት

ጨምር

ከፍተኛ እፍጋት

8 ሚሊዮን ZMWs

25 ሚሊዮን ZMW

3x

ገለልተኛ ደረጃዎች

1

4

4x

አጭር የሩጫ ጊዜዎች

30 ሰዓታት

24 ሰዓታት

1.25x

30X HiFi የሰው ጂኖም / ዓመት

88

1,300

15x በአጠቃላይ

የአገልግሎት ጥቅሞች

● ከ 8 ዓመታት በላይ በተለያዩ ዝርያዎች በሺዎች የሚቆጠሩ የተዘጉ ፕሮጄክቶች በ PacBio ቅደም ተከተል መድረክ ላይ ልምድ።

● ከቅርብ ጊዜው የPacBio Sequencing መድረኮች ጋር ሙሉ በሙሉ የታጠቁ፣ Revio በቂ የቅደም ተከተል ፍሰትን ለማረጋገጥ።

● ፈጣን የማዞሪያ ጊዜ፣ ከፍተኛ የውሂብ ምርት እና የበለጠ ትክክለኛ ውሂብ።

● በመቶዎች በሚቆጠሩ ከፍተኛ ተጽዕኖ በPacBio ላይ የተመሰረቱ ህትመቶችን አበርክቷል።

ናሙና መስፈርቶች


የናሙና ዓይነት መጠን ማጎሪያ (Qubit®) ድምጽ ንጽህና ሌሎች
ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ በመረጃ መስፈርቶች ላይ በመመስረት ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
ከፍተኛውን 260 nm አጽዳምንም ብክለት የለም		 ትኩረትን በኩቢት እና በኩቢት / ናኖፖሬ = 0.8-2.5 መለካት ያስፈልጋል.
ጠቅላላ አር ኤን ኤ ≥1.2μግ ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280 = 1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;ምንም ብክለት የለም

የ RIN ዋጋ ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

የአገልግሎት የስራ ፍሰት

ናሙና ዝግጅት

ናሙና ዝግጅት

የቤተ መፃህፍት ዝግጅት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

የውሂብ ትንተና

ናሙና QC

የፕሮጀክት አቅርቦት

  • ቀዳሚ፡
  • ቀጣይ፡-

    • 1.በቤት ውስጥ የውሂብ ምርት

    ከ63 ሲሲኤስ ሴሎች የመነጨ መረጃ (ከ26 ዝርያዎች)

    ዳታ-PacBio-CCS-15 ኪባ አማካኝ ከፍተኛ ደቂቃ ሚዲያን
    ምርት - ንዑስ አንባቢዎች (ጂቢ) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Yiled - CCS(ጂቢ) 25.93 38.59 10.86 25.43
    ፖሊሜሬዝ N50 145,651 175,430 118,118 144,689
    N50 ንዑስ አንባቢዎች 17,509 23,924 12,485 17,584
    CCS N50 14,490 19,034 9,876 14,747
    አማካይ ርዝመት - ፖሊሜሬዝ 67,995 89,379 49,664 66,433
    አማካይ ርዝመት-ንዑሳን ክፍሎች 15,866 21,036 11,657 16,012
    አማካይ ርዝመት-CCS 14,489 19,074 8,575 14,655

    ከ16 CLR ሴሎች የመነጨ መረጃ (ከ76 ዝርያዎች)

    DATA-PacBio-CLR-30Kb አማካኝ ከፍተኛ ደቂቃ ሚዲያን
    ምርት - ንዑስ አንባቢዎች (ጂቢ) 142.20 291.40 50.55 142.49
    ፖሊሜሬዝ N50 39,456 121,191 15,389 35,231
    N50 ንዑስ አንባቢዎች 28,490 41,012 14,430 29,063
    አማካይ ርዝመት - ፖሊሜሬዝ 22,063 48,886 8,747 21,555
    አማካይ ርዝመት-ንዑሳን ክፍሎች 17,720 27,225 8,293 17,779

    2.ዳታ QC - ማሳያበውሂብ ምርት ላይ ስታቲስቲክስ

    ናሙና

    ccs ቁጥር ያነባል።

    ጠቅላላ ሲሲሲ ቤዝ (ቢፒ)

    ሲሲሲ N50 (ቢፒ) ያነባል።

    ሲሲሲ አማካይ ርዝመት (ቢፒ)

    ccs ረጅሙ የተነበበ (ቢፒ)

    ንዑስ ንባብ ቤዝ (ቢፒ)

    ሲሲኤስ መጠን(%)

    PB_BMKxxx

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    ጥቅስ ያግኙ

    መልእክትህን እዚህ ጻፍ እና ላኩልን።

    ምርትምድቦች

    መልእክትህን ላክልን፡

    ለመፈለግ አስገባን ወይም ESCን ለመዝጋት ይንኩ።